谷子淀粉合成酶家族分析
發(fā)布時間:2021-10-21 22:55
淀粉是植物光合作用的產(chǎn)物,主要在葉綠體中合成,是人類膳食的重要能量來源,同時也是一種重要的工業(yè)原料,被廣泛應(yīng)用于造紙、燃料、制藥等行業(yè)。研究表明植物的淀粉合成與淀粉合成酶及一些其他關(guān)鍵酶有關(guān)。本研究以已知的水稻中淀粉合成酶基因為模板,鑒定出小麥、玉米、二穗短柄草、高粱和谷子淀粉合成酶家族的基因。我們分析了淀粉合成酶基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn)它們在進(jìn)化上具有高度的保守性。通過對保守基序進(jìn)行分析,不同的基因所含有的保守motif的數(shù)目和位置差異很小,谷子淀粉合成酶的基序特征與其進(jìn)化樹基本一致。通過染色體定位分析,可以直觀看出淀粉合成酶基因在每條染色體上分布不均勻。利用蛋白互作分析,可知淀粉的合成與多種酶相關(guān),其中最主要的是與AGP酶相互作用。最后,用Cluster和Treeview程序構(gòu)建了Heatmap圖,發(fā)現(xiàn)淀粉合成酶基因在植物的生長和發(fā)育時期具有高度組織表達(dá)的特異性。由于谷子中淀粉含量的高低直接影響谷子的產(chǎn)量,因此,提高谷子淀粉含量和改良谷子淀粉品質(zhì)已成為重要議題,對于谷子淀粉合成酶的研究具有顯著的社會效益和經(jīng)濟(jì)效益。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 谷子淀粉合成酶基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
1.2 谷子淀粉合成酶基因保守motif分析
1.3 谷子淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
1.4 淀粉合成酶基因染色體定位分析
1.5 淀粉合成酶蛋白互作分析
1.6 淀粉合成酶家族在谷子不同組織中的表達(dá)模式分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 數(shù)據(jù)下載
3.2 淀粉合成酶基因的鑒定
3.3 淀粉合成酶基因理化性質(zhì)分析
3.4 淀粉合成酶基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
3.5 淀粉合成酶基因保守motif分析
3.6 淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
3.7 淀粉合成酶基因染色體定位分析
3.8 淀粉合成酶基因在不同組織中的表達(dá)模式分析
3.9 淀粉合成酶基因蛋白互作分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]幾種植物淀粉合成酶的生物信息學(xué)分析[J]. 田亞珍,武國凡,秦緒軍,牛世全,孔維寶. 食品與生物技術(shù)學(xué)報. 2018(09)
[2]谷物胚乳中淀粉合成酶及其同工型的研究進(jìn)展[J]. 萬峰,孫春玉,李闖,別楓橋,張美萍,王義. 分子植物育種. 2017(11)
[3]藥用野生稻葉中淀粉合成酶基因家族的序列分化和特異表達(dá)[J]. 包穎,杜家瀟,景翔,徐思. 植物學(xué)報. 2015(06)
[4]河北產(chǎn)區(qū)9個谷子品種淀粉性質(zhì)的研究[J]. 劉成,張佩麗,沈群. 食品工業(yè)科技. 2010(01)
[5]作物淀粉合成關(guān)鍵酶及其基因表達(dá)的研究進(jìn)展[J]. 譚彩霞,封超年,陳靜,郭靜,郭文善,朱新開,李春燕,彭永欣. 麥類作物學(xué)報. 2008(05)
[6]小麥淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 宋健民,李豪圣,戴雙,劉愛峰,劉建軍,趙振東. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(S1)
[7]GSDS:基因結(jié)構(gòu)顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[8]玉米可溶性淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 張軍杰,黃玉碧. 玉米科學(xué). 2006(06)
[9]小麥胚乳淀粉合成酶基因研究進(jìn)展[J]. 余春梅,陳佩度,季本華. 麥類作物學(xué)報. 2004(04)
[10]顆粒結(jié)合型淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 時巖玲,田紀(jì)春. 麥類作物學(xué)報. 2003(03)
本文編號:3449876
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 谷子淀粉合成酶基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
1.2 谷子淀粉合成酶基因保守motif分析
1.3 谷子淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
1.4 淀粉合成酶基因染色體定位分析
1.5 淀粉合成酶蛋白互作分析
1.6 淀粉合成酶家族在谷子不同組織中的表達(dá)模式分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 數(shù)據(jù)下載
3.2 淀粉合成酶基因的鑒定
3.3 淀粉合成酶基因理化性質(zhì)分析
3.4 淀粉合成酶基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
3.5 淀粉合成酶基因保守motif分析
3.6 淀粉合成酶基因結(jié)構(gòu)分析
3.7 淀粉合成酶基因染色體定位分析
3.8 淀粉合成酶基因在不同組織中的表達(dá)模式分析
3.9 淀粉合成酶基因蛋白互作分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]幾種植物淀粉合成酶的生物信息學(xué)分析[J]. 田亞珍,武國凡,秦緒軍,牛世全,孔維寶. 食品與生物技術(shù)學(xué)報. 2018(09)
[2]谷物胚乳中淀粉合成酶及其同工型的研究進(jìn)展[J]. 萬峰,孫春玉,李闖,別楓橋,張美萍,王義. 分子植物育種. 2017(11)
[3]藥用野生稻葉中淀粉合成酶基因家族的序列分化和特異表達(dá)[J]. 包穎,杜家瀟,景翔,徐思. 植物學(xué)報. 2015(06)
[4]河北產(chǎn)區(qū)9個谷子品種淀粉性質(zhì)的研究[J]. 劉成,張佩麗,沈群. 食品工業(yè)科技. 2010(01)
[5]作物淀粉合成關(guān)鍵酶及其基因表達(dá)的研究進(jìn)展[J]. 譚彩霞,封超年,陳靜,郭靜,郭文善,朱新開,李春燕,彭永欣. 麥類作物學(xué)報. 2008(05)
[6]小麥淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 宋健民,李豪圣,戴雙,劉愛峰,劉建軍,趙振東. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(S1)
[7]GSDS:基因結(jié)構(gòu)顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[8]玉米可溶性淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 張軍杰,黃玉碧. 玉米科學(xué). 2006(06)
[9]小麥胚乳淀粉合成酶基因研究進(jìn)展[J]. 余春梅,陳佩度,季本華. 麥類作物學(xué)報. 2004(04)
[10]顆粒結(jié)合型淀粉合成酶研究進(jìn)展[J]. 時巖玲,田紀(jì)春. 麥類作物學(xué)報. 2003(03)
本文編號:3449876
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