根據(jù)從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)轉(zhuǎn)向生殖生長(zhǎng)的不同需求,甘藍(lán)型油菜可以被分為三種生態(tài)型:冬性、半冬性和春性;其中冬性甘藍(lán)型油菜主要分布在歐洲需要一個(gè)月以上的低溫（小于4℃）,我國(guó)主要種植的是半冬性和春性甘藍(lán)型油菜,兩者沒(méi)有嚴(yán)格的界限,所以存在一些廣適性品種。特定的地區(qū)只適宜特定生態(tài)型的生長(zhǎng),為了開(kāi)發(fā)能檢測(cè)不同生態(tài)型的標(biāo)記,并為判定油菜適宜種植地區(qū)提供參考,本研究首先利用全基因組關(guān)聯(lián)分析找到了與開(kāi)花時(shí)間相關(guān)的位點(diǎn),并結(jié)合已發(fā)表的標(biāo)記,開(kāi)發(fā)出了7個(gè)能為油菜生態(tài)型判定提供參考的PCR標(biāo)記。主要試驗(yàn)結(jié)果如下:利用實(shí)驗(yàn)室收集的495份甘藍(lán)型油菜自交系組成的自然群體,并結(jié)合先前提供的八個(gè)環(huán)境表型數(shù)據(jù)和郭亮老師課題組提供的基因型數(shù)據(jù),我們成功檢測(cè)到了166個(gè)與開(kāi)花時(shí)間相關(guān)的SNP/InDel位點(diǎn)。其中,5個(gè)位點(diǎn)能在多個(gè)環(huán)境當(dāng)中重復(fù)檢測(cè)到,這些位點(diǎn)附近有擬南芥FLC、FRI、EMF2同源的油菜基因;另外,有21個(gè)由毗鄰（物理距離小于150kb）的SNP組成的區(qū)段,其中也包括了許多與擬南芥開(kāi)花基因同源的油菜基因。從495份甘藍(lán)型油菜自交系材料中選出452份進(jìn)行生態(tài)型分類,將全基因組關(guān)聯(lián)分析得到的166個(gè)標(biāo)記與前人研究中的... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

擬南芥開(kāi)花調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖(JungandMuller2009)

華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018 屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文要是根據(jù)農(nóng)業(yè)部的《油菜優(yōu)勢(shì)區(qū)域布局規(guī)劃（2008~2015 年）》和我國(guó)油菜生產(chǎn)現(xiàn)狀劃分的，分為長(zhǎng)江流域半冬性油菜區(qū)、北方春油菜區(qū)、黃淮流域冬性油菜區(qū)。長(zhǎng)江流域半冬性油菜區(qū)包括上海、浙江、江蘇、安徽、湖北、江西、湖南、四川、貴州、云南、重慶、河南信陽(yáng)、陜西漢中 13 個(gè)省市地區(qū)（圖 1.2）。北方春油菜區(qū)包括青海、甘肅、內(nèi)蒙、新疆。黃淮流域冬性油菜主要包括陜西、河南，其中不包括漢中和信陽(yáng)地區(qū)（殷艷等 2010）。不同地域由于光照和溫度的條件不同，使得只有特定生態(tài)型的油菜才能適應(yīng)當(dāng)?shù)氐纳L(zhǎng)條件。

圖 3.1 8 個(gè)環(huán)境的開(kāi)花期箱圖Fig. 3.1 The box-plot of flowering times in eight environments.2 GWAS 結(jié)果分析.2.1 模型選擇在數(shù)據(jù)模型方面，我們選擇了兩種模型（LR 和 LMM）進(jìn)行比較（圖 3.2 和.3）：用這兩種模型分別分析了 8 個(gè)環(huán)境的數(shù)據(jù)，結(jié)果說(shuō)明 LMM 模型更適合。，綠線表示數(shù)據(jù)的擬合曲線，紅線為理想數(shù)據(jù)，綠線越靠近紅線就說(shuō)明擬合效好，若綠線偏離紅線則說(shuō)明觀測(cè)值偏離期望值，假陽(yáng)性率較高。通過(guò) QQ 圖的，再比較兩種模型獲得的曼哈頓圖顯示：兩個(gè)模型獲得的圖片比較類似，LR 模出的與表型關(guān)聯(lián)的 SNP 位點(diǎn)較 LMM 模型偏多，但這些位點(diǎn)可能為假陽(yáng)性位點(diǎn)合考慮，我們使用 LMM 模型進(jìn)行下一步分析。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]玉米穗位高全基因組關(guān)聯(lián)分析及其候選基因預(yù)測(cè)[J]. 李博,張煥欣,楊小艷,呂穎穎,江培順,郝轉(zhuǎn)芳,呂香玲,王宏偉,翁建峰.  作物雜志. 2013(02)
[2]擬南芥光周期調(diào)控開(kāi)花的研究進(jìn)展[J]. 趙淑清,羅志鵬,李昱.  山西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(02)
[3]控制擬南芥和水稻開(kāi)花時(shí)間光周期途徑的分子機(jī)制[J]. 彭凌濤.  植物生理學(xué)通訊. 2006(06)
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[6]廣適性小麥品種選育探討[J]. 孫道杰,馮毅,王輝.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2006(01)

博士論文
[1]擬南芥核孔蛋白Nup96的鑒定及其在開(kāi)花時(shí)間和生物鐘調(diào)控中的功能分析[D]. 王旭.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014

碩士論文
[1]水稻農(nóng)藝和品質(zhì)若干性狀的全基因組初步關(guān)聯(lián)分析[D]. 唐富福.浙江大學(xué) 2013
[2]利用重疊導(dǎo)入系定位油菜開(kāi)花期相關(guān)基因[D]. 洪寶華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]甘藍(lán)型油菜種子硫苷含量的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊巍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3064307