馬鈴薯磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白相關(guān)基因StPHT1;7的克隆和功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-11 04:59
植物吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)土壤中的磷依靠根系細(xì)胞膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。植物中已發(fā)現(xiàn)的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因分為6個家族:PHT1、PHT2、PHT3、PHT4、PHT5、PHO1,不同亞家族磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對植物的生長發(fā)育起到不同作用。大多PHT1家族基因被判斷為高親和磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因,在各種作物中均有較為深入的研究。但PHT1家族在馬鈴薯中的研究目前仍較少,值得進(jìn)行研究補(bǔ)充。研究在馬鈴薯PHT1家族中組織表達(dá)量最高的StPHT1;7,可以探究其對馬鈴薯生長發(fā)育以及抗逆相關(guān)方面的重要作用。本研究從馬鈴薯栽培品種Desiree中克隆獲得StPHT1;7基因,構(gòu)建StPHT1;7基因的過表達(dá)和干擾載體,進(jìn)行馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化,觀察分析StPHT1;7基因?qū)︸R鈴薯生長發(fā)育起到的作用以及抗逆方面帶來的影響。主要研究結(jié)果如下:(1)用生物信息學(xué)方法,在馬鈴薯基因組中鑒定出8個PHT1家族基因,PGSC轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析表明,StPHT1;7在馬鈴薯全株表達(dá)量均很高,受各種脅迫影響后表達(dá)量顯著提升。(2)用cDNA序列PCR克隆了StPHT1;7基因,StPHT1;7基因全長1614bp。構(gòu)建了StPHT1;7基因過表達(dá)和干擾載體,用農(nóng)...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
馬鈴薯PHT1基因家族結(jié)構(gòu)分析和結(jié)構(gòu)域預(yù)測
第二章馬鈴薯PHT1家族生物信息學(xué)分析13析到了8個,其中StPHT1;5和StPHT1;8各缺少1個外,其余基因均包含這8個保守結(jié)構(gòu)域。2.2.3馬鈴薯PHT1蛋白一級預(yù)測分析圖2-2馬鈴薯PHT1基因家族跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測Fig.2-2PredictionoftransmembranedomainofpotatoPHT1genefamily馬鈴薯PHT1基因家族跨膜結(jié)構(gòu)域如圖2-2所示,8個成員均含有9-11個跨膜結(jié)構(gòu),N端均在細(xì)胞內(nèi),其中C端在外的有StPHT1;3、StPHT1;5、StPHT1;6和StPHT1;8,C端在內(nèi)的有StPHT1;1、StPHT1;2、StPHT1;4和StPHT1;7。馬鈴薯PHT1基因合成多肽鏈預(yù)測信號肽結(jié)果顯示,8個成員均無信號肽序列。表明馬鈴薯PHT1家族基因是定位在細(xì)胞膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因。
西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文142.2.4馬鈴薯PHT1基因家族成員蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析圖2-3馬鈴薯PHT1基因家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析Fig.2-3AnalysisofthesecondarystructureofpotatoPHT1genefamilyproteins如圖2-3所示,馬鈴薯PHT1基因家族8個成員的二級結(jié)構(gòu)總體上相似。表2-2顯示馬鈴薯PHT1基因家族蛋白二級結(jié)構(gòu)中含量最高的為α-螺旋,在StPHT1;8多肽鏈中含量最高,占52.46%;在StPHT1;7多肽鏈中含量最低,仍高達(dá)47.96%。馬鈴薯PHT1基因家族蛋白二級結(jié)構(gòu)中含量最低的為β-轉(zhuǎn)角,在StPHT1;7多肽鏈中含量最高,
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水稻OsXCP2基因表達(dá)載體及RNAi載體構(gòu)建[J]. 張磊,孫曉棠,唐子清,葉夢斐,崔汝強(qiáng). 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[2]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的馬鈴薯轉(zhuǎn)化研究進(jìn)展[J]. 張麗,宋玉霞,鞏檑,頡瑞霞,甘曉燕,石磊,聶峰杰,陳虞超,張國輝. 分子植物育種. 2015(07)
[3]PEG-8000模擬干旱脅迫對11個馬鈴薯品種的組培苗生長指標(biāo)的影響[J]. 鄧珍,徐建飛,段紹光,劉杰,卞春松,龐萬福,金黎平. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(05)
[4]磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因TaPht1;4的染色體定位及其在低磷下與小麥吸磷能力的關(guān)系[J]. 郭麗,郭程瑾,路文靜,李小娟,肖凱. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]馬鈴薯對氮、磷、鉀的吸收及分配規(guī)律研究進(jìn)展[J]. 張西露,劉明月,伍壯生,黃科. 中國馬鈴薯. 2010(04)
[6]54年來中國西北地區(qū)降水量的變化[J]. 郭慕萍,王志偉,秦愛民,范永鈴. 干旱區(qū)研究. 2009(01)
[7]轉(zhuǎn)betA基因的小黑楊花粉植株耐鹽性分析[J]. 白爽,宋啟平,劉桂豐,姜瑩,林士杰. 分子植物育種. 2006(01)
[8]磷、鉀營養(yǎng)平衡對青菜解剖結(jié)構(gòu)的影響[J]. 陳慧選,韓雪梅,吳樹彪,陳慧平,蔡志旭. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 1996(04)
博士論文
[1]三種茄科作物Pht1家族磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的克隆及表達(dá)調(diào)控分析[D]. 陳愛群.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[2]利用試管薯誘導(dǎo)途徑探討馬鈴薯品質(zhì)形成及其調(diào)控研究[D]. 李會珍.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1]白菜型油菜PHT1基因家族的克隆及功能分析[D]. 張倩.牡丹江師范學(xué)院 2016
[2]PEG-6000脅迫下馬鈴薯耐旱指標(biāo)的篩選[D]. 李志燕.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]番茄磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因LePT1和LePT2在水稻中的功能鑒定[D]. 洪帥.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]轉(zhuǎn)檉柳LEA基因煙草耐鹽性分析[D]. 于影.東北林業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3429833
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【部分圖文】:
馬鈴薯PHT1基因家族結(jié)構(gòu)分析和結(jié)構(gòu)域預(yù)測
第二章馬鈴薯PHT1家族生物信息學(xué)分析13析到了8個,其中StPHT1;5和StPHT1;8各缺少1個外,其余基因均包含這8個保守結(jié)構(gòu)域。2.2.3馬鈴薯PHT1蛋白一級預(yù)測分析圖2-2馬鈴薯PHT1基因家族跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測Fig.2-2PredictionoftransmembranedomainofpotatoPHT1genefamily馬鈴薯PHT1基因家族跨膜結(jié)構(gòu)域如圖2-2所示,8個成員均含有9-11個跨膜結(jié)構(gòu),N端均在細(xì)胞內(nèi),其中C端在外的有StPHT1;3、StPHT1;5、StPHT1;6和StPHT1;8,C端在內(nèi)的有StPHT1;1、StPHT1;2、StPHT1;4和StPHT1;7。馬鈴薯PHT1基因合成多肽鏈預(yù)測信號肽結(jié)果顯示,8個成員均無信號肽序列。表明馬鈴薯PHT1家族基因是定位在細(xì)胞膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因。
西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文142.2.4馬鈴薯PHT1基因家族成員蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析圖2-3馬鈴薯PHT1基因家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析Fig.2-3AnalysisofthesecondarystructureofpotatoPHT1genefamilyproteins如圖2-3所示,馬鈴薯PHT1基因家族8個成員的二級結(jié)構(gòu)總體上相似。表2-2顯示馬鈴薯PHT1基因家族蛋白二級結(jié)構(gòu)中含量最高的為α-螺旋,在StPHT1;8多肽鏈中含量最高,占52.46%;在StPHT1;7多肽鏈中含量最低,仍高達(dá)47.96%。馬鈴薯PHT1基因家族蛋白二級結(jié)構(gòu)中含量最低的為β-轉(zhuǎn)角,在StPHT1;7多肽鏈中含量最高,
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]PEG-8000模擬干旱脅迫對11個馬鈴薯品種的組培苗生長指標(biāo)的影響[J]. 鄧珍,徐建飛,段紹光,劉杰,卞春松,龐萬福,金黎平. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(05)
[4]磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因TaPht1;4的染色體定位及其在低磷下與小麥吸磷能力的關(guān)系[J]. 郭麗,郭程瑾,路文靜,李小娟,肖凱. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]馬鈴薯對氮、磷、鉀的吸收及分配規(guī)律研究進(jìn)展[J]. 張西露,劉明月,伍壯生,黃科. 中國馬鈴薯. 2010(04)
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[8]磷、鉀營養(yǎng)平衡對青菜解剖結(jié)構(gòu)的影響[J]. 陳慧選,韓雪梅,吳樹彪,陳慧平,蔡志旭. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 1996(04)
博士論文
[1]三種茄科作物Pht1家族磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的克隆及表達(dá)調(diào)控分析[D]. 陳愛群.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[2]利用試管薯誘導(dǎo)途徑探討馬鈴薯品質(zhì)形成及其調(diào)控研究[D]. 李會珍.浙江大學(xué) 2004
碩士論文
[1]白菜型油菜PHT1基因家族的克隆及功能分析[D]. 張倩.牡丹江師范學(xué)院 2016
[2]PEG-6000脅迫下馬鈴薯耐旱指標(biāo)的篩選[D]. 李志燕.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]番茄磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因LePT1和LePT2在水稻中的功能鑒定[D]. 洪帥.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]轉(zhuǎn)檉柳LEA基因煙草耐鹽性分析[D]. 于影.東北林業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3429833
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