CRISPR/Cas9技術編輯水稻香味基因及靶向突變檢測方法的研究
發(fā)布時間:2022-01-14 01:51
香稻因其宜人的香味而受到全世界的青睞。傳統(tǒng)的育種方式在一定范圍內(nèi)能夠提高水稻產(chǎn)量和米質(zhì),但是效果不夠顯著,且工作量大,工作周期長。CRISPR/Cas編輯技術的發(fā)現(xiàn)和應用為分子育種開辟了新的途徑。因編碼甜菜堿醛脫氫酶基因BADH2功能缺失后,可導致一個主要的香氣化合物2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)含量增多,使稻米產(chǎn)生香味。因此,本文利用CRISPR/Cas9靶向編輯技術,針對BADH2第2外顯子和第7外顯子分別設計靶標位點Badh2KO1和Badh2KO2,通過水稻遺傳轉(zhuǎn)化共獲得轉(zhuǎn)基因植株94株。通過對94株轉(zhuǎn)化植株的BADH2基因測序結果可知,Badh2KO1的突變植株為25株,突變率27%;Badh2KO2的突變植株為59株,突變率63%;野生型植株為10株。通過遺傳分離得到純合突變植株。Sanger測序證實這些突變植株中BADH2基因發(fā)生堿基缺失和插入,致使編碼蛋白的氨基酸序列均有不同程度的改變,且GC-MS技術檢測出這些突變植株中的2-AP含量明顯提高。這些結果表明,CRISPR/Cas9可以定向編輯水稻香味基因,使稻米具有香味。突變檢測是植物CRISPR/Cas9靶向突變研...
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)大學安徽省
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)Ⅱ型的結構
圖 2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)編輯基因的示意圖Fig. 2 Schematic diagram of CRISPR/Cas9 systemSPR/Cas9 編輯技術的應用PR/Cas9 技術作為一種基因編輯工具已經(jīng)應用在許多的的報道不斷出現(xiàn)。Fuchs 等[25]應用 CRISPR/Cas9 技術蛋白 eS25 基因進行了定點成功敲除,構建了核糖體蛋Zheng 等[26]設計出雙 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),在人類細胞中基因,同時證實在提供同源性修復供體時,靶位點基因im 等[27]將 CRISPR/Cas9 技術應用在人類的纖維細胞和點突變率高達 79%。PR/Cas9 技術出現(xiàn)之后,從事農(nóng)業(yè)科研的工作人員把此中,CRISPR/Cas9 技術成功的編輯了小麥和水稻等作運用到擬南芥基因編輯中,培育出了 ADH1 和 TT4 基種。Shan 等[30]利用 CRISPR/Cas9 技術成功敲掉了小粉病的新品種。該團隊還定點突變了水稻 PDS 基因。
圖 2-3 T0 代植株 DNA 序列測序結果Fig.2-3 Sequencing results of DNAsequence of T0 generation plants對兩種部分轉(zhuǎn)化植株基因測序分析得到的基因型如上圖所示:Badh2KO突變型有 1bp 的插入和 1bp 的缺失, Badh2KO2 位點的突變型有 1bp 1bp、2bp、5bp、18bp 的缺失,這些不同的基因突變型很可能來自不能轉(zhuǎn)化。且兩個位點的突變都有純合基因型和雜合基因型。Badh2KO2 位比 Badh2KO1 位點的多 3 種,而且突變型有很大的區(qū)別。本實驗的基因只有堿基插入和堿基的缺失兩種形式,不存在堿基的替換。就突變位置而多發(fā)生在 PAM 上游第 3 個堿基的位置。2 T1代植株突變遺傳對上述基因型突變的植株 KO1-1、KO1-3、KO1-4、KO2-1、KO2-3、KO2-5、KO2-6、KO2-7 的種子遺傳得到 T1代植株。對其 T1代植株的 DNA 測序分析我們可以看到,這 6 個 T0代植株遺傳至 T1代時,幾乎將自身變型基因遺傳到了 T1代。同時有些植株在 T1代又出現(xiàn)了新的突變型
【參考文獻】:
期刊論文
[1]從轉(zhuǎn)基因技術角度談轉(zhuǎn)基因植物的安全性[J]. 葉興國,杜麗璞. 中國種業(yè). 2016(09)
[2]基因編輯作物的發(fā)展及檢測監(jiān)管現(xiàn)狀[J]. 付偉,魏霜,王晨光,杜智欣,朱鵬宇,劉中勇,吳希陽,朱水芳. 植物檢疫. 2016(03)
[3]CRISPR/Cas9系統(tǒng)——靶向基因組編輯的新策略[J]. 趙海衛(wèi),呂欣,尹文. 中國病原生物學雜志. 2015(03)
[4]CRISPR/Cas9介導的基因編輯技術研究進展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學報. 2015(11)
[5]植物安全轉(zhuǎn)基因技術研究現(xiàn)狀與展望[J]. 王根平,杜文明,夏蘭琴. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(05)
[6]我國水稻育種技術發(fā)展歷程回顧[J]. 王月華,何虎,潘曉華. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2012(02)
[7]轉(zhuǎn)基因技術及其在水稻育種中的研究進展[J]. 肖小君,王輝,齊澤民,黃作喜. 井岡山大學學報(自然科學版). 2011(05)
[8]中國雜交水稻和水稻分子育種研究與發(fā)展概況[J]. 萬昕,李海林,羅斌,徐慶國. 作物研究. 2009(05)
[9]水稻香味基因的研究進展[J]. 唐傲,邵高能,胡培松. 中國稻米. 2009(04)
[10]超級稻的分子設計育種[J]. 萬建民. 沈陽農(nóng)業(yè)大學學報. 2007(05)
本文編號:3587570
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)大學安徽省
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)Ⅱ型的結構
圖 2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)編輯基因的示意圖Fig. 2 Schematic diagram of CRISPR/Cas9 systemSPR/Cas9 編輯技術的應用PR/Cas9 技術作為一種基因編輯工具已經(jīng)應用在許多的的報道不斷出現(xiàn)。Fuchs 等[25]應用 CRISPR/Cas9 技術蛋白 eS25 基因進行了定點成功敲除,構建了核糖體蛋Zheng 等[26]設計出雙 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),在人類細胞中基因,同時證實在提供同源性修復供體時,靶位點基因im 等[27]將 CRISPR/Cas9 技術應用在人類的纖維細胞和點突變率高達 79%。PR/Cas9 技術出現(xiàn)之后,從事農(nóng)業(yè)科研的工作人員把此中,CRISPR/Cas9 技術成功的編輯了小麥和水稻等作運用到擬南芥基因編輯中,培育出了 ADH1 和 TT4 基種。Shan 等[30]利用 CRISPR/Cas9 技術成功敲掉了小粉病的新品種。該團隊還定點突變了水稻 PDS 基因。
圖 2-3 T0 代植株 DNA 序列測序結果Fig.2-3 Sequencing results of DNAsequence of T0 generation plants對兩種部分轉(zhuǎn)化植株基因測序分析得到的基因型如上圖所示:Badh2KO突變型有 1bp 的插入和 1bp 的缺失, Badh2KO2 位點的突變型有 1bp 1bp、2bp、5bp、18bp 的缺失,這些不同的基因突變型很可能來自不能轉(zhuǎn)化。且兩個位點的突變都有純合基因型和雜合基因型。Badh2KO2 位比 Badh2KO1 位點的多 3 種,而且突變型有很大的區(qū)別。本實驗的基因只有堿基插入和堿基的缺失兩種形式,不存在堿基的替換。就突變位置而多發(fā)生在 PAM 上游第 3 個堿基的位置。2 T1代植株突變遺傳對上述基因型突變的植株 KO1-1、KO1-3、KO1-4、KO2-1、KO2-3、KO2-5、KO2-6、KO2-7 的種子遺傳得到 T1代植株。對其 T1代植株的 DNA 測序分析我們可以看到,這 6 個 T0代植株遺傳至 T1代時,幾乎將自身變型基因遺傳到了 T1代。同時有些植株在 T1代又出現(xiàn)了新的突變型
【參考文獻】:
期刊論文
[1]從轉(zhuǎn)基因技術角度談轉(zhuǎn)基因植物的安全性[J]. 葉興國,杜麗璞. 中國種業(yè). 2016(09)
[2]基因編輯作物的發(fā)展及檢測監(jiān)管現(xiàn)狀[J]. 付偉,魏霜,王晨光,杜智欣,朱鵬宇,劉中勇,吳希陽,朱水芳. 植物檢疫. 2016(03)
[3]CRISPR/Cas9系統(tǒng)——靶向基因組編輯的新策略[J]. 趙海衛(wèi),呂欣,尹文. 中國病原生物學雜志. 2015(03)
[4]CRISPR/Cas9介導的基因編輯技術研究進展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學報. 2015(11)
[5]植物安全轉(zhuǎn)基因技術研究現(xiàn)狀與展望[J]. 王根平,杜文明,夏蘭琴. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(05)
[6]我國水稻育種技術發(fā)展歷程回顧[J]. 王月華,何虎,潘曉華. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2012(02)
[7]轉(zhuǎn)基因技術及其在水稻育種中的研究進展[J]. 肖小君,王輝,齊澤民,黃作喜. 井岡山大學學報(自然科學版). 2011(05)
[8]中國雜交水稻和水稻分子育種研究與發(fā)展概況[J]. 萬昕,李海林,羅斌,徐慶國. 作物研究. 2009(05)
[9]水稻香味基因的研究進展[J]. 唐傲,邵高能,胡培松. 中國稻米. 2009(04)
[10]超級稻的分子設計育種[J]. 萬建民. 沈陽農(nóng)業(yè)大學學報. 2007(05)
本文編號:3587570
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