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谷子淀粉合成酶家族分析

發(fā)布時間:2021-10-21 22:55
  淀粉是植物光合作用的產(chǎn)物,主要在葉綠體中合成,是人類膳食的重要能量來源,同時也是一種重要的工業(yè)原料,被廣泛應(yīng)用于造紙、燃料、制藥等行業(yè)。研究表明植物的淀粉合成與淀粉合成酶及一些其他關(guān)鍵酶有關(guān)。本研究以已知的水稻中淀粉合成酶基因為模板,鑒定出小麥、玉米、二穗短柄草、高粱和谷子淀粉合成酶家族的基因。我們分析了淀粉合成酶基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn)它們在進(jìn)化上具有高度的保守性。通過對保守基序進(jìn)行分析,不同的基因所含有的保守motif的數(shù)目和位置差異很小,谷子淀粉合成酶的基序特征與其進(jìn)化樹基本一致。通過染色體定位分析,可以直觀看出淀粉合成酶基因在每條染色體上分布不均勻。利用蛋白互作分析,可知淀粉的合成與多種酶相關(guān),其中最主要的是與AGP酶相互作用。最后,用Cluster和Treeview程序構(gòu)建了Heatmap圖,發(fā)現(xiàn)淀粉合成酶基因在植物的生長和發(fā)育時期具有高度組織表達(dá)的特異性。由于谷子中淀粉含量的高低直接影響谷子的產(chǎn)量,因此,提高谷子淀粉含量和改良谷子淀粉品質(zhì)已成為重要議題,對于谷子淀粉合成酶的研究具有顯著的社會效益和經(jīng)濟(jì)效益。 

【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(16)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 谷子淀粉合成酶基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
    1.2 谷子淀粉合成酶基因保守motif分析
    1.3 谷子淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
    1.4 淀粉合成酶基因染色體定位分析
    1.5 淀粉合成酶蛋白互作分析
    1.6 淀粉合成酶家族在谷子不同組織中的表達(dá)模式分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 數(shù)據(jù)下載
    3.2 淀粉合成酶基因的鑒定
    3.3 淀粉合成酶基因理化性質(zhì)分析
    3.4 淀粉合成酶基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    3.5 淀粉合成酶基因保守motif分析
    3.6 淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
    3.7 淀粉合成酶基因染色體定位分析
    3.8 淀粉合成酶基因在不同組織中的表達(dá)模式分析
    3.9 淀粉合成酶基因蛋白互作分析
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3449876

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