鐵皮石斛（Dendrobium officinale Kimura et Migo）是蘭科石斛屬多年生草本單子葉植物,具有極高的藥用價(jià)值和觀賞價(jià)值。鐵皮石斛具有蘭科植物共有的原球莖發(fā)育模式,即種子發(fā)育成熟時(shí)其種胚仍停留在未分化階段,需經(jīng)歷原球莖時(shí)期才能發(fā)育成完整植株。由于需求的自然環(huán)境要求高和人為的大肆采摘,現(xiàn)已淪為瀕危物種。本研究共分為四個(gè)方面,鐵皮石斛原球莖不同時(shí)期的形態(tài)觀察研究,鐵皮石斛中泛素活化酶E1（DoUBA）家族鑒定與分析、鐵皮石斛中泛素結(jié)合酶E2（DoUBC）家族鑒定與分析以及DoUBC9的克隆鑒定與表達(dá)分析。主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:（1）原球莖發(fā)育一般經(jīng)歷七個(gè)時(shí)期P1^P7,分別為:種胚活化突破種皮,原球莖形成,原分生組織形成,頂端分生組織形成,橢球形原球莖形成,葉原基維管形成和根端分生組織形成。對(duì)各個(gè)時(shí)期的原球莖進(jìn)行挑選,使用體視鏡和掃描電鏡進(jìn)行形態(tài)觀察記錄。（2）泛素活化酶E1是泛素-蛋白酶體途徑中涉及的第一個(gè)酶,負(fù)責(zé)靶蛋白的活化,在泛素化途徑中起著關(guān)鍵性作用。本研究利用三代轉(zhuǎn)錄組測序,從利用GO分析、KEGG分析等方法注釋的序列文件以及使用SMAR... 

【文章來源】：西南交通大學(xué)四川省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：128 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

不同時(shí)期（P1~P7）原球莖掃描電鏡圖

圖 3-1 DoUBA 家族蛋白跨膜域預(yù)測Fig.3-1 Prediction of DoUBAFamily Protein Transmembrane Domain3.2.4.5 DoUBA 家族蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)分析使用 SOPMA 在線軟件對(duì) DoUBA 家族預(yù)測蛋白進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)分析，發(fā)現(xiàn)四個(gè) DoUBA 家族預(yù)測蛋白除了 DoUBA3 蛋白外，都是 α-螺旋占比最多，然后依次是無規(guī)卷曲、延伸鏈和 β-轉(zhuǎn)角，而 DoUBA3 蛋白中的無規(guī)卷曲占比最多達(dá)到38.70%，但是接近于 α-螺旋的 38.42%，這也許解釋了 DoUBA3 蛋白的不穩(wěn)定和親水性的原因，具體見表 3-5。表 3-5 DoUBA 家族蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測Tab. 3-5 Prediction of Secondary Structure of DoUBAFamily ProteinsProtein Alpha helixaExtended strandbBeta turncRandom coildDoUBA1 41.32% 16.44% 5.14% 37.10%DoUBA2 45.10% 16.67% 9.31% 28.92%DoUBA3 38.42% 18.64% 4.24% 38.70%

圖 3-2 DoUBA 家族蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)圖預(yù)測Fig.3-2 Prediction of Secondary Structure of DoUBAFamily Proteins3.2.4.6 不同物種 UBA 與 DoUBA 基因進(jìn)化分析為了進(jìn)一步了解 DoUBA 家族的進(jìn)化關(guān)系，選取了擬南芥、番茄和玉米的UBA 家族蛋白序列進(jìn)行完全對(duì)比 DoUBA1、DoUBA4、AtUBA1~2 和 ZmUBA1~4的蛋白序列相似度非常高，DoUBA1 和 DoUBA2 與這些基因的蛋白序列的相似度均在 60%以上，高度保守。但是，DoUBA2 和 DoUBA3 以及番茄中的泛素活化酶 SlUBA1 和 SlUBA2 與其他基因的相似度非常低，這或許與鐵皮石斛的特殊性以及番茄是雙子葉植物有關(guān)，具體見表 3-6。


本文編號(hào)：3404876