東農(nóng)冬麥1號響應(yīng)低溫脅迫的比較代謝組學(xué)研究
發(fā)布時間:2021-04-16 01:32
代謝組學(xué)分析是目前針對生物個體的代謝產(chǎn)物分析最有效的方法之一。本研究旨在探討冬小麥東農(nóng)冬麥1號在低溫生長條件下的代謝變化,為此采用目前較為先進(jìn)的GC-TOF/MS檢測技術(shù),對大田種植的冬小麥東農(nóng)冬麥1號在5℃、-10℃、-25℃下的分蘗節(jié)進(jìn)行了代謝物質(zhì)的測定,根據(jù)SIMCA軟件得到的數(shù)據(jù)降維結(jié)果,挑選出主要代謝產(chǎn)物。通過代謝物質(zhì)的鑒定可以初步為我們展現(xiàn)冬小麥東農(nóng)冬麥1號適應(yīng)低溫的代謝調(diào)節(jié)機(jī)制,為了使鑒定結(jié)果更具說服力,對GC-TOF/MS檢測的部分代表性代謝產(chǎn)物采取了生物學(xué)角度驗證,主要是參考各溫度的比對結(jié)果,選定差異顯著代謝通路中的關(guān)鍵代謝物質(zhì),并對相應(yīng)調(diào)控酶的基因進(jìn)行實時定量分析。主要研究結(jié)果如下:(1)建立了5℃、-10℃、-25℃下東農(nóng)冬麥號分蘗節(jié)的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫。不同溫度數(shù)據(jù)庫比對結(jié)果共得到419個非靶標(biāo)的代謝產(chǎn)物,其中差異顯著的代謝產(chǎn)物81個,依據(jù)HMDB數(shù)據(jù)庫進(jìn)行代謝產(chǎn)物分類及不同溫度下差異代謝物比對分析,得到了糖、氨基酸、氮、有機(jī)酸、核酸等相關(guān)代謝流程圖。(2)氨基酸代謝在低溫來臨后表現(xiàn)為,一部分隨溫度降低其相對含量逐漸升高,如Pro、Val等的含量升高顯著,增強了低溫...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中的位置
本實驗所選材料是由東北農(nóng)業(yè)大學(xué)小麥育種實驗室贈送的冬小麥(Triticum aestivum),東農(nóng)冬麥 1 號(Dongnongdongmai 1),此品種的特點是抵御-30°C 以下的低溫,且返可以保持在 85%以上[105]。東農(nóng)冬麥 1 號將冬小麥的種植范圍擴(kuò)大到了北緯 47°,使得黑省高寒地區(qū)種植冬小麥成為了可能。2.2 試驗設(shè)計和取材東農(nóng)冬麥 1 號種子于 2015 年 9 月 8 日播種于黑龍江省哈爾濱市香坊區(qū)東北農(nóng)業(yè)大學(xué)試(45°7′N,126°6′E),采用小區(qū)種植方式,各小區(qū)行長 150 cm,行距 25 cm,每行播種 150 粒,深播 5 cm。田間常規(guī)管理,并持續(xù)監(jiān)測田間溫度變化,待溫度達(dá)到預(yù)先選定的節(jié)點(5°C、-10°C 和-25°C)時進(jìn)行樣品的采集。如圖 2-1 所示,當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度均值為 5°C 時進(jìn)行對照組樣品的采集,當(dāng)最低平均溫度為 5°C 時,白天最高溫度仍可達(dá)5°C 左右,冬小麥可正常生長;依據(jù)本課題組前期試驗證實,5°C 是大田幼苗對于低溫適一個溫度節(jié)點,發(fā)現(xiàn)此時與抗寒相關(guān)的物質(zhì)會開始積累;當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度的平均值10°C 時進(jìn)行試驗組 1 的樣品采集,依據(jù)本課題組前期的試驗數(shù)據(jù)證實,此時冬小麥東農(nóng) 1 號依舊可以進(jìn)行一些代謝反應(yīng),但隨著溫度的繼續(xù)降低冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號會進(jìn)入到狀態(tài),因此-10°C 也被認(rèn)為是溫度節(jié)點;當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度的平均值為-25°C 時進(jìn)行試
結(jié)果與分析結(jié)果與分析1 GC-TOF/MS 檢測冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號分蘗節(jié)樣品上機(jī)檢測,共得到 442 個代謝產(chǎn)物的峰。如圖 3-1 所圖 A 為 5°C(對照組)的上機(jī)檢測結(jié)果,圖 B 為-10°C(實驗組 1)的測定結(jié)果,25°C(實驗組 2)的測定結(jié)果,圖 D 為 3 組上機(jī)檢測后的比較結(jié)果。圖 A、B、C 中 6 種顏色的離子流表示 6 次生物學(xué)重復(fù);圖中縱坐標(biāo)表示檢測的峰強度,每個峰代多個代謝物,各個峰的強度所代表的是該物質(zhì)的相對含量;橫坐標(biāo)為保留時間,是在檢測過程中達(dá)到最大濃度時所需要的時間。因此,從圖 D 我們可直觀看出三個溫,冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號分蘗節(jié)中所提取到的代謝物差異比較明顯,即同一位置的峰峰的數(shù)量是有明顯差異的。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東農(nóng)冬麥1號TabZIP1基因的生物信息學(xué)分析及低溫和ABA對其表達(dá)模式的影響[J]. 呂巖,蒼晶,盧秋巍,楊寧,馮明芳,孟德義,劉增兵,彭瞰看,徐慶華,張達(dá),于晶. 麥類作物學(xué)報. 2017(01)
[2]植物響應(yīng)鹽脅迫組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李煥勇,楊秀艷,唐曉倩,張華新. 西北植物學(xué)報. 2016(12)
[3]冬小麥miR398前體的克隆及其在低溫條件下對靶基因CSD1表達(dá)的調(diào)控[J]. 梅琳,徐慶華,蒼晶,盧秋巍,于晶,張達(dá),馮明芳,張舒馳,梁桂花,張超. 麥類作物學(xué)報. 2016(11)
[4]四種常綠闊葉樹種的抗寒性[J]. 王娜,王奎玲,劉慶華,劉慶超. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2016(10)
[5]雙重化控對春玉米灌漿期穗位葉和籽粒蔗糖代謝關(guān)鍵酶活性的影響[J]. 李光彥,王慶燕,許艷麗,盧霖,焦瀏,董學(xué)瑞,董志強. 作物學(xué)報. 2016(08)
[6]植物在低溫脅迫下的糖代謝研究進(jìn)展[J]. 孫永梅,劉麗杰,馮明芳,王軍虹,蒼晶,李速,包雨卓,王秀田. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(07)
[7]冬小麥抗寒相關(guān)microRNA生物信息學(xué)預(yù)測分析與表達(dá)特征的驗證[J]. 盧秋巍,徐慶華,鐘昊,蒼晶,于晶,鄭成成,吳冰,朱會杰,馮明芳,梅琳,孫仙澤. 植物生理學(xué)報. 2015(05)
[8]植物莽草酸途徑EPSPS蛋白的分子進(jìn)化和基因結(jié)構(gòu)分析[J]. 鞏元勇,郭書巧,束紅梅,倪萬潮,帕爾哈提·買買提,沈新蓮,徐鵬,張香桂,郭琪. 植物學(xué)報. 2015(03)
[9]冷害后植物生理變化及外源物質(zhì)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 趙黎明,李明,鄭殿峰,王士強,顧春梅,那永光,解保勝. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2015(12)
[10]代謝組學(xué)在植物逆境脅迫研究中的應(yīng)用[J]. 倪建偉,楊秀艷,張華新,倪元穎,武海雯,魏琦. 世界林業(yè)研究. 2014(05)
博士論文
[1]獼猴桃肌醇代謝對抗逆性和抗壞血酸形成的影響[D]. 崔萌.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[2]冬小麥東農(nóng)冬麥1號抗寒拌種劑的研制與應(yīng)用[D]. 王興.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]東農(nóng)冬麥1號越冬期間的microRNA高通量測序及生物信息學(xué)分析[D]. 盧寶偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]水楊酸處理對低溫脅迫下冬小麥蔗糖代謝的影響[D]. 吳冰.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]寒地冬小麥抗氧化指標(biāo)低溫響應(yīng)及GST基因的差異表達(dá)分析[D]. 孫蕊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]干旱脅迫下噴施尿素對玉米甜菜堿合成代謝的影響及其與一氧化氮信號的關(guān)系[D]. 阮志.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[4]外源水楊酸提高小麥抗寒性的應(yīng)用研究[D]. 李速.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]旱澇—低溫交叉脅迫對小麥抗寒性的影響[D]. 李懷偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]轉(zhuǎn)玉米ZmPIS基因棉花獲得及其抗逆性的初步研究[D]. 王雷.山東大學(xué) 2007
本文編號:3140482
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中的位置
本實驗所選材料是由東北農(nóng)業(yè)大學(xué)小麥育種實驗室贈送的冬小麥(Triticum aestivum),東農(nóng)冬麥 1 號(Dongnongdongmai 1),此品種的特點是抵御-30°C 以下的低溫,且返可以保持在 85%以上[105]。東農(nóng)冬麥 1 號將冬小麥的種植范圍擴(kuò)大到了北緯 47°,使得黑省高寒地區(qū)種植冬小麥成為了可能。2.2 試驗設(shè)計和取材東農(nóng)冬麥 1 號種子于 2015 年 9 月 8 日播種于黑龍江省哈爾濱市香坊區(qū)東北農(nóng)業(yè)大學(xué)試(45°7′N,126°6′E),采用小區(qū)種植方式,各小區(qū)行長 150 cm,行距 25 cm,每行播種 150 粒,深播 5 cm。田間常規(guī)管理,并持續(xù)監(jiān)測田間溫度變化,待溫度達(dá)到預(yù)先選定的節(jié)點(5°C、-10°C 和-25°C)時進(jìn)行樣品的采集。如圖 2-1 所示,當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度均值為 5°C 時進(jìn)行對照組樣品的采集,當(dāng)最低平均溫度為 5°C 時,白天最高溫度仍可達(dá)5°C 左右,冬小麥可正常生長;依據(jù)本課題組前期試驗證實,5°C 是大田幼苗對于低溫適一個溫度節(jié)點,發(fā)現(xiàn)此時與抗寒相關(guān)的物質(zhì)會開始積累;當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度的平均值10°C 時進(jìn)行試驗組 1 的樣品采集,依據(jù)本課題組前期的試驗數(shù)據(jù)證實,此時冬小麥東農(nóng) 1 號依舊可以進(jìn)行一些代謝反應(yīng),但隨著溫度的繼續(xù)降低冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號會進(jìn)入到狀態(tài),因此-10°C 也被認(rèn)為是溫度節(jié)點;當(dāng)連續(xù) 10 d 最低溫度的平均值為-25°C 時進(jìn)行試
結(jié)果與分析結(jié)果與分析1 GC-TOF/MS 檢測冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號分蘗節(jié)樣品上機(jī)檢測,共得到 442 個代謝產(chǎn)物的峰。如圖 3-1 所圖 A 為 5°C(對照組)的上機(jī)檢測結(jié)果,圖 B 為-10°C(實驗組 1)的測定結(jié)果,25°C(實驗組 2)的測定結(jié)果,圖 D 為 3 組上機(jī)檢測后的比較結(jié)果。圖 A、B、C 中 6 種顏色的離子流表示 6 次生物學(xué)重復(fù);圖中縱坐標(biāo)表示檢測的峰強度,每個峰代多個代謝物,各個峰的強度所代表的是該物質(zhì)的相對含量;橫坐標(biāo)為保留時間,是在檢測過程中達(dá)到最大濃度時所需要的時間。因此,從圖 D 我們可直觀看出三個溫,冬小麥東農(nóng)冬麥 1 號分蘗節(jié)中所提取到的代謝物差異比較明顯,即同一位置的峰峰的數(shù)量是有明顯差異的。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]東農(nóng)冬麥1號TabZIP1基因的生物信息學(xué)分析及低溫和ABA對其表達(dá)模式的影響[J]. 呂巖,蒼晶,盧秋巍,楊寧,馮明芳,孟德義,劉增兵,彭瞰看,徐慶華,張達(dá),于晶. 麥類作物學(xué)報. 2017(01)
[2]植物響應(yīng)鹽脅迫組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李煥勇,楊秀艷,唐曉倩,張華新. 西北植物學(xué)報. 2016(12)
[3]冬小麥miR398前體的克隆及其在低溫條件下對靶基因CSD1表達(dá)的調(diào)控[J]. 梅琳,徐慶華,蒼晶,盧秋巍,于晶,張達(dá),馮明芳,張舒馳,梁桂花,張超. 麥類作物學(xué)報. 2016(11)
[4]四種常綠闊葉樹種的抗寒性[J]. 王娜,王奎玲,劉慶華,劉慶超. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2016(10)
[5]雙重化控對春玉米灌漿期穗位葉和籽粒蔗糖代謝關(guān)鍵酶活性的影響[J]. 李光彥,王慶燕,許艷麗,盧霖,焦瀏,董學(xué)瑞,董志強. 作物學(xué)報. 2016(08)
[6]植物在低溫脅迫下的糖代謝研究進(jìn)展[J]. 孫永梅,劉麗杰,馮明芳,王軍虹,蒼晶,李速,包雨卓,王秀田. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(07)
[7]冬小麥抗寒相關(guān)microRNA生物信息學(xué)預(yù)測分析與表達(dá)特征的驗證[J]. 盧秋巍,徐慶華,鐘昊,蒼晶,于晶,鄭成成,吳冰,朱會杰,馮明芳,梅琳,孫仙澤. 植物生理學(xué)報. 2015(05)
[8]植物莽草酸途徑EPSPS蛋白的分子進(jìn)化和基因結(jié)構(gòu)分析[J]. 鞏元勇,郭書巧,束紅梅,倪萬潮,帕爾哈提·買買提,沈新蓮,徐鵬,張香桂,郭琪. 植物學(xué)報. 2015(03)
[9]冷害后植物生理變化及外源物質(zhì)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 趙黎明,李明,鄭殿峰,王士強,顧春梅,那永光,解保勝. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2015(12)
[10]代謝組學(xué)在植物逆境脅迫研究中的應(yīng)用[J]. 倪建偉,楊秀艷,張華新,倪元穎,武海雯,魏琦. 世界林業(yè)研究. 2014(05)
博士論文
[1]獼猴桃肌醇代謝對抗逆性和抗壞血酸形成的影響[D]. 崔萌.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[2]冬小麥東農(nóng)冬麥1號抗寒拌種劑的研制與應(yīng)用[D]. 王興.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]東農(nóng)冬麥1號越冬期間的microRNA高通量測序及生物信息學(xué)分析[D]. 盧寶偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]水楊酸處理對低溫脅迫下冬小麥蔗糖代謝的影響[D]. 吳冰.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]寒地冬小麥抗氧化指標(biāo)低溫響應(yīng)及GST基因的差異表達(dá)分析[D]. 孫蕊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]干旱脅迫下噴施尿素對玉米甜菜堿合成代謝的影響及其與一氧化氮信號的關(guān)系[D]. 阮志.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[4]外源水楊酸提高小麥抗寒性的應(yīng)用研究[D]. 李速.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]旱澇—低溫交叉脅迫對小麥抗寒性的影響[D]. 李懷偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]轉(zhuǎn)玉米ZmPIS基因棉花獲得及其抗逆性的初步研究[D]. 王雷.山東大學(xué) 2007
本文編號:3140482
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