苧麻一般一年收獲三季,多項(xiàng)研究均發(fā)現(xiàn)不同季節(jié)苧麻纖維品質(zhì)尤其是纖維細(xì)度存在明顯差異,然而其生理和分子機(jī)理卻鮮有報(bào)道。苧麻是韌皮纖維作物,通過(guò)生物技術(shù)對(duì)其纖維品質(zhì)進(jìn)行定向改良亟需開發(fā)韌皮部特異（優(yōu)勢(shì)）表達(dá)啟動(dòng)子。隨著轉(zhuǎn)錄組學(xué)在苧麻研究領(lǐng)域的不斷應(yīng)用,已經(jīng)積累了大量具有研究?jī)r(jià)值的候選基因,這些基因的功能驗(yàn)證工作及后續(xù)應(yīng)用也都需要用到啟動(dòng)子�；谶@些問(wèn)題,本研究聯(lián)合二代高通量測(cè)序和三代全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在轉(zhuǎn)錄水平上解析不同溫度模式下苧麻纖維品質(zhì)存在差異的原因,同時(shí)對(duì)韌皮部蛋白（PP2）家族進(jìn)行鑒定和表達(dá)分析以及分離了5個(gè)苧麻內(nèi)源啟動(dòng)子并在擬南芥中進(jìn)行了功能分析。主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:1.不同溫度模式下苧麻莖皮轉(zhuǎn)錄組研究本研究對(duì)兩種溫度模式（High Temperature Patterns,HTP;Low Temperature Patterns,LTP）下苧麻莖皮上、中、下三個(gè)部位進(jìn)行二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序并分別混合HTP和LTP樣品進(jìn)行三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并以三代測(cè)序結(jié)果為參考序列進(jìn)行后續(xù)分析。通過(guò)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序我們一共獲得353495個(gè)轉(zhuǎn)錄本及139530個(gè)基因,其中轉(zhuǎn)錄本N50長(zhǎng)度在3000 bp以上,... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：154 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

纖維生物合成示意圖

溫度影響苧麻纖維品質(zhì)轉(zhuǎn)錄組解析及特異型啟動(dòng)子鑒定4；賈滿蘭 2016）及去除果膠的技術(shù)方法上（肖麗等 2莉鳳等 2017），而對(duì)果膠代謝過(guò)程中相關(guān)酶及其編碼基因，苧麻中只報(bào)道了兩個(gè)有關(guān)果膠生物合成相關(guān)基因：編碼-表異構(gòu)酶 (UDP-glucuronic acid-4-epimerase) 的UGlcA和編碼半乳糖醛酸基轉(zhuǎn)移酶 (Galacturonic acid transfer新等 2009）。是一類復(fù)雜的有機(jī)酚類聚合物，其在植物細(xì)胞壁形成中起al 2009)。目前已知木質(zhì)素單體合成主要通過(guò)莽草酸、苯

1988；Siebert et al 1995)，這種方法采用限制性內(nèi)切酶消化DNA，由此產(chǎn)生許多DNA片段，其中極少片段帶有一段已知序列，再通過(guò)連接酶將DNA片段連接成環(huán)，以已知序列為模板設(shè)計(jì)引物通過(guò)PCR技術(shù)克隆環(huán)內(nèi)兩側(cè)未知序列（圖1.3）。Yoshitomonakagawa 等人首次采用反向PCR技術(shù)從老鼠中分離了TGF-β受體基因啟動(dòng)子 (Yoshitomonakagawa et al 1997)。由于限制性內(nèi)切酶和連接酶在作用過(guò)程中具有很大隨機(jī)性，因而導(dǎo)致整個(gè)反向PCR克隆效率偏低且PCR產(chǎn)物假陽(yáng)性較高，盡管反向 PCR 克隆側(cè)翼序列的方式已經(jīng)不常用了，但其所蘊(yùn)含的側(cè)翼序列克隆思想對(duì)后續(xù)側(cè)翼序列克隆方法的開發(fā)與改進(jìn)影響深遠(yuǎn)，如T接頭PCR (T-LinkerPCR) (Yuanxin et al 2003)，多功能接頭 (Versatile Adapter) PCR (Nthangeni et al2005) 等。隨著技術(shù)的發(fā)展，不同的側(cè)翼序列克隆方法相繼出現(xiàn)。熱不對(duì)稱交錯(cuò)PCR (TAIL-PCR) 是一種成熟且在未知序列克隆上受廣泛應(yīng)用的方法 (Liu andWhittier 1995；Terauchi and Kahl 2000； Liu and Chen 2007)。它依據(jù)未知目標(biāo)序列附近的已知序列設(shè)計(jì)多個(gè)嵌套特異性引物，將這些引物分別與隨機(jī)簡(jiǎn)并引物組

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]氮素水平對(duì)不同氮效率苧麻纖維發(fā)育關(guān)鍵酶的影響[J]. 陳繼康,譚龍濤,喻春明,朱愛國(guó),陳平,高鋼,陳坤梅,熊和平.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2017(05)
[2]苧麻脫膠果膠復(fù)合酶的優(yōu)選及其效果分析[J]. 成莉鳳,劉正初,馮湘沅,汪啟明,李琦,鄭科,楊琦,段盛文.  紡織學(xué)報(bào). 2017(06)
[3]干旱脅迫對(duì)苧麻苗期理化指標(biāo)的影響[J]. 孫鏖,鄧薈芬,劉海林,易康樂(lè),李劍波,伍佰鑫,李昊幫,蔣桂韜,戴求仲.  草地學(xué)報(bào). 2016(03)
[4]苧麻不同氮鉀施肥水平纖維品質(zhì)的差異[J]. 代小兵.  湖北植保. 2015(06)
[5]漬水對(duì)苧麻敗蔸的影響[J]. 胡玥,楊瑞芳.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(19)
[6]兩種苧麻纖維素合酶基因cDNA序列的克隆及表達(dá)[J]. 劉昱翔,陳建榮,彭彥,黃妤,趙燕,黃麗華,郭清泉,張學(xué)文.  作物學(xué)報(bào). 2014(11)
[7]苧麻纖維素合成酶基因BnCesA4 cDNA序列的克隆與表達(dá)分析[J]. 劉昱翔,陳建榮,彭彥,黃妤,趙燕,黃麗華,郭清泉,張學(xué)文.  作物研究. 2014(05)
[8]多糖組分對(duì)苧麻纖維性能的影響[J]. 黎征帆,楊建平,郁崇文.  東華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(03)
[9]分宜氣象因子對(duì)苧麻生長(zhǎng)的影響及種植區(qū)域的劃分[J]. 袁晉琰,吳春燕,阮啟亮,彭旻芬.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2013(04)
[10]干旱脅迫對(duì)雜交苧麻脯氨酸積累、膜脂過(guò)氧化及抗氧化酶活性的影響[J]. 黃承建,趙思毅,王龍昌,茍?jiān)?李亞玲,李萍,唐朝霞.  中國(guó)麻業(yè)科學(xué). 2013(02)

博士論文
[1]苧麻纖維發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及expansin家族功能分析[D]. 陳杰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]苧麻UDPGDH基因cDNA的克隆及功能分析[D]. 劉峰.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]苧麻XTH家族基因克隆及表達(dá)分析[D]. 陳悰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]苧麻纖維發(fā)育規(guī)律及相關(guān)基因表達(dá)模式研究[D]. 張欣欣.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]苧麻不同部位品質(zhì)性狀及脫膠工藝的研究[D]. 賈滿蘭.東華大學(xué) 2016
[4]不同基因型苧麻纖維品質(zhì)性狀及其相關(guān)性研究[D]. 李秀萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào)：3405530