甘薯塊根發(fā)育及非生物脅迫相關MADS-box基因的篩
發(fā)布時間:2021-08-31 05:21
甘薯(Ipomoea batatas)是世界上重要的糧食、飼料、蔬菜、工業(yè)原料和新型能源作物。提高甘薯產(chǎn)量已成為當前甘薯育種的主要方向之一。MADS-box蛋白是一類重要的轉錄因子,在植物生長發(fā)育及抗逆等過程發(fā)揮著重要功能。我們利用轉錄組數(shù)據(jù)及甘薯近緣野生種I.trifida全基因組數(shù)據(jù)在甘薯(Xu22)中篩選并克隆到8個MADS-box基因;利用實時定量RT-PCR對其在甘薯各組織的表達特性進行了分析;對甘薯幼苗進行了非生物脅迫和激素處理,利用實時定量RT-PCR分析了8個MADS-box基因對非生物脅迫和激素的響應,篩選到一個可能與甘薯塊根發(fā)育和抗逆相關的MADS-box基因Ib MBP4,利用農桿菌轉化法在番茄中異源超表達了該基因,初步分析了Ib MBP4的功能。主要研究結果如下:(1)通過轉錄組數(shù)據(jù)及I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫篩選到8個MADS-box基因,以甘薯栽培種徐薯22葉、莖、根混合c DNA為模板,克隆了8個MADS-box基因。(2)通過生物信息學分析了8個MADS-box蛋白的基本理化性質。對各MADS-box基因進行了亞細胞定位預測,發(fā)現(xiàn)這8個基因都定位于...
【文章來源】:江蘇師范大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯各組織總RNA電泳圖
江蘇師范大學碩士學位論文20表2-4各組織RNA的濃度測定Table2-4DeterminationoftheconcentrationofRNAsineachtissue材料名稱(中文)英文縮寫濃度(ng/μL)260/280葉L937.81.99莖S541.61.84纖維根FR640.31.88發(fā)育根1DR1322.11.89發(fā)育根2DR2307.41.86成熟根MR370.11.92從以上結果我們可以看出,所提取RNA的質量良好,28S和18S條帶較亮,5s條帶明顯,且亮度較弱,并且濃度較高,可用于后續(xù)反轉錄實驗。2.3.2MADS-box基因的擴增根據(jù)已有的轉錄組數(shù)據(jù),結合公布的I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫,應用引物設計軟件PrimerPremier5,設計得到8對MADS-box引物,以之前反轉錄所得徐22各組織(葉、莖、纖維根、發(fā)育根初期、發(fā)育根后期和成熟塊根)混合cDNA為模板,分別對8個MADS-box基因進行了克攏如圖2-2、2-3和2-4所示,所擴增條帶大小與理論片段長度一致(IbMBP1:450bp,IbMBP2:666bp,IbMBP4:1036bp,IbMBP5:774bp,IbMBP6:648bp,IbMBP7:696bp,IbMBP8:636bp,IbMBP10:597bp),可以用于后續(xù)實驗。圖2-2MADS-box基因PCR電泳圖Figure2-2ThePCRelectrophoresisofMADS-boxgenesM:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10M:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10
第二章甘薯MADS-box基因的篩選及克隆21圖2-3IbMBP4基因PCR電泳圖Figure2-3ThePCRelectrophoresisofIbMBP4geneM:DL2000Marker,1~5:IbMBP4基因M:DL2000Marker,1~5:IbMBP4gene圖2-4IbMBP5基因PCR電泳圖Figure2-4ThePCRelectrophoresisofIbMBP5geneM:DL2000Marker,1:IbMBP5基因M:DL2000Marker,1:IbMBP5gene2.3.3陽性單克隆的篩選將PCR所得條帶經(jīng)過純化加A尾后,與克隆載體pMD19-T連接,轉入大腸桿菌感受態(tài)細胞后,利用菌落PCR對長出的單菌落進行陽性鑒定。如圖2-5至2-11所示,篩選獲得7個IbMBP1陽性克壟7個IbMBP2陽性克壟10個IbMBP4陽性克壟8個IbMBP5陽性克壟3個IbMBP6陽性克壟6個IbMBP7陽性克壟7個IbMBP8陽性克隆和8個IbMBP10陽性克攏圖2-5IbMBP1基因菌落PCRFigure2-5ThebacteriaPCRofIbMBP1geneM:DL2000Marker,1~7:七個IbMBP1陽性克隆M:DL2000Marker,1~7:sevenIbMBP1positiveclones
【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘薯種植對蘇北沿海灘涂土壤環(huán)境的影響[J]. 劉沖,王茂文,邢錦城,丁海榮,朱小梅,趙寶泉,董靜,溫祝桂,洪立洲. 浙江農業(yè)學報. 2016(11)
[2]甘薯抗旱鑒定及生理響應研究[J]. 劉恩良,曹清河,唐君,金平. 新疆農業(yè)科學. 2016(06)
[3]我國薯類基礎研究的動態(tài)與展望[J]. 張鵬. 生物技術通報. 2015(04)
[4]甘薯耐非生物脅迫的分子生物學研究進展[J]. 王福琴,侯夫云,秦楨,李愛賢,董順旭,王慶美,張立明. 基因組學與應用生物學. 2015(01)
[5]甘薯塊根生長及其淀粉體發(fā)育過程的解剖結構特征[J]. 荊彥平,李棟梁,劉大同,余徐潤,胡慕蘭,顧蘊潔,王忠. 西北植物學報. 2013(12)
[6]國內外甘薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況[J]. 馬劍鳳,程金花,汪潔,戴紅君,戴起偉. 江蘇農業(yè)科學. 2012(12)
[7]中國甘薯產(chǎn)業(yè)及產(chǎn)業(yè)技術的發(fā)展與展望[J]. 馬代夫,李強,曹清河,鈕福祥,謝逸萍,唐君,李洪民. 江蘇農業(yè)學報. 2012(05)
[8]不同類型甘薯品種主要經(jīng)濟性狀和營養(yǎng)成分差異[J]. 劉桂玲,張鵬,鄭建利,楊俊,趙豐玲,田昌庚,史春余. 中國糧油學報. 2012(02)
[9]五大類傳統(tǒng)植物激素對植物響應鹽脅迫的調控[J]. 姚曼紅,劉琳,曾幼玲. 生物技術通報. 2011(11)
[10]RNAi技術研究新進展[J]. 周紅建,黃松,王雄偉. 生物技術通報. 2010(12)
碩士論文
[1]番茄SlMADS23-like基因的克隆及功能研究[D]. 封葉.重慶大學 2016
[2]外源ABA和ZT對小麥穗花發(fā)育調控效應的研究[D]. 戴曉琴.河北農業(yè)大學 2002
[3]中國甘薯(Ipomoea batatas)品種資源遺傳多樣性及分子鑒定研究[D]. 王士泉.山東師范大學 2002
本文編號:3374277
【文章來源】:江蘇師范大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘薯各組織總RNA電泳圖
江蘇師范大學碩士學位論文20表2-4各組織RNA的濃度測定Table2-4DeterminationoftheconcentrationofRNAsineachtissue材料名稱(中文)英文縮寫濃度(ng/μL)260/280葉L937.81.99莖S541.61.84纖維根FR640.31.88發(fā)育根1DR1322.11.89發(fā)育根2DR2307.41.86成熟根MR370.11.92從以上結果我們可以看出,所提取RNA的質量良好,28S和18S條帶較亮,5s條帶明顯,且亮度較弱,并且濃度較高,可用于后續(xù)反轉錄實驗。2.3.2MADS-box基因的擴增根據(jù)已有的轉錄組數(shù)據(jù),結合公布的I.trifida全基因組數(shù)據(jù)庫,應用引物設計軟件PrimerPremier5,設計得到8對MADS-box引物,以之前反轉錄所得徐22各組織(葉、莖、纖維根、發(fā)育根初期、發(fā)育根后期和成熟塊根)混合cDNA為模板,分別對8個MADS-box基因進行了克攏如圖2-2、2-3和2-4所示,所擴增條帶大小與理論片段長度一致(IbMBP1:450bp,IbMBP2:666bp,IbMBP4:1036bp,IbMBP5:774bp,IbMBP6:648bp,IbMBP7:696bp,IbMBP8:636bp,IbMBP10:597bp),可以用于后續(xù)實驗。圖2-2MADS-box基因PCR電泳圖Figure2-2ThePCRelectrophoresisofMADS-boxgenesM:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10M:DL2000Marker,1:IbMBP1,2:IbMBP2,3:IbMBP6,4:IbMBP7,5:IbMBP8,6:IbMBP10
第二章甘薯MADS-box基因的篩選及克隆21圖2-3IbMBP4基因PCR電泳圖Figure2-3ThePCRelectrophoresisofIbMBP4geneM:DL2000Marker,1~5:IbMBP4基因M:DL2000Marker,1~5:IbMBP4gene圖2-4IbMBP5基因PCR電泳圖Figure2-4ThePCRelectrophoresisofIbMBP5geneM:DL2000Marker,1:IbMBP5基因M:DL2000Marker,1:IbMBP5gene2.3.3陽性單克隆的篩選將PCR所得條帶經(jīng)過純化加A尾后,與克隆載體pMD19-T連接,轉入大腸桿菌感受態(tài)細胞后,利用菌落PCR對長出的單菌落進行陽性鑒定。如圖2-5至2-11所示,篩選獲得7個IbMBP1陽性克壟7個IbMBP2陽性克壟10個IbMBP4陽性克壟8個IbMBP5陽性克壟3個IbMBP6陽性克壟6個IbMBP7陽性克壟7個IbMBP8陽性克隆和8個IbMBP10陽性克攏圖2-5IbMBP1基因菌落PCRFigure2-5ThebacteriaPCRofIbMBP1geneM:DL2000Marker,1~7:七個IbMBP1陽性克隆M:DL2000Marker,1~7:sevenIbMBP1positiveclones
【參考文獻】:
期刊論文
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[8]不同類型甘薯品種主要經(jīng)濟性狀和營養(yǎng)成分差異[J]. 劉桂玲,張鵬,鄭建利,楊俊,趙豐玲,田昌庚,史春余. 中國糧油學報. 2012(02)
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碩士論文
[1]番茄SlMADS23-like基因的克隆及功能研究[D]. 封葉.重慶大學 2016
[2]外源ABA和ZT對小麥穗花發(fā)育調控效應的研究[D]. 戴曉琴.河北農業(yè)大學 2002
[3]中國甘薯(Ipomoea batatas)品種資源遺傳多樣性及分子鑒定研究[D]. 王士泉.山東師范大學 2002
本文編號:3374277
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