果糖激酶類似蛋白1,2與硫氧還蛋白Z互作調(diào)控水稻葉綠體發(fā)育
發(fā)布時(shí)間:2021-02-24 10:11
葉綠體基因的轉(zhuǎn)錄需要兩種類似原核的RNA聚合酶,質(zhì)體編碼的RNA聚合酶(PEP)以及核基因編碼的RNA聚合酶(NEP)。PEP主要負(fù)責(zé)光合作用相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄,而NEP更多的負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄看家基因。前期研究中我們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)高溫敏感的白化突變體hsa1,圖位克隆結(jié)果顯示目的基因編碼果糖激酶類似蛋白FLN2,調(diào)控PEP轉(zhuǎn)錄基因的表達(dá),進(jìn)而影響水稻葉綠體的發(fā)育。然而,水稻中的果糖激酶類似蛋白參與調(diào)控葉綠體合成的分子機(jī)制尚有待進(jìn)一步研究。經(jīng)過同源比對(duì),我們發(fā)現(xiàn)HSA1在水稻中有一個(gè)高度同源的蛋白FLN1。在此基礎(chǔ)上本研究主要以HSA1和FLN1為誘餌蛋白,對(duì)水稻幼苗cDNA酵母文庫進(jìn)行互作篩選,并通過體內(nèi)及體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證互作的真實(shí)性,進(jìn)而探索水稻葉綠體發(fā)育的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),本文的研究結(jié)果如下:1.我們利用構(gòu)建好的水稻幼苗cDNA的酵母文庫,以O(shè)sFLN1BD和OsHSA1BD為誘餌載體對(duì)該文庫進(jìn)行篩選,共篩到與OsFLN1BD互作的陽性克隆32個(gè),與OsHSA1BD互作的陽性克隆60個(gè)。測(cè)序及讀碼框分析后OsFLN1BD共找到5個(gè)互作蛋白編碼基因,而Os HSA1BD共找到21個(gè)互作蛋白編碼基因,其中LO...
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
體外與體內(nèi)的OsFLN1和HSA1與OsTRXz的互作驗(yàn)證(A)His-OsFLN1,His-HSA1和GST-OsTRXz的體外互作驗(yàn)證
圖 3.4:OsTRXz 葉綠體定位信號(hào)肽的確定關(guān)亞細(xì)胞定位結(jié)果。從上到下依次是:GFP 空對(duì)照;OsTRXz 的定位結(jié)果;將 OsT列去除后 OsTRXz 的定位結(jié)果;OsTRXz 蛋白中前 56 個(gè)氨基酸序列的定位結(jié)果。Figure 3.4: Chloroplast localization signal peptide of OsTRXz of subcellular localization of OsTRXz related. From top to bottom, the following are: Gof OsTRXz; the result of OsTRXz protein after removing the first 56 amino acid sequencino acid sequences in OsTRXz proteinTRXz 功能缺失會(huì)導(dǎo)致苗期白化并致死LN1 與 HSA1 參與葉綠體的生物合成。因此我們推測(cè)探究與 OsFLN1 可能也具有相似的功能,影響葉綠體的發(fā)育。利用 CRISPR/Cas9 技術(shù)我定點(diǎn)突變。在 OsTRXz 基因組第二外顯子處,我們選擇了 GATTTCTACG敲除的靶序列,利用定點(diǎn)突變構(gòu)建引物 TRXz-F: ggcaGATTTCTACGCG aaacCACCACGTCGCGTAGAAATC 將該序列克隆至中間載體 pSK-gRN切 pSK-gRNA-TRXz 載體,回收 565bp 的目的片段,與 BamHI/Kas9 載體連接,測(cè)序正確后獲得 OsTRXz 定點(diǎn)突變載體 pTRXzcas9-2,
圖 3.5:CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的 OsTRXz 定點(diǎn)缺失突變體(A) 對(duì) CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的 OsTRXz 定點(diǎn)缺失突變體進(jìn)行測(cè)序分析,標(biāo)藍(lán)字母為 Cas9/sgRNA 復(fù)合體靶序列,PAM 位點(diǎn)標(biāo)記為紅色。在 trxz 突變體中,對(duì)比原序列缺失的核苷酸用紅色連字符代替,插顯示為綠色。(B) trxz 定點(diǎn)突變體的苗期表型圖。Figure 3.5: Mutations of OsTRXz mediated by CRISPR/Cas9(A) Confirmation of clustered regularly interspersed short palindromic repeats (CRISPR) / single guide RN(Cas9/sgRNA)-mediated OsTRXz deletion in trxz plants. The 20-nt OsTRXz target sequence of the Cas9/sgRNis underlined in blue, and the pulse amplitude modulation (PAM) site is indicated in red. For the OsTRXz sequdetermined in trxz plants, deleted nucleotides are depicted as red dots, whereas substituted and inserted nucleoshown in green. (B) Phenotype of trxz seedlings.3.6 trxz 突變體表型分析針對(duì) trxz 的白化表型,我們對(duì) trxz 突變體中葉綠素含量進(jìn)行了測(cè)定。結(jié)果顯示,與比,trxz 中葉綠素含量顯著降低(圖 3.6A)。為了確定 trxz 突變體中 OsTRXz 功能缺失發(fā)育的影響,我們將三葉期 trxz 突變體中的葉綠體提取后進(jìn)行掃描電鏡觀察,同時(shí)也將葉綠體結(jié)構(gòu)作為對(duì)照。結(jié)果顯示,野生型葉綠體結(jié)構(gòu)正常,基粒片層密集排列;然而在
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]FRUCTOKINASE-LIKE PROTEIN 1 interacts with TRXz to regulate chloroplast development in rice[J]. Lei He,Sen Zhang,Zhennan Qiu,Juan Zhao,Wendan Nie,Haiyan Lin,Zhengge Zhu,Dali Zeng,Qian Qian,Li Zhu. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(02)
[2]甘藍(lán)型油菜溫敏GMS TE5A幼蕾酵母雙雜交cDNA文庫的構(gòu)建及篩選[J]. 李可琪,王莎莎,曾新華,閆曉紅,吳剛. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]植物葉綠體發(fā)育及調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 李保珠,趙孝亮,彭雷. 植物學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)的機(jī)制[J]. 曾喆,胡勇,劉祥林. 山西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(02)
[5]酵母雙雜交系統(tǒng)的改進(jìn)和發(fā)展[J]. 石海英,李世訪,張俊艷. 韶關(guān)學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(09)
[6]酵母雙雜交系統(tǒng)及發(fā)展[J]. 毛健民,李季平. 周口師范高等專科學(xué)校學(xué)報(bào). 2002(02)
[7]玉米葉綠體atpB及atpE基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 王振國(guó),魏家綿,沈允鋼. 植物生理學(xué)報(bào). 1995(03)
[8]核編碼葉綠體蛋白中的轉(zhuǎn)運(yùn)肽[J]. 吳光耀. 植物生理學(xué)通訊. 1991(03)
博士論文
[1]水稻葉綠體缺陷突變體wsl3的基因克隆與功能研究[D]. 王立偉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]葉綠素a超快過程動(dòng)力學(xué)研究[D]. 石英.中國(guó)科學(xué)院研究生院(大連化學(xué)物理研究所) 2005
碩士論文
[1]水稻苗期白化致死突變基因asl4的圖位克隆與功能初步分析[D]. 潘倩文.上海師范大學(xué) 2015
[2]pTAC7調(diào)控?cái)M南芥葉綠基因表達(dá)的機(jī)理研究[D]. 葉琳珊.上海師范大學(xué) 2015
[3]兩個(gè)水稻葉色突變體的鑒定和基因定位[D]. 何穎紅.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[4]葉綠體基因編碼蛋白質(zhì)在水稻葉片生長(zhǎng)過程中的表達(dá)研究[D]. 蘭金蘋.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]質(zhì)體轉(zhuǎn)錄激活基因pTAC7的圖位克隆與功能研究[D]. 蘆楊.上海師范大學(xué) 2010
本文編號(hào):3049215
【文章來源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
體外與體內(nèi)的OsFLN1和HSA1與OsTRXz的互作驗(yàn)證(A)His-OsFLN1,His-HSA1和GST-OsTRXz的體外互作驗(yàn)證
圖 3.4:OsTRXz 葉綠體定位信號(hào)肽的確定關(guān)亞細(xì)胞定位結(jié)果。從上到下依次是:GFP 空對(duì)照;OsTRXz 的定位結(jié)果;將 OsT列去除后 OsTRXz 的定位結(jié)果;OsTRXz 蛋白中前 56 個(gè)氨基酸序列的定位結(jié)果。Figure 3.4: Chloroplast localization signal peptide of OsTRXz of subcellular localization of OsTRXz related. From top to bottom, the following are: Gof OsTRXz; the result of OsTRXz protein after removing the first 56 amino acid sequencino acid sequences in OsTRXz proteinTRXz 功能缺失會(huì)導(dǎo)致苗期白化并致死LN1 與 HSA1 參與葉綠體的生物合成。因此我們推測(cè)探究與 OsFLN1 可能也具有相似的功能,影響葉綠體的發(fā)育。利用 CRISPR/Cas9 技術(shù)我定點(diǎn)突變。在 OsTRXz 基因組第二外顯子處,我們選擇了 GATTTCTACG敲除的靶序列,利用定點(diǎn)突變構(gòu)建引物 TRXz-F: ggcaGATTTCTACGCG aaacCACCACGTCGCGTAGAAATC 將該序列克隆至中間載體 pSK-gRN切 pSK-gRNA-TRXz 載體,回收 565bp 的目的片段,與 BamHI/Kas9 載體連接,測(cè)序正確后獲得 OsTRXz 定點(diǎn)突變載體 pTRXzcas9-2,
圖 3.5:CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的 OsTRXz 定點(diǎn)缺失突變體(A) 對(duì) CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的 OsTRXz 定點(diǎn)缺失突變體進(jìn)行測(cè)序分析,標(biāo)藍(lán)字母為 Cas9/sgRNA 復(fù)合體靶序列,PAM 位點(diǎn)標(biāo)記為紅色。在 trxz 突變體中,對(duì)比原序列缺失的核苷酸用紅色連字符代替,插顯示為綠色。(B) trxz 定點(diǎn)突變體的苗期表型圖。Figure 3.5: Mutations of OsTRXz mediated by CRISPR/Cas9(A) Confirmation of clustered regularly interspersed short palindromic repeats (CRISPR) / single guide RN(Cas9/sgRNA)-mediated OsTRXz deletion in trxz plants. The 20-nt OsTRXz target sequence of the Cas9/sgRNis underlined in blue, and the pulse amplitude modulation (PAM) site is indicated in red. For the OsTRXz sequdetermined in trxz plants, deleted nucleotides are depicted as red dots, whereas substituted and inserted nucleoshown in green. (B) Phenotype of trxz seedlings.3.6 trxz 突變體表型分析針對(duì) trxz 的白化表型,我們對(duì) trxz 突變體中葉綠素含量進(jìn)行了測(cè)定。結(jié)果顯示,與比,trxz 中葉綠素含量顯著降低(圖 3.6A)。為了確定 trxz 突變體中 OsTRXz 功能缺失發(fā)育的影響,我們將三葉期 trxz 突變體中的葉綠體提取后進(jìn)行掃描電鏡觀察,同時(shí)也將葉綠體結(jié)構(gòu)作為對(duì)照。結(jié)果顯示,野生型葉綠體結(jié)構(gòu)正常,基粒片層密集排列;然而在
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]FRUCTOKINASE-LIKE PROTEIN 1 interacts with TRXz to regulate chloroplast development in rice[J]. Lei He,Sen Zhang,Zhennan Qiu,Juan Zhao,Wendan Nie,Haiyan Lin,Zhengge Zhu,Dali Zeng,Qian Qian,Li Zhu. Journal of Integrative Plant Biology. 2018(02)
[2]甘藍(lán)型油菜溫敏GMS TE5A幼蕾酵母雙雜交cDNA文庫的構(gòu)建及篩選[J]. 李可琪,王莎莎,曾新華,閆曉紅,吳剛. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]植物葉綠體發(fā)育及調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 李保珠,趙孝亮,彭雷. 植物學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)的機(jī)制[J]. 曾喆,胡勇,劉祥林. 山西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(02)
[5]酵母雙雜交系統(tǒng)的改進(jìn)和發(fā)展[J]. 石海英,李世訪,張俊艷. 韶關(guān)學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(09)
[6]酵母雙雜交系統(tǒng)及發(fā)展[J]. 毛健民,李季平. 周口師范高等專科學(xué)校學(xué)報(bào). 2002(02)
[7]玉米葉綠體atpB及atpE基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 王振國(guó),魏家綿,沈允鋼. 植物生理學(xué)報(bào). 1995(03)
[8]核編碼葉綠體蛋白中的轉(zhuǎn)運(yùn)肽[J]. 吳光耀. 植物生理學(xué)通訊. 1991(03)
博士論文
[1]水稻葉綠體缺陷突變體wsl3的基因克隆與功能研究[D]. 王立偉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]葉綠素a超快過程動(dòng)力學(xué)研究[D]. 石英.中國(guó)科學(xué)院研究生院(大連化學(xué)物理研究所) 2005
碩士論文
[1]水稻苗期白化致死突變基因asl4的圖位克隆與功能初步分析[D]. 潘倩文.上海師范大學(xué) 2015
[2]pTAC7調(diào)控?cái)M南芥葉綠基因表達(dá)的機(jī)理研究[D]. 葉琳珊.上海師范大學(xué) 2015
[3]兩個(gè)水稻葉色突變體的鑒定和基因定位[D]. 何穎紅.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[4]葉綠體基因編碼蛋白質(zhì)在水稻葉片生長(zhǎng)過程中的表達(dá)研究[D]. 蘭金蘋.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]質(zhì)體轉(zhuǎn)錄激活基因pTAC7的圖位克隆與功能研究[D]. 蘆楊.上海師范大學(xué) 2010
本文編號(hào):3049215
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