中棉所63苗期雜種優(yōu)勢的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時間:2021-02-24 08:37
雜種優(yōu)勢通常是指雜種后代在遺傳上優(yōu)于其親本的現(xiàn)象,是傳統(tǒng)育種中重要的育種應(yīng)用工具。強優(yōu)勢雜交棉中棉所63與母本中9053及父本sGK9708相比具有優(yōu)良的生產(chǎn)性狀。本研究以中棉所63、母本中9053及父本sGK9708三葉期植株為材料,首先統(tǒng)計并比較一批隨機三葉期中棉所63與親本之間的整株個體鮮重、干重以及根部鮮重、干重的數(shù)據(jù);其次通過高通量測序方法檢測三種材料在轉(zhuǎn)錄水平上的差異,進一步發(fā)掘mRNA及l(fā)ncRNA轉(zhuǎn)錄水平與雜種優(yōu)勢的關(guān)系。基于雜種優(yōu)勢的上位假說,本研究對中棉所63中表達量顯著高于親本或顯著低于親本的基因進一步進行GO分類和KEGG通路分析,以解釋有哪些基因在三葉期參與了雜種優(yōu)勢的形成;最后我通過熒光定量PCR的方法進一步驗證了45個在雜種優(yōu)勢形成過程中顯著變化的基因。研究結(jié)果表明:在三葉期,中棉所63整株個體的鮮重、干重與親本相比均優(yōu)于親本,同時根系鮮重、干重也優(yōu)于親本,可見中棉所63在苗期植株整體及根系發(fā)育均較親本發(fā)達。高通量測序數(shù)據(jù)表明:中棉所63與父本之間顯著上調(diào)的差異表達轉(zhuǎn)錄本(包含lncRNA及mRNA)有13117個,顯著下調(diào)的差異表達轉(zhuǎn)錄本有10674個;...
【文章來源】:河南大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本三葉期采樣照片
圖 3-4 總 RNA 電泳檢測結(jié)果9708 總 RNA 樣品;泳道 4-6 為中 9053 總 RNA 樣品;泳道 7-9 是中棉所樣品;M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results完整性檢測NA 文庫測序之前,需要利用 Agilent 2100 進行 RNA 樣品的完本的一個 RNA 樣品為例,檢測結(jié)果如圖 3-5 所示。結(jié)果顯示標(biāo) RIN 值(RNA Integrity Number)為 8.7,達到 RNA 測序的
圖 3-4 總 RNA 電泳檢測結(jié)果 總 RNA 樣品;泳道 4-6 為中 9053 總 RNA 樣品;泳道 7-9 是中樣品;M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results性檢測 文庫測序之前,需要利用 Agilent 2100 進行 RNA 樣品一個 RNA 樣品為例,檢測結(jié)果如圖 3-5 所示。結(jié)果IN 值(RNA Integrity Number)為 8.7,達到 RNA 測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]棉花基因組結(jié)構(gòu)進化研究進展[J]. 楊南山,王金朋,王希胤. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(03)
[2]我國雜交棉產(chǎn)業(yè)化現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢[J]. 李根源,劉金海. 中國棉花. 2011(05)
[3]中棉所12及其選系配制的4個雜交棉幼苗期基因差異表達[J]. 朱新霞,朱一超,艾尼江,劉任重,張?zhí)煺? 作物學(xué)報. 2009(09)
[4]不同生態(tài)環(huán)境下陸地棉轉(zhuǎn)基因抗蟲雜交棉遺傳效應(yīng)及雜種優(yōu)勢分析[J]. 邢朝柱,喻樹迅,郭立平,葉子弘,王海林,苗成朵,趙云雷. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(05)
碩士論文
[1]棉花多基因組的比對圖譜構(gòu)建與功能進化分析[D]. 楊南山.華北理工大學(xué) 2017
本文編號:3049108
【文章來源】:河南大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
樣本三葉期采樣照片
圖 3-4 總 RNA 電泳檢測結(jié)果9708 總 RNA 樣品;泳道 4-6 為中 9053 總 RNA 樣品;泳道 7-9 是中棉所樣品;M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results完整性檢測NA 文庫測序之前,需要利用 Agilent 2100 進行 RNA 樣品的完本的一個 RNA 樣品為例,檢測結(jié)果如圖 3-5 所示。結(jié)果顯示標(biāo) RIN 值(RNA Integrity Number)為 8.7,達到 RNA 測序的
圖 3-4 總 RNA 電泳檢測結(jié)果 總 RNA 樣品;泳道 4-6 為中 9053 總 RNA 樣品;泳道 7-9 是中樣品;M 是 DNAMarker DM2000。Figure 3-4 Total RNA electrophoresis results性檢測 文庫測序之前,需要利用 Agilent 2100 進行 RNA 樣品一個 RNA 樣品為例,檢測結(jié)果如圖 3-5 所示。結(jié)果IN 值(RNA Integrity Number)為 8.7,達到 RNA 測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]棉花基因組結(jié)構(gòu)進化研究進展[J]. 楊南山,王金朋,王希胤. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(03)
[2]我國雜交棉產(chǎn)業(yè)化現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢[J]. 李根源,劉金海. 中國棉花. 2011(05)
[3]中棉所12及其選系配制的4個雜交棉幼苗期基因差異表達[J]. 朱新霞,朱一超,艾尼江,劉任重,張?zhí)煺? 作物學(xué)報. 2009(09)
[4]不同生態(tài)環(huán)境下陸地棉轉(zhuǎn)基因抗蟲雜交棉遺傳效應(yīng)及雜種優(yōu)勢分析[J]. 邢朝柱,喻樹迅,郭立平,葉子弘,王海林,苗成朵,趙云雷. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(05)
碩士論文
[1]棉花多基因組的比對圖譜構(gòu)建與功能進化分析[D]. 楊南山.華北理工大學(xué) 2017
本文編號:3049108
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