大麥β-葡聚糖、微量元素含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析及纖維素合成酶類基因家族的鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-10-21 21:58
大麥?zhǔn)侨澜缱钪匾募Z食作物之一,其種植面積和總產(chǎn)量均位居全球第四位,具有重要的食用、飼用和釀造價(jià)值,也是理想的健康食品之一。近年來,研究發(fā)現(xiàn)大麥籽粒富含β-葡聚糖以及鐵、鋅、硒等多種微量元素,且因其具有的“三高二低”即大麥籽粒含有豐富的蛋白質(zhì)、纖維素、維生素,且其脂肪、糖含量較低的特點(diǎn),使得其逐漸成為一種健康的粗糧而越來越受到廣大人民的重視。因此,闡述大麥β-葡聚糖及微量元素的遺傳基礎(chǔ),挖掘影響其含量的相關(guān)基因,對(duì)于利用分子育種提升大麥的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,培育品質(zhì)優(yōu)良的大麥品種具有重要意義。本研究選用28份栽培大麥,8份大麥農(nóng)家種,29份野生大麥以及41份青稞為材料,分別測(cè)定了2018及2019年這106份大麥材料的β-葡聚糖及鐵、鋅、硒三種微量元素含量,并對(duì)這些性狀進(jìn)行了比較分析,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法,篩選了與這四種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)含量顯著關(guān)聯(lián)的SNPs位點(diǎn)及候選基因,并對(duì)與大麥β-葡聚糖合成相關(guān)的基因家族進(jìn)行了鑒定。主要結(jié)果如下:(1)通過對(duì)兩年間收獲的大麥籽粒β-葡聚糖及鐵、鋅、硒三種微量元素含量的分析及比較,發(fā)現(xiàn)大麥的4個(gè)群體內(nèi)各性狀變異系數(shù)均低于10%,遺傳多樣性指數(shù)在1.24~2....
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 大麥
1.1.1 大麥概述
1.1.2 大麥的起源
1.1.3 大麥的用途及營(yíng)養(yǎng)價(jià)值
1.2 β-葡聚糖
1.2.1 β-葡聚糖概述
1.2.2 β-葡聚糖的作用
1.2.3 作物中β-葡聚糖的研究進(jìn)展
1.3 微量元素
1.3.1 微量元素概述
1.3.2 三種重要的微量元素
1.3.3 作物中微量元素的研究進(jìn)展
1.4 關(guān)聯(lián)分析
1.4.1 關(guān)聯(lián)分析概述
1.4.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.4.3 關(guān)聯(lián)分析在作物中的應(yīng)用
1.5 纖維素合成酶類基因家族
1.5.1 纖維素合成酶類概述
1.5.2 纖維素合酶(CesA)
1.5.3 類纖維素合酶(Csl)
1.6 本研究的目的與意義
第二章 不同大麥β-葡聚糖與微量元素含量的比較分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 田間種植與種子收獲
2.1.3 大麥β-葡聚糖含量的測(cè)定
2.1.4 大麥微量元素含量的測(cè)定
2.1.5 不同類型大麥β-葡聚糖和微量元素含量的比較
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 大麥籽粒β-葡聚糖含量的比較
2.2.2 大麥籽粒微量元素含量的比較
2.2.3 聚類分析
2.3 討論
第三章 大麥β-葡聚糖與微量元素含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 SNP位點(diǎn)的鑒定與分布
3.2.2 大麥材料的主成分分析
3.2.3 大麥材料的群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 大麥β-葡聚糖及鐵、鋅、硒含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.3 討論
第四章 大麥纖維素合酶基因家族的全基因組鑒定與分析
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 大麥Ces A和 Csl基因家族的全基因組鑒定
4.1.3 大麥Ces A和 Csl家族的系統(tǒng)發(fā)育分析
4.1.4 大麥Ces A和 Csl家族的基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
4.1.5 大麥Ces A和 Csl家族的表達(dá)特性分析
4.1.6 大麥Ces A和 Csl家族的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 HvCes A和 HvCsl家族的全基因組鑒定及序列分析
4.2.2 HvCes A和 HvCsl家族的系統(tǒng)發(fā)育分析
4.2.3 HvCes A和 HvCsl家族的基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
4.2.4 HvCes A和 HvCsl家族的表達(dá)特性分析
4.2.5 HvCes A和 HvCsl家族的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
4.3 討論
第五章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]青稞中主要功效成分最新研究進(jìn)展[J]. 馮格格,佘永新,洪思慧,檀思佳,王淼,曹振,王珊珊,鄭鷺飛,何亞薈,金茂俊,王靜,邵華,金芬. 農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量與安全. 2020(02)
[2]大麥籽粒淀粉和β-葡聚糖積累特性研究[J]. 王蕾,王悅,嚴(yán)宗山,李潤(rùn)喜,謝忠清,張自強(qiáng),張想平. 作物雜志. 2020(02)
[3]青稞β-葡聚糖的研究現(xiàn)狀與展望[J]. 陳晨,何蒙蒙,吳澤蓉,鄧迎春,周霞,萬軍. 中國食品添加劑. 2020(02)
[4]β-葡聚糖酶對(duì)大麥-小麥混合粉面條物理特性及感官品質(zhì)的影響[J]. 李真,高文倩,姬生鑫,索標(biāo),艾志錄. 現(xiàn)代食品科技. 2019(04)
[5]β-葡聚糖對(duì)傳統(tǒng)青稞酒發(fā)酵的影響[J]. 游茂蘭,鄧婧,覃小麗,金劍波,葉正榮,易川虎,劉雄. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(10)
[6]青稞籽粒β-葡聚糖含量及不同加工方式對(duì)其變化的影響[J]. 王新坤,劉超,楊清梅,程安瑋,王月明,王青,孫金月. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[7]青稞β-葡聚糖對(duì)冷凍熟面品質(zhì)的影響[J]. 范珈璇,裘清揚(yáng),王金榮,郭曉娜,朱科學(xué). 食品與機(jī)械. 2018(12)
[8]谷物β-葡聚糖結(jié)構(gòu)、功能及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 張寧,艾連中,張匯. 食品工業(yè)科技. 2018(09)
[9]普通煙草CESA基因家族成員的鑒定、亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析[J]. 徐宗昌,孔英珍. 遺傳. 2017(06)
[10]大麥茶及大麥籽粒微量元素含量分析[J]. 程曉彬,陳安茹,李利娜,程劍平,嚴(yán)俊. 食品研究與開發(fā). 2017(01)
博士論文
[1]一種交替運(yùn)用固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)模型優(yōu)化全基因組關(guān)聯(lián)分析的算法開發(fā)[D]. 劉小磊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3449789
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
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摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 大麥
1.1.1 大麥概述
1.1.2 大麥的起源
1.1.3 大麥的用途及營(yíng)養(yǎng)價(jià)值
1.2 β-葡聚糖
1.2.1 β-葡聚糖概述
1.2.2 β-葡聚糖的作用
1.2.3 作物中β-葡聚糖的研究進(jìn)展
1.3 微量元素
1.3.1 微量元素概述
1.3.2 三種重要的微量元素
1.3.3 作物中微量元素的研究進(jìn)展
1.4 關(guān)聯(lián)分析
1.4.1 關(guān)聯(lián)分析概述
1.4.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.4.3 關(guān)聯(lián)分析在作物中的應(yīng)用
1.5 纖維素合成酶類基因家族
1.5.1 纖維素合成酶類概述
1.5.2 纖維素合酶(CesA)
1.5.3 類纖維素合酶(Csl)
1.6 本研究的目的與意義
第二章 不同大麥β-葡聚糖與微量元素含量的比較分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 田間種植與種子收獲
2.1.3 大麥β-葡聚糖含量的測(cè)定
2.1.4 大麥微量元素含量的測(cè)定
2.1.5 不同類型大麥β-葡聚糖和微量元素含量的比較
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 大麥籽粒β-葡聚糖含量的比較
2.2.2 大麥籽粒微量元素含量的比較
2.2.3 聚類分析
2.3 討論
第三章 大麥β-葡聚糖與微量元素含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 SNP位點(diǎn)的鑒定與分布
3.2.2 大麥材料的主成分分析
3.2.3 大麥材料的群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.4 大麥β-葡聚糖及鐵、鋅、硒含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.3 討論
第四章 大麥纖維素合酶基因家族的全基因組鑒定與分析
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 大麥Ces A和 Csl基因家族的全基因組鑒定
4.1.3 大麥Ces A和 Csl家族的系統(tǒng)發(fā)育分析
4.1.4 大麥Ces A和 Csl家族的基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
4.1.5 大麥Ces A和 Csl家族的表達(dá)特性分析
4.1.6 大麥Ces A和 Csl家族的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 HvCes A和 HvCsl家族的全基因組鑒定及序列分析
4.2.2 HvCes A和 HvCsl家族的系統(tǒng)發(fā)育分析
4.2.3 HvCes A和 HvCsl家族的基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
4.2.4 HvCes A和 HvCsl家族的表達(dá)特性分析
4.2.5 HvCes A和 HvCsl家族的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
4.3 討論
第五章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]青稞中主要功效成分最新研究進(jìn)展[J]. 馮格格,佘永新,洪思慧,檀思佳,王淼,曹振,王珊珊,鄭鷺飛,何亞薈,金茂俊,王靜,邵華,金芬. 農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量與安全. 2020(02)
[2]大麥籽粒淀粉和β-葡聚糖積累特性研究[J]. 王蕾,王悅,嚴(yán)宗山,李潤(rùn)喜,謝忠清,張自強(qiáng),張想平. 作物雜志. 2020(02)
[3]青稞β-葡聚糖的研究現(xiàn)狀與展望[J]. 陳晨,何蒙蒙,吳澤蓉,鄧迎春,周霞,萬軍. 中國食品添加劑. 2020(02)
[4]β-葡聚糖酶對(duì)大麥-小麥混合粉面條物理特性及感官品質(zhì)的影響[J]. 李真,高文倩,姬生鑫,索標(biāo),艾志錄. 現(xiàn)代食品科技. 2019(04)
[5]β-葡聚糖對(duì)傳統(tǒng)青稞酒發(fā)酵的影響[J]. 游茂蘭,鄧婧,覃小麗,金劍波,葉正榮,易川虎,劉雄. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(10)
[6]青稞籽粒β-葡聚糖含量及不同加工方式對(duì)其變化的影響[J]. 王新坤,劉超,楊清梅,程安瑋,王月明,王青,孫金月. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(02)
[7]青稞β-葡聚糖對(duì)冷凍熟面品質(zhì)的影響[J]. 范珈璇,裘清揚(yáng),王金榮,郭曉娜,朱科學(xué). 食品與機(jī)械. 2018(12)
[8]谷物β-葡聚糖結(jié)構(gòu)、功能及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 張寧,艾連中,張匯. 食品工業(yè)科技. 2018(09)
[9]普通煙草CESA基因家族成員的鑒定、亞細(xì)胞定位及表達(dá)分析[J]. 徐宗昌,孔英珍. 遺傳. 2017(06)
[10]大麥茶及大麥籽粒微量元素含量分析[J]. 程曉彬,陳安茹,李利娜,程劍平,嚴(yán)俊. 食品研究與開發(fā). 2017(01)
博士論文
[1]一種交替運(yùn)用固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)模型優(yōu)化全基因組關(guān)聯(lián)分析的算法開發(fā)[D]. 劉小磊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3449789
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