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不同發(fā)育時(shí)期茶籽轉(zhuǎn)錄組及其脂肪酸代謝相關(guān)基因分析

發(fā)布時(shí)間:2021-08-24 21:06
  茶樹(Camellia sinensis(L.)O.Kuntze.)種子(簡稱茶籽)作為茶葉生產(chǎn)過程的副產(chǎn)品,茶樹果實(shí)年產(chǎn)量高達(dá)100萬噸左右,除了少數(shù)用于繁殖以外,其余未被有效利用。茶籽的主要成分為脂肪、粗纖維、茶皂素等,其中種仁含油量24%~25%,其脂肪酸組成主要以單不飽和脂肪酸為主,具有較高的營養(yǎng)價(jià)值。本研究以‘鐵觀音’不同發(fā)育時(shí)期(幼果期,膨大期和成熟期)茶籽為試驗(yàn)材料,采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)篩選脂肪酸合成關(guān)鍵酶基因;結(jié)合實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),檢測這些基因在茶籽不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)量的變化;采用氣相色譜技術(shù)測定茶籽油的主要脂肪酸組分在茶籽發(fā)育過程中的相對含量變化。本研究結(jié)果明確了茶籽發(fā)育過程中脂肪酸合成代謝途徑中相關(guān)基因表達(dá)量變化的規(guī)律,及其相關(guān)產(chǎn)物相對含量變化,為深入研究茶籽脂肪酸調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ),同時(shí)也為果葉兩用茶樹品種的選育和茶籽資源的綜合利用提供理論參考。本研究主要結(jié)果如下:1.茶籽發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄組分析高通量測序結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)錄組共獲得36951條Unigenes。設(shè)計(jì)熒光引物,檢測實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)量并與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對比,驗(yàn)證了轉(zhuǎn)錄組準(zhǔn)確性。通過與GO和KEGG數(shù)據(jù)庫比對,從... 

【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:95 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

不同發(fā)育時(shí)期茶籽轉(zhuǎn)錄組及其脂肪酸代謝相關(guān)基因分析


堿基組成分布圖

分布圖,覆蓋度,基因,分布圖


第二章茶籽發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄組分析16圖2-4基因覆蓋度分布圖注:A)表示I期樣品測序的基因,B)表示II期樣品測序的基因,C)表示III期樣品測序的基因Fig2-4Distributionofgenes"coverageNote:A)representsthegenesofstageI,B)representsthegenesofstageII,C)representsthegenesofstageIII對鐵觀音種子3個(gè)發(fā)育時(shí)期Unigene的表達(dá)量進(jìn)行兩兩分析,在比較了Unigene數(shù)據(jù)集的基因表達(dá)水平,并鑒定了不同樣品中顯著的DEG(FDR<0.05)之后,發(fā)現(xiàn)I期(幼果期)到II期(膨大期)過程存在1836個(gè)基因表達(dá)量上升,3461個(gè)基因表達(dá)量下調(diào),II期(膨大期)到III期(成熟期)的過程中存在1855個(gè)基因表達(dá)量上升,5773個(gè)基因表達(dá)量下調(diào),I期(幼果期)到III期(成熟期)的過程中存在2585個(gè)基因表達(dá)量上升,8616個(gè)基因表達(dá)量下調(diào)(圖2-5),可以看出隨著種子發(fā)育到成熟期,上調(diào)的差異表達(dá)基因數(shù)量在減少,而下調(diào)的差異表達(dá)基因數(shù)量增加。其中α-亞麻酸途徑中的基因PLA2G16、DAD1表達(dá)量上調(diào)顯著,隨后表達(dá)量下調(diào);脂肪酸伸長途徑中基因MECR表達(dá)量上調(diào)顯著;在脂肪酸生物合成途徑中基因FabF、FabI表達(dá)量顯著上調(diào)。這些結(jié)果表明,鐵觀音種子的不同發(fā)育階段基因表達(dá)存在實(shí)質(zhì)性變化。

火山,樣品,基因,鐵觀音


不同發(fā)育時(shí)期茶籽轉(zhuǎn)錄組及其脂肪酸代謝相關(guān)基因分析17I期、II期和III期分別表示幼果期、果實(shí)膨大期和果實(shí)成熟期的鐵觀音種子,以下圖表同。圖2-5鐵觀音種子3個(gè)不同發(fā)育時(shí)期差異基因數(shù)StagesI,IIandIIIindicatethedevelopmentofTieguanyinseedinyoungfruit,growthstageandripestageFig.2-5NumberofDEGsinthreedifferentdevelopmentalstagesofTieguanyinseeds樣品間差異表達(dá)火山圖如圖2-6所示。火山圖中一個(gè)點(diǎn)代表一個(gè)基因,基因在兩個(gè)樣品中表達(dá)量差異倍數(shù)的對數(shù)值越大,說明其表達(dá)量的差異越大;錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)的負(fù)對數(shù)值越大,說明基因差異表達(dá)越明顯,篩選的差異基因越可靠。圖2-6樣品間差異表達(dá)火山圖注:A)代表I期與II期樣品間差異表達(dá)火山圖,B)代表I期與III期樣品間差異表達(dá)火山圖,C)代表II期與III期樣品間差異表達(dá)火山圖。篩選條件為FDR<0.05且|log2FC|>1綠色表示表達(dá)量下降,紅色表示表達(dá)量上升Fig2-6ThevolcanoplotofdifferencesbetweensamplesgenesexpressingNote:A)representsthedifferenceexpressionbetweenstagesIandII,B)representsthedifferenceexpressionbetweenstagesIandIII,C)representsthedifferenceexpressionbetweenstagesIIandIII.ThescreeningconditionwasFDR<0.05and|log2FC|>1Greenindicatesdecreasedexpressionandredindicatesincreasedexpression1836258518553461861657730200040006000800010000I期vsII期StagesIvsStagesIII期vsIII期StagesIvsStagesIIIII期vsIII期StagesIIvsStagesIII基因數(shù)NumberofGenes上調(diào)up下調(diào)down

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:3360723

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