水稻OsGRAS39基因的表達(dá)特征及基于CRISPR/Cas9技術(shù)的突變體創(chuàng)建
發(fā)布時(shí)間:2021-07-31 00:01
旨在探究水稻OsGRAS39(LOCOs10g22430.1)基因的功能,采用qRT-PCR技術(shù)分析OsGRAS39在水稻不同組織中及不同非生物脅迫條件、ABA和GA3處理下的表達(dá)情況,并基于CRISPR/Cas9技術(shù)創(chuàng)建OsGRAS39基因敲除突變體。qRT-PCR分析結(jié)果表明,OsGRAS39在所有檢測(cè)的組織中均表達(dá),其mRNA豐度在水稻幼苗中最高,然后依次是幼根、葉片,而在抽穗期水稻的葉鞘、穗、根和莖中相對(duì)較弱;OsGRAS39的表達(dá)受高溫脅迫抑制,受低溫、NaCl和ABA誘導(dǎo);在10%PEG6000處理下,其在所有處理時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)水平無(wú)顯著差異;在20μmol/L的GA3處理下,其表達(dá)水平在2~8 h下調(diào)而在24 h上調(diào)。另外,利用無(wú)縫克隆技術(shù)成功構(gòu)建了OsGRAS39基因的CRISPR/Cas9敲除載體pP1C.3-OsGRAS39-gRNA,并通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化獲得30株轉(zhuǎn)基因水稻株系。靶位點(diǎn)測(cè)序結(jié)果表明,30株轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性水稻苗中有8株檢測(cè)到不同類(lèi)型的突變,包括1個(gè)純合突變體,5個(gè)雙等位突變體和2個(gè)雜合...
【文章來(lái)源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
OsGRAS39的組織表達(dá)模式
在不同的逆境脅迫和激素的處理下,OsGRAS39的表達(dá)受到不同程度的影響。在42 ℃高溫處理下,OsGRAS39的表達(dá)在處理的最初2 h內(nèi)無(wú)顯著變化,在4 h后表達(dá)量顯著下調(diào)至初始表達(dá)量的40%以下(圖2-A)。OsGRAS39的表達(dá)受4℃低溫處理的誘導(dǎo),在1 h其表達(dá)豐度即顯著上調(diào)至初始量的2.5倍左右,在2 h其表達(dá)強(qiáng)度約為初始水平的5.3倍,為最高值;隨后其表達(dá)水平逐漸回落,在24 h其表達(dá)水平與初始值相當(dāng)(圖2-B)。OsGRAS39的表達(dá)受10% PEG6000處理的影響不大,其在所有處理時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)水平無(wú)顯著差異(圖2-C)。在100 mmol/L NaCl處理下,OsGRAS39的表達(dá)從0.5 h開(kāi)始即受到誘導(dǎo)顯著上調(diào),上調(diào)的幅度大都在2~3倍(圖2-D)。在100 μmol/L ABA處理下,OsGRAS39的表達(dá)量在1 h顯著上調(diào)至初始值的1.9倍,隨后回復(fù)至初始水平,到8,24 h再次顯著上調(diào)(圖2-E)。OsGRAS39的表達(dá)在2 h開(kāi)始受到20 μmol/L GA3的抑制,其表達(dá)量在8 h下調(diào)至最低點(diǎn),大約為初始值的22%,但在24 h其表達(dá)水平顯著上調(diào),約為初始值的1.9倍(圖2-F)。2.3 sgRNA靶點(diǎn)選擇和載體構(gòu)建
本研究采用無(wú)縫克隆的方法將sgRNA表達(dá)盒克隆到CRISPR/Cas9載體pP1c.3上。pP1c.3載體的結(jié)構(gòu)如圖3-A所示。水稻OsGRAS39基因結(jié)構(gòu)只有一個(gè)外顯子序列,為了獲得CRISPR/Cas9誘導(dǎo)的定點(diǎn)突變導(dǎo)致的功能缺失型突變體植株,本研究利用在線(xiàn)設(shè)計(jì)網(wǎng)站CRISPR-GE(http://skl.scau.edu.cn/)[34]分析篩選sgRNA靶位點(diǎn)。最終基因編輯的靶位點(diǎn)選擇在反義鏈靠近起始密碼子ATG的第290位堿基到271位堿基處(圖3-B),靶點(diǎn)序列GC含量為65%。參照CRISPR/Cas9植物基因敲除試劑盒說(shuō)明書(shū)上的方法,用引物U3p.3-F/Oligo-R擴(kuò)增出sgRNA克隆框,通過(guò)重組酶作用與線(xiàn)性化的載體pP1C.3重組構(gòu)建表達(dá)載體。重組載體經(jīng)測(cè)序確認(rèn)構(gòu)建正確,命名為pP1C.3-OsGRAS39-gRNA。然后將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入到農(nóng)桿菌EHA105中。2.4 轉(zhuǎn)基因植株的獲得及突變類(lèi)型分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶樹(shù)CsCIGR基因克隆及表達(dá)特性分析[J]. 王爽,王永鑫,王瑜,李輝,滕瑞敏,莊靜. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]水稻轉(zhuǎn)錄因子基因OsSHR2的表達(dá)特征及其在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)中的調(diào)控作用[J]. 張占田,孫雅菲,艾昊,羅聞?wù)?馮冰,孫文獻(xiàn),徐國(guó)華,孫淑斌. 中國(guó)水稻科學(xué). 2018(05)
[3]獨(dú)行菜GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族分析及LaSCL18基因克隆與冷相關(guān)性研究[J]. 李麗麗,曾衛(wèi)軍,李艷紅,葛風(fēng)偉,盧函,雷維,杜鈺,謝紅桃,趙和平,趙惠新. 分子植物育種. 2017(09)
[4]番茄GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族基因SIGLD1的克隆及VIGS載體構(gòu)建[J]. 牛義嶺,姜秀明,許向陽(yáng). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(08)
[5]葡萄SCARECROW Like 14-Like基因的表達(dá)特征及脅迫響應(yīng)研究[J]. 陳立勇,柴麗娟,陳尚武,馬會(huì)勤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(03)
[6]玉米ZmSCL7的克隆及功能研究[J]. 郭鵬,邢新,金華,董燕. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[7]佛手GRAS基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 石瑞,曹詣斌,陳文榮,郭衛(wèi)東. 浙江師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]胡楊SCL7基因及其啟動(dòng)子片段的克隆與分析[J]. 馬洪雙,夏新莉,尹偉倫. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
本文編號(hào):3312360
【文章來(lái)源】:華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2020,35(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
OsGRAS39的組織表達(dá)模式
在不同的逆境脅迫和激素的處理下,OsGRAS39的表達(dá)受到不同程度的影響。在42 ℃高溫處理下,OsGRAS39的表達(dá)在處理的最初2 h內(nèi)無(wú)顯著變化,在4 h后表達(dá)量顯著下調(diào)至初始表達(dá)量的40%以下(圖2-A)。OsGRAS39的表達(dá)受4℃低溫處理的誘導(dǎo),在1 h其表達(dá)豐度即顯著上調(diào)至初始量的2.5倍左右,在2 h其表達(dá)強(qiáng)度約為初始水平的5.3倍,為最高值;隨后其表達(dá)水平逐漸回落,在24 h其表達(dá)水平與初始值相當(dāng)(圖2-B)。OsGRAS39的表達(dá)受10% PEG6000處理的影響不大,其在所有處理時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)水平無(wú)顯著差異(圖2-C)。在100 mmol/L NaCl處理下,OsGRAS39的表達(dá)從0.5 h開(kāi)始即受到誘導(dǎo)顯著上調(diào),上調(diào)的幅度大都在2~3倍(圖2-D)。在100 μmol/L ABA處理下,OsGRAS39的表達(dá)量在1 h顯著上調(diào)至初始值的1.9倍,隨后回復(fù)至初始水平,到8,24 h再次顯著上調(diào)(圖2-E)。OsGRAS39的表達(dá)在2 h開(kāi)始受到20 μmol/L GA3的抑制,其表達(dá)量在8 h下調(diào)至最低點(diǎn),大約為初始值的22%,但在24 h其表達(dá)水平顯著上調(diào),約為初始值的1.9倍(圖2-F)。2.3 sgRNA靶點(diǎn)選擇和載體構(gòu)建
本研究采用無(wú)縫克隆的方法將sgRNA表達(dá)盒克隆到CRISPR/Cas9載體pP1c.3上。pP1c.3載體的結(jié)構(gòu)如圖3-A所示。水稻OsGRAS39基因結(jié)構(gòu)只有一個(gè)外顯子序列,為了獲得CRISPR/Cas9誘導(dǎo)的定點(diǎn)突變導(dǎo)致的功能缺失型突變體植株,本研究利用在線(xiàn)設(shè)計(jì)網(wǎng)站CRISPR-GE(http://skl.scau.edu.cn/)[34]分析篩選sgRNA靶位點(diǎn)。最終基因編輯的靶位點(diǎn)選擇在反義鏈靠近起始密碼子ATG的第290位堿基到271位堿基處(圖3-B),靶點(diǎn)序列GC含量為65%。參照CRISPR/Cas9植物基因敲除試劑盒說(shuō)明書(shū)上的方法,用引物U3p.3-F/Oligo-R擴(kuò)增出sgRNA克隆框,通過(guò)重組酶作用與線(xiàn)性化的載體pP1C.3重組構(gòu)建表達(dá)載體。重組載體經(jīng)測(cè)序確認(rèn)構(gòu)建正確,命名為pP1C.3-OsGRAS39-gRNA。然后將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入到農(nóng)桿菌EHA105中。2.4 轉(zhuǎn)基因植株的獲得及突變類(lèi)型分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶樹(shù)CsCIGR基因克隆及表達(dá)特性分析[J]. 王爽,王永鑫,王瑜,李輝,滕瑞敏,莊靜. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]水稻轉(zhuǎn)錄因子基因OsSHR2的表達(dá)特征及其在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)中的調(diào)控作用[J]. 張占田,孫雅菲,艾昊,羅聞?wù)?馮冰,孫文獻(xiàn),徐國(guó)華,孫淑斌. 中國(guó)水稻科學(xué). 2018(05)
[3]獨(dú)行菜GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族分析及LaSCL18基因克隆與冷相關(guān)性研究[J]. 李麗麗,曾衛(wèi)軍,李艷紅,葛風(fēng)偉,盧函,雷維,杜鈺,謝紅桃,趙和平,趙惠新. 分子植物育種. 2017(09)
[4]番茄GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族基因SIGLD1的克隆及VIGS載體構(gòu)建[J]. 牛義嶺,姜秀明,許向陽(yáng). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(08)
[5]葡萄SCARECROW Like 14-Like基因的表達(dá)特征及脅迫響應(yīng)研究[J]. 陳立勇,柴麗娟,陳尚武,馬會(huì)勤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(03)
[6]玉米ZmSCL7的克隆及功能研究[J]. 郭鵬,邢新,金華,董燕. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[7]佛手GRAS基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 石瑞,曹詣斌,陳文榮,郭衛(wèi)東. 浙江師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]胡楊SCL7基因及其啟動(dòng)子片段的克隆與分析[J]. 馬洪雙,夏新莉,尹偉倫. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
本文編號(hào):3312360
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