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普通小麥POD活性全基因組關(guān)聯(lián)分析及功能標(biāo)記開發(fā)

發(fā)布時(shí)間:2022-01-14 11:54
  小麥?zhǔn)鞘澜缟现饕募Z食作物之一,面粉顏色是衡量小麥品質(zhì)的重要指標(biāo)。小麥籽粒中過氧化物酶(Peroxidase,POD)活性是面粉及面制品在加工,儲(chǔ)藏過程中發(fā)生褐變和被漂白的重要原因。因此,探究POD基因的特性已成為小麥品質(zhì)改良的分子標(biāo)記輔助育種的重要目標(biāo)。本研究以黃淮麥區(qū)材料151份與北部冬麥區(qū)82份品種為材料,利用90K iSelect芯片對(duì)小麥品種籽粒POD活性基因進(jìn)行GWAS;并利用同源克隆與PCR驗(yàn)證的方法克隆小麥7D染色體的POD活性基因,通過生物信息學(xué)分析了解不同品種間的等位變異編碼蛋白的功能變化,根據(jù)等位變異之間的序列差異開發(fā)功能標(biāo)記。主要結(jié)果如下:1.在黃淮冬麥區(qū)與北部冬麥區(qū)中均檢測到20個(gè)與POD活性顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)(P<0.001),單個(gè)位點(diǎn)可解釋7.8-23.3%的表型變異。隨著優(yōu)異等位基因數(shù)量的增多,小麥籽粒POD活性越高。并且本研究發(fā)現(xiàn)了3個(gè)與POD活性有關(guān)的候選基因,分別編碼磷酸甘露糖變位酶(PMM-D1)、辣根過氧化物酶(PER40)和烷基氫過氧化物還原酶(F77531640)。2.TaPod-D1基因全長為1124 bp,等位變... 

【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:68 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

普通小麥POD活性全基因組關(guān)聯(lián)分析及功能標(biāo)記開發(fā)


黃淮麥區(qū)品種在4個(gè)環(huán)境下的POD活性分布圖

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16圖 2-2 北部冬麥區(qū)品種在 4 個(gè)環(huán)境下的 POD 活性分布圖。Figure 2-2 Distributions POD activity of Northern China Plain Winter Wheat Region注:2013BBV:2013 北京,2013SBY:2013 石家莊,2014BBV:2014 北京,2014SBY:2014 石家莊和 Average:4 個(gè)環(huán)境的平均值.Note: 2013BBV: 2013Beijing,2013SBY: 2013 Shijiazhuang,2014BBV: 2014 Beijing,2014SBY: 2014Shijiazhuangand Average: Average of the fourenvironments.

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圖 2-3 使用 deltak 值估計(jì)黃淮冬麥區(qū)(a)和北部冬麥區(qū)(b)品種亞群數(shù)Figure 2-3 Estimation of number of sub-populations (K) in Yellow & Huai Facultative Winter WheatRegion (a) and Northern China Plain Winter Wheat Region (b)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]高大平房倉倉頂遮陽網(wǎng)隔熱控溫儲(chǔ)糧技術(shù)應(yīng)用[J]. 宋鋒,陳衛(wèi)紅,彭凌,丁學(xué)軍,何艷平,袁軍.  糧食加工. 2015(02)
[3]栽培大豆農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位變異挖掘[J]. 楊勝先,牛遠(yuǎn),李夢(mèng),魏世平,劉曉芬,呂海燕,章元明.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(20)
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[5]外顯子組測序在人類疾病中的應(yīng)用[J]. 饒書權(quán),杜廷福,許琪.  遺傳. 2014(11)
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本文編號(hào):3588459

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