CRISPR/Cas9技術(shù)編輯水稻香味基因及靶向突變檢測(cè)方法的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-14 01:51
香稻因其宜人的香味而受到全世界的青睞。傳統(tǒng)的育種方式在一定范圍內(nèi)能夠提高水稻產(chǎn)量和米質(zhì),但是效果不夠顯著,且工作量大,工作周期長(zhǎng)。CRISPR/Cas編輯技術(shù)的發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用為分子育種開(kāi)辟了新的途徑。因編碼甜菜堿醛脫氫酶基因BADH2功能缺失后,可導(dǎo)致一個(gè)主要的香氣化合物2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)含量增多,使稻米產(chǎn)生香味。因此,本文利用CRISPR/Cas9靶向編輯技術(shù),針對(duì)BADH2第2外顯子和第7外顯子分別設(shè)計(jì)靶標(biāo)位點(diǎn)Badh2KO1和Badh2KO2,通過(guò)水稻遺傳轉(zhuǎn)化共獲得轉(zhuǎn)基因植株94株。通過(guò)對(duì)94株轉(zhuǎn)化植株的BADH2基因測(cè)序結(jié)果可知,Badh2KO1的突變植株為25株,突變率27%;Badh2KO2的突變植株為59株,突變率63%;野生型植株為10株。通過(guò)遺傳分離得到純合突變植株。Sanger測(cè)序證實(shí)這些突變植株中BADH2基因發(fā)生堿基缺失和插入,致使編碼蛋白的氨基酸序列均有不同程度的改變,且GC-MS技術(shù)檢測(cè)出這些突變植株中的2-AP含量明顯提高。這些結(jié)果表明,CRISPR/Cas9可以定向編輯水稻香味基因,使稻米具有香味。突變檢測(cè)是植物CRISPR/Cas9靶向突變研...
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)Ⅱ型的結(jié)構(gòu)
圖 2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)編輯基因的示意圖Fig. 2 Schematic diagram of CRISPR/Cas9 systemSPR/Cas9 編輯技術(shù)的應(yīng)用PR/Cas9 技術(shù)作為一種基因編輯工具已經(jīng)應(yīng)用在許多的的報(bào)道不斷出現(xiàn)。Fuchs 等[25]應(yīng)用 CRISPR/Cas9 技術(shù)蛋白 eS25 基因進(jìn)行了定點(diǎn)成功敲除,構(gòu)建了核糖體蛋Zheng 等[26]設(shè)計(jì)出雙 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),在人類細(xì)胞中基因,同時(shí)證實(shí)在提供同源性修復(fù)供體時(shí),靶位點(diǎn)基因im 等[27]將 CRISPR/Cas9 技術(shù)應(yīng)用在人類的纖維細(xì)胞和點(diǎn)突變率高達(dá) 79%。PR/Cas9 技術(shù)出現(xiàn)之后,從事農(nóng)業(yè)科研的工作人員把此中,CRISPR/Cas9 技術(shù)成功的編輯了小麥和水稻等作運(yùn)用到擬南芥基因編輯中,培育出了 ADH1 和 TT4 基種。Shan 等[30]利用 CRISPR/Cas9 技術(shù)成功敲掉了小粉病的新品種。該團(tuán)隊(duì)還定點(diǎn)突變了水稻 PDS 基因。
圖 2-3 T0 代植株 DNA 序列測(cè)序結(jié)果Fig.2-3 Sequencing results of DNAsequence of T0 generation plants對(duì)兩種部分轉(zhuǎn)化植株基因測(cè)序分析得到的基因型如上圖所示:Badh2KO突變型有 1bp 的插入和 1bp 的缺失, Badh2KO2 位點(diǎn)的突變型有 1bp 1bp、2bp、5bp、18bp 的缺失,這些不同的基因突變型很可能來(lái)自不能轉(zhuǎn)化。且兩個(gè)位點(diǎn)的突變都有純合基因型和雜合基因型。Badh2KO2 位比 Badh2KO1 位點(diǎn)的多 3 種,而且突變型有很大的區(qū)別。本實(shí)驗(yàn)的基因只有堿基插入和堿基的缺失兩種形式,不存在堿基的替換。就突變位置而多發(fā)生在 PAM 上游第 3 個(gè)堿基的位置。2 T1代植株突變遺傳對(duì)上述基因型突變的植株 KO1-1、KO1-3、KO1-4、KO2-1、KO2-3、KO2-5、KO2-6、KO2-7 的種子遺傳得到 T1代植株。對(duì)其 T1代植株的 DNA 測(cè)序分析我們可以看到,這 6 個(gè) T0代植株遺傳至 T1代時(shí),幾乎將自身變型基因遺傳到了 T1代。同時(shí)有些植株在 T1代又出現(xiàn)了新的突變型
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]從轉(zhuǎn)基因技術(shù)角度談轉(zhuǎn)基因植物的安全性[J]. 葉興國(guó),杜麗璞. 中國(guó)種業(yè). 2016(09)
[2]基因編輯作物的發(fā)展及檢測(cè)監(jiān)管現(xiàn)狀[J]. 付偉,魏霜,王晨光,杜智欣,朱鵬宇,劉中勇,吳希陽(yáng),朱水芳. 植物檢疫. 2016(03)
[3]CRISPR/Cas9系統(tǒng)——靶向基因組編輯的新策略[J]. 趙海衛(wèi),呂欣,尹文. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2015(03)
[4]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學(xué)報(bào). 2015(11)
[5]植物安全轉(zhuǎn)基因技術(shù)研究現(xiàn)狀與展望[J]. 王根平,杜文明,夏蘭琴. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[6]我國(guó)水稻育種技術(shù)發(fā)展歷程回顧[J]. 王月華,何虎,潘曉華. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(02)
[7]轉(zhuǎn)基因技術(shù)及其在水稻育種中的研究進(jìn)展[J]. 肖小君,王輝,齊澤民,黃作喜. 井岡山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(05)
[8]中國(guó)雜交水稻和水稻分子育種研究與發(fā)展概況[J]. 萬(wàn)昕,李海林,羅斌,徐慶國(guó). 作物研究. 2009(05)
[9]水稻香味基因的研究進(jìn)展[J]. 唐傲,邵高能,胡培松. 中國(guó)稻米. 2009(04)
[10]超級(jí)稻的分子設(shè)計(jì)育種[J]. 萬(wàn)建民. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(05)
本文編號(hào):3587570
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)Ⅱ型的結(jié)構(gòu)
圖 2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)編輯基因的示意圖Fig. 2 Schematic diagram of CRISPR/Cas9 systemSPR/Cas9 編輯技術(shù)的應(yīng)用PR/Cas9 技術(shù)作為一種基因編輯工具已經(jīng)應(yīng)用在許多的的報(bào)道不斷出現(xiàn)。Fuchs 等[25]應(yīng)用 CRISPR/Cas9 技術(shù)蛋白 eS25 基因進(jìn)行了定點(diǎn)成功敲除,構(gòu)建了核糖體蛋Zheng 等[26]設(shè)計(jì)出雙 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),在人類細(xì)胞中基因,同時(shí)證實(shí)在提供同源性修復(fù)供體時(shí),靶位點(diǎn)基因im 等[27]將 CRISPR/Cas9 技術(shù)應(yīng)用在人類的纖維細(xì)胞和點(diǎn)突變率高達(dá) 79%。PR/Cas9 技術(shù)出現(xiàn)之后,從事農(nóng)業(yè)科研的工作人員把此中,CRISPR/Cas9 技術(shù)成功的編輯了小麥和水稻等作運(yùn)用到擬南芥基因編輯中,培育出了 ADH1 和 TT4 基種。Shan 等[30]利用 CRISPR/Cas9 技術(shù)成功敲掉了小粉病的新品種。該團(tuán)隊(duì)還定點(diǎn)突變了水稻 PDS 基因。
圖 2-3 T0 代植株 DNA 序列測(cè)序結(jié)果Fig.2-3 Sequencing results of DNAsequence of T0 generation plants對(duì)兩種部分轉(zhuǎn)化植株基因測(cè)序分析得到的基因型如上圖所示:Badh2KO突變型有 1bp 的插入和 1bp 的缺失, Badh2KO2 位點(diǎn)的突變型有 1bp 1bp、2bp、5bp、18bp 的缺失,這些不同的基因突變型很可能來(lái)自不能轉(zhuǎn)化。且兩個(gè)位點(diǎn)的突變都有純合基因型和雜合基因型。Badh2KO2 位比 Badh2KO1 位點(diǎn)的多 3 種,而且突變型有很大的區(qū)別。本實(shí)驗(yàn)的基因只有堿基插入和堿基的缺失兩種形式,不存在堿基的替換。就突變位置而多發(fā)生在 PAM 上游第 3 個(gè)堿基的位置。2 T1代植株突變遺傳對(duì)上述基因型突變的植株 KO1-1、KO1-3、KO1-4、KO2-1、KO2-3、KO2-5、KO2-6、KO2-7 的種子遺傳得到 T1代植株。對(duì)其 T1代植株的 DNA 測(cè)序分析我們可以看到,這 6 個(gè) T0代植株遺傳至 T1代時(shí),幾乎將自身變型基因遺傳到了 T1代。同時(shí)有些植株在 T1代又出現(xiàn)了新的突變型
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[3]CRISPR/Cas9系統(tǒng)——靶向基因組編輯的新策略[J]. 趙海衛(wèi),呂欣,尹文. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2015(03)
[4]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學(xué)報(bào). 2015(11)
[5]植物安全轉(zhuǎn)基因技術(shù)研究現(xiàn)狀與展望[J]. 王根平,杜文明,夏蘭琴. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
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[8]中國(guó)雜交水稻和水稻分子育種研究與發(fā)展概況[J]. 萬(wàn)昕,李海林,羅斌,徐慶國(guó). 作物研究. 2009(05)
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[10]超級(jí)稻的分子設(shè)計(jì)育種[J]. 萬(wàn)建民. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(05)
本文編號(hào):3587570
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