棉花DNA甲基轉移酶基因家族鑒定及抗逆功能分析
發(fā)布時間:2021-02-05 23:30
DNA甲基化是一種重要表觀遺傳修飾,涉及到自身的基因沉默、轉座子原件抑制、X染色體失活、細胞分化、維持胚胎發(fā)育等過程。DNA序列發(fā)生甲基化過程中,需要含有DNA-methylase結構域的DNA甲基轉移酶催化完成,并且發(fā)現DNA甲基轉移酶參與植物的非生物脅迫,棉花中還沒有系統(tǒng)的研究。為探究棉花DNA甲基轉移酶響應非生物脅迫的反應機制,挖掘棉花的抗逆基因。本研究從二倍體和四倍棉花的基因組共鑒定出了51個DNA甲基轉移酶家族基因,分析了51個家族成員之間的進化關系?寺£懙孛轌hDMT6和GhDMT9基因,構建其沉默載體、過表達載體,初步驗證GhDMT6和GhDMT9基因的功能。主要研究結果如下:1.以DNA-methylase結構域(PF00145,IPR001525)為參考序列,從亞洲棉(A2)、雷蒙德氏棉(D5)、陸地棉(AD1)、海島棉(AD2)基因組中鑒定出51個DNA甲基轉移酶家族成員。其中A2組有9個、D5組8個、AD1組有16個、AD2組有18個基因。亞細胞定位預測顯示,大多數DNA甲基轉移酶位于細胞質,其中一些位于細胞質膜,而GbDMT13預測位置是在細胞周質。2.棉花中...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
棉花三葉期脅迫處理
圖 3-2 棉花 DNA 甲基轉移酶基因染色體定位Fig. 3-2 chromosomal distrbutionof DNA methyltransferase gene in cotton注:a::雷蒙德氏棉,b:亞洲棉,c:陸地棉,d:海島棉ote: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.進化分析GA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進化樹分析結果DNA 甲基轉移酶基因在每條分枝上都緊密的聯系在一起。同一個作物中鑒定的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉移酶在進化樹中各個分支上與可較近,說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲在 DNMT2、MET 倆個亞類,進化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉,親緣關T8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差,無法參與構建種間進化樹)。
Note: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.3.1.6 種間進化分析在MEGA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進化樹分析結果表明:棉花中的 DNA 甲基轉移酶基因在每條分枝上都緊密的聯系在一起。同一個作物中鑒定的到的DRM 家族的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉移酶在進化樹中各個分支上與可可內的基因距離比較近,說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲基轉移酶主要集中在 DNMT2、MET 倆個亞類,進化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉,親緣關系近。(注:VvDMT8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差,無法參與構建種間進化樹)。
本文編號:3019763
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
棉花三葉期脅迫處理
圖 3-2 棉花 DNA 甲基轉移酶基因染色體定位Fig. 3-2 chromosomal distrbutionof DNA methyltransferase gene in cotton注:a::雷蒙德氏棉,b:亞洲棉,c:陸地棉,d:海島棉ote: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.進化分析GA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進化樹分析結果DNA 甲基轉移酶基因在每條分枝上都緊密的聯系在一起。同一個作物中鑒定的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉移酶在進化樹中各個分支上與可較近,說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲在 DNMT2、MET 倆個亞類,進化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉,親緣關T8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差,無法參與構建種間進化樹)。
Note: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.3.1.6 種間進化分析在MEGA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進化樹分析結果表明:棉花中的 DNA 甲基轉移酶基因在每條分枝上都緊密的聯系在一起。同一個作物中鑒定的到的DRM 家族的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉移酶在進化樹中各個分支上與可可內的基因距離比較近,說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲基轉移酶主要集中在 DNMT2、MET 倆個亞類,進化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉,親緣關系近。(注:VvDMT8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差,無法參與構建種間進化樹)。
本文編號:3019763
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