發(fā)布時(shí)間：2021-02-05 23:30

　　DNA甲基化是一種重要表觀遺傳修飾,涉及到自身的基因沉默、轉(zhuǎn)座子原件抑制、X染色體失活、細(xì)胞分化、維持胚胎發(fā)育等過程。DNA序列發(fā)生甲基化過程中,需要含有DNA-methylase結(jié)構(gòu)域的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶催化完成,并且發(fā)現(xiàn)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶參與植物的非生物脅迫,棉花中還沒有系統(tǒng)的研究。為探究棉花DNA甲基轉(zhuǎn)移酶響應(yīng)非生物脅迫的反應(yīng)機(jī)制,挖掘棉花的抗逆基因。本研究從二倍體和四倍棉花的基因組共鑒定出了51個(gè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶家族基因,分析了51個(gè)家族成員之間的進(jìn)化關(guān)系�？寺￡懙孛轌hDMT6和GhDMT9基因,構(gòu)建其沉默載體、過表達(dá)載體,初步驗(yàn)證GhDMT6和GhDMT9基因的功能。主要研究結(jié)果如下:1.以DNA-methylase結(jié)構(gòu)域（PF00145,IPR001525）為參考序列,從亞洲棉（A2）、雷蒙德氏棉（D5）、陸地棉（AD1）、海島棉（AD2）基因組中鑒定出51個(gè)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶家族成員。其中A2組有9個(gè)、D5組8個(gè)、AD1組有16個(gè)、AD2組有18個(gè)基因。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示,大多數(shù)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶位于細(xì)胞質(zhì),其中一些位于細(xì)胞質(zhì)膜,而GbDMT13預(yù)測(cè)位置是在細(xì)胞周質(zhì)。2.棉花中... 

【文章來源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

棉花三葉期脅迫處理

圖 3-2 棉花 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶基因染色體定位Fig. 3-2 chromosomal distrbutionof DNA methyltransferase gene in cotton注：a：：雷蒙德氏棉，b：亞洲棉，c：陸地棉，d：海島棉ote: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.進(jìn)化分析GA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進(jìn)化樹分析結(jié)果DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶基因在每條分枝上都緊密的聯(lián)系在一起。同一個(gè)作物中鑒定的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶在進(jìn)化樹中各個(gè)分支上與可較近，說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關(guān)系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲在 DNMT2、MET 倆個(gè)亞類，進(jìn)化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉，親緣關(guān)T8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差，無法參與構(gòu)建種間進(jìn)化樹)。

Note: a: Gossypium raimondii; b: Gossypium arboretum L; c: Gossypium hirsutum L.; d: Gossypium barbadebse L.3.1.6 種間進(jìn)化分析在MEGA7.0軟件中利用Neigh-bor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3-3)。進(jìn)化樹分析結(jié)果表明：棉花中的 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶基因在每條分枝上都緊密的聯(lián)系在一起。同一個(gè)作物中鑒定的到的DRM 家族的基因分支上分散不集中。棉花的 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶在進(jìn)化樹中各個(gè)分支上與可可內(nèi)的基因距離比較近，說明棉花與可可兩種作物之間的親緣關(guān)系較近。萊恩衣澡中的 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶主要集中在 DNMT2、MET 倆個(gè)亞類，進(jìn)化樹中蓖麻中的基因與衣藻存在交叉，親緣關(guān)系近。(注：VvDMT8、VvDMT9、ZmDMT7、StDMT5 相似性較差，無法參與構(gòu)建種間進(jìn)化樹)。


本文編號(hào)：3019763