馬鈴薯結(jié)薯相關(guān)MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-02 00:16
馬鈴薯(Solanum tuberosum L.)作為重要的糧食作物,具有產(chǎn)量高、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)。馬鈴薯塊莖既是經(jīng)濟(jì)器官又是繁殖器官,研究馬鈴薯塊莖形成機(jī)理有利于提高馬鈴薯的產(chǎn)量和品質(zhì),對(duì)馬鈴薯的生產(chǎn)具有重要的應(yīng)用及理論的指導(dǎo)意義。光周期響應(yīng)的CO-FT途徑調(diào)控開花、季節(jié)性生長(zhǎng)和儲(chǔ)藏器官形成等多個(gè)發(fā)育轉(zhuǎn)變過(guò)程,FT同源基因St SP6A介導(dǎo)環(huán)境光周期信號(hào)進(jìn)而調(diào)控塊莖形成。但St SP6A如何進(jìn)一步調(diào)節(jié)匍匐莖頂端膨大的機(jī)制尚不清楚。基于頂端分生組織中保守的FT-AP1調(diào)控模塊,本研究鑒定了馬鈴薯全基因組中所有的MADS-box基因,明確其基因結(jié)構(gòu)及在不同光周期條件下的表達(dá)模式,篩選出可能參與介導(dǎo)St SP6A信號(hào)調(diào)控光周期誘導(dǎo)的儲(chǔ)藏器官形成過(guò)程的MADS-box轉(zhuǎn)錄因子,為后續(xù)探究馬鈴薯St SP6A的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)提供基礎(chǔ)。主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:1)利用plant TFDB數(shù)據(jù)庫(kù),鑒定出馬鈴薯中132個(gè)MADS-box轉(zhuǎn)錄因子,聚類、染色體位置和基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明,MADS-box轉(zhuǎn)錄因子聚于兩個(gè)亞族:MIKC-type和M-type,M-type進(jìn)一步分為Mα、Mγ、Mβ三個(gè)亞家族;MADS...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
pGreenⅡ0800載體結(jié)構(gòu)圖
馬鈴薯結(jié)薯相關(guān) MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分析圖 1 pGreenⅡ0800 載體結(jié)構(gòu)圖Fig.1 pGreenⅡ0800 yector structure diagram
T+TD ID 后五位數(shù)字,其基因信息包括了 PGSC 數(shù)據(jù)庫(kù)編號(hào)、染色體位置、蛋、基因亞族及外顯子個(gè)數(shù)(附錄Ⅰ)。基于馬鈴薯系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(圖 4a)將 MAD因子分為了兩個(gè)亞家族:MIKC-type 與 M-type。在 132 個(gè)馬鈴薯 MADS-box中,MIKC-type 蛋白亞族有 36 個(gè) MADS-box 基因,M-type 蛋白亞族有 DS-box 基因,該亞家族 MADS-box 基因個(gè)數(shù)幾乎是 MIKC-type 蛋白亞族的 2 Mα 亞家族中有 61 個(gè) MADS-box 基因,Mβ 亞家族有 24 個(gè) MADS-box 基因族有 11 個(gè) MADS-box 基因。馬鈴薯 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子家族基因編碼蛋白質(zhì)2aa-495aa 之間,平均長(zhǎng)度約為 193aa。其中 MIKC-type 蛋白質(zhì)平均長(zhǎng)度約為 20ype 蛋白質(zhì)平均長(zhǎng)度約為 188aa。為了進(jìn)一步研究馬鈴薯 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)化關(guān)系及預(yù)測(cè)其家族的功能asttree 與 itol 軟件,我們將擬南芥(Arabidopsis thaliana)中的 108 個(gè) MADS-馬鈴薯中 132 個(gè) MADS-box 基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]近年馬鈴薯產(chǎn)業(yè)形勢(shì)與2017年展望[J]. 楊宗輝,于群,劉合光. 農(nóng)業(yè)展望. 2017(09)
[2]赤霉素調(diào)控植物塊莖形態(tài)建成的研究進(jìn)展[J]. 周蕓伊,張靜,王亞倫,肖冬,王愛(ài)勤,何龍飛. 作物雜志. 2016(04)
[3]蔗糖調(diào)節(jié)馬鈴薯塊莖形成機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 鞏慧玲,孫夢(mèng)遙,馮再平,袁惠君. 中國(guó)蔬菜. 2016(03)
[4]光周期誘導(dǎo)馬鈴薯塊莖形成的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 謝婷婷,柳俊. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(22)
[5]馬鈴薯抗寒性研究進(jìn)展[J]. 魏亮,李飛,徐建飛,劉杰,段紹光,于卓,金黎平. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(02)
[6]糖類及其衍生物對(duì)馬鈴薯塊莖形成的影響[J]. 羅玉,李燦輝. 昆明學(xué)院學(xué)報(bào). 2011(06)
[7]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究進(jìn)展[J]. 褚婷婷,謝華,徐勇,馬榮才. 中國(guó)生物工程雜志. 2010(09)
[8]馬鈴薯的傳播與產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究[J]. 彭濤,康霞. 甘肅農(nóng)業(yè). 2010(02)
[9]不同培育溫度對(duì)馬鈴薯生長(zhǎng)及產(chǎn)量的影響[J]. 王曉宇,郭華春. 中國(guó)馬鈴薯. 2009(06)
[10]植物MADS-box基因研究進(jìn)展[J]. 馬輝,張智俊,羅淑萍. 生物技術(shù)通報(bào). 2006(06)
本文編號(hào):3563092
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
pGreenⅡ0800載體結(jié)構(gòu)圖
馬鈴薯結(jié)薯相關(guān) MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分析圖 1 pGreenⅡ0800 載體結(jié)構(gòu)圖Fig.1 pGreenⅡ0800 yector structure diagram
T+TD ID 后五位數(shù)字,其基因信息包括了 PGSC 數(shù)據(jù)庫(kù)編號(hào)、染色體位置、蛋、基因亞族及外顯子個(gè)數(shù)(附錄Ⅰ)。基于馬鈴薯系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(圖 4a)將 MAD因子分為了兩個(gè)亞家族:MIKC-type 與 M-type。在 132 個(gè)馬鈴薯 MADS-box中,MIKC-type 蛋白亞族有 36 個(gè) MADS-box 基因,M-type 蛋白亞族有 DS-box 基因,該亞家族 MADS-box 基因個(gè)數(shù)幾乎是 MIKC-type 蛋白亞族的 2 Mα 亞家族中有 61 個(gè) MADS-box 基因,Mβ 亞家族有 24 個(gè) MADS-box 基因族有 11 個(gè) MADS-box 基因。馬鈴薯 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子家族基因編碼蛋白質(zhì)2aa-495aa 之間,平均長(zhǎng)度約為 193aa。其中 MIKC-type 蛋白質(zhì)平均長(zhǎng)度約為 20ype 蛋白質(zhì)平均長(zhǎng)度約為 188aa。為了進(jìn)一步研究馬鈴薯 MADS-box 轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)化關(guān)系及預(yù)測(cè)其家族的功能asttree 與 itol 軟件,我們將擬南芥(Arabidopsis thaliana)中的 108 個(gè) MADS-馬鈴薯中 132 個(gè) MADS-box 基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]近年馬鈴薯產(chǎn)業(yè)形勢(shì)與2017年展望[J]. 楊宗輝,于群,劉合光. 農(nóng)業(yè)展望. 2017(09)
[2]赤霉素調(diào)控植物塊莖形態(tài)建成的研究進(jìn)展[J]. 周蕓伊,張靜,王亞倫,肖冬,王愛(ài)勤,何龍飛. 作物雜志. 2016(04)
[3]蔗糖調(diào)節(jié)馬鈴薯塊莖形成機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 鞏慧玲,孫夢(mèng)遙,馮再平,袁惠君. 中國(guó)蔬菜. 2016(03)
[4]光周期誘導(dǎo)馬鈴薯塊莖形成的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 謝婷婷,柳俊. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(22)
[5]馬鈴薯抗寒性研究進(jìn)展[J]. 魏亮,李飛,徐建飛,劉杰,段紹光,于卓,金黎平. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(02)
[6]糖類及其衍生物對(duì)馬鈴薯塊莖形成的影響[J]. 羅玉,李燦輝. 昆明學(xué)院學(xué)報(bào). 2011(06)
[7]植物MADS-box基因FRUITFULL(FUL)研究進(jìn)展[J]. 褚婷婷,謝華,徐勇,馬榮才. 中國(guó)生物工程雜志. 2010(09)
[8]馬鈴薯的傳播與產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究[J]. 彭濤,康霞. 甘肅農(nóng)業(yè). 2010(02)
[9]不同培育溫度對(duì)馬鈴薯生長(zhǎng)及產(chǎn)量的影響[J]. 王曉宇,郭華春. 中國(guó)馬鈴薯. 2009(06)
[10]植物MADS-box基因研究進(jìn)展[J]. 馬輝,張智俊,羅淑萍. 生物技術(shù)通報(bào). 2006(06)
本文編號(hào):3563092
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