西藏野生大麥耐酸/鋁相關(guān)microRNA的鑒定及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-31 03:53
鋁毒是限制酸性土壤中作物產(chǎn)量的重要因素之一。種植耐酸鋁品種是提高酸性土壤中作物產(chǎn)量的最經(jīng)濟(jì)有效的方法。西藏野生大麥擁有豐富的遺傳多樣性,是研究耐性機(jī)理的重要種質(zhì)資源。目前關(guān)于從生理和候選基因角度揭示大麥耐酸鋁性的報(bào)道較多,而大麥耐酸鋁脅迫相關(guān)microRNA(miRNA)鑒定工作較少。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),分析比較了大麥根系miRNA表達(dá)響應(yīng)酸/鋁脅迫的基因型差異,以期為解析大麥miRNA介導(dǎo)的酸鋁脅迫調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.采用西藏野生大麥耐酸/鋁基因型XZ16、酸/鋁敏感基因型XZ61和國(guó)際公認(rèn)耐酸/鋁栽培大麥品種Dayton為材料,水培酸鋁脅迫(50 μM A1,pH4.3,24 h)試驗(yàn),以pH6.0及pH4.3無(wú)鋁基本培養(yǎng)液為對(duì)照CK1和CK2,使用高通量測(cè)序從9個(gè)根文庫(kù)(XZ16-CK1、XZ16-CK2、XZ61-CK1、XZ16-Al、XZ61-CK2、XZ61-Al、Dayton-CK1、Dayton-CK2、Dayton-Al)共獲得216404167條clean reads。統(tǒng)計(jì)分析不同處理下野生大麥的小RNA的序列長(zhǎng)度分布,結(jié)果發(fā)現(xiàn)小RNA的...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:118 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1植物miRNA的合成途徑(Bartel.?2004)??Fig.?1-1?Pathways?for?the?synthesis?of?plant?miRNAs?(Bartel,?2004)??’’?-
表3-3大麥中小RNA分類注釋??Table?3-3?Small?RNA?annotation?of?barley??基因型?Genotype?XZ16?XZ61?Dayton??處理?Treatment?CK1?CK2?A1?CK1?CK2?A1?CK1?CK2Count-all?26096398?25116072?24601476?22824903?23864178?24219243?23952385?25661182?23miRNA?1957527?1605804?531793?950164?1303758?674157?1476267?1417397?6siRNA?82975?89991?90426?69049?66782?76796?78923?81622?9snoRNA?14467?9937?19738?15485?12008?26743?8028?14029?1tRNA?2174?1249?1352.5?1908.5?1701?8329?1062.5?1802?snRNA?14165?12953?31291.5?16838?11060.5?22365?15293.5?15259.5?15rRNA?528637?459999?437948.5?488317?515519?640355?315631.5?412053.5?4sRNA?23505?21114?9614?17343?16543?19670?12158?22656?1unmapped?6886457?6085868.5?6406820.5?5619575?5507063.5?6038121.5?6696652?7656264?591re
圖3-4大麥根中保守miRNA和novel?miRNA的長(zhǎng)度分布??Fig.3-4?Length?based?distribution?of?consened?and?novel?miRNAs?in?barley?roots??30??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NO對(duì)酸鋁脅迫下香樟根系形態(tài)及葉綠素?zé)晒馓匦匝芯縖J]. 李茹,韋潔,李桃禎,胡厚臻,陳鑫,王藝錦,王凌暉,滕維超. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]低pH和鋁脅迫對(duì)胡椒根細(xì)胞存活和有機(jī)酸分泌的影響[J]. 祖超,楊建峰,李志剛,王燦,魚(yú)歡,鄔華松. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]酸鋁脅迫對(duì)芒萁生長(zhǎng)、光合特性和葉綠素?zé)晒鈪?shù)的影響[J]. 劉強(qiáng),龍婉婉,柳正葳,吉康寧. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(11)
[4]菊芋對(duì)酸鋁復(fù)合脅迫的生理響應(yīng)[J]. 曹林,馬麗,吳玉環(huán),李學(xué)良,郭怡,章藝,酈楓,徐根娣,劉鵬. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]植物miRNA的研究方法概述[J]. 易小婭,楊瑞瑞,曾幼玲. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]植物miR168的研究進(jìn)展[J]. 韓璐,欒雨時(shí). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(02)
[7]利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定棉纖維發(fā)育相關(guān)miRNAs及其靶基因[J]. 南文智,吳嫚,于霽雯,范術(shù)麗,黃雙領(lǐng),李興麗,張紅衛(wèi),張金發(fā),喻樹(shù)迅. 棉花學(xué)報(bào). 2013(04)
[8]第三代測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 張得芳,馬秋月,尹佟明,夏濤. 中國(guó)生物工程雜志. 2013(05)
[9]植物microRNAs在植物發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)中的作用[J]. 魯曉燕,岳英,樊新民,馬兵鋼,趙寶龍,張虎平. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(04)
[10]鋁脅迫對(duì)蓼科植物生長(zhǎng)和光合、蒸騰特性的影響[J]. 劉強(qiáng),尹麗,龍婉婉,肖宜安. 廣西植物. 2011(02)
博士論文
[1]茶樹(shù)耐鋁的基因型差異及機(jī)理研究[D]. 于翠平.浙江大學(xué) 2014
[2]蘿卜鉛(Pb)脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制研究[D]. 王燕.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]青藏高原一年生野生大麥耐鋁毒機(jī)制的研究[D]. 戴華鑫.浙江大學(xué) 2013
[4]水稻鎘脅迫應(yīng)答相關(guān)microRNA的分離與功能研究[D]. 丁艷菲.浙江大學(xué) 2012
[5]鋁脅迫下蓼屬植物和飯豆根系有機(jī)酸分泌特性研究[D]. 尤江峰.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]低夜溫及ABA對(duì)番茄葉片中miRNAs及其靶基因表達(dá)的影響[D]. 王孝.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]野生和栽培小豆microRNA全基因組鑒定與比較分析[D]. 馬燕明.北京農(nóng)學(xué)院 2016
[3]馬尾松鋁脅迫生理響應(yīng)機(jī)制[D]. 紀(jì)雨薇.西南大學(xué) 2016
[4]酸、鋁、鈣、磷對(duì)土壤鋁形態(tài)和杉木幼苗生長(zhǎng)及營(yíng)養(yǎng)吸收的影響[D]. 崔朋輝.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[5]miR528在水稻應(yīng)答砷脅迫中的功能研究[D]. 朱樂(lè)毅.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
[6]酸鋁復(fù)合脅迫對(duì)杉木幼苗生理及礦質(zhì)元素吸收的影響[D]. 劉翠.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[7]西藏野生大麥耐旱相關(guān)基因篩選及耐性生理機(jī)理的研究[D]. 單武年.浙江大學(xué) 2013
[8]銀杏和葉籽銀杏microRNA的鑒定與分析[D]. 付茵茵.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[9]鹽脅迫條件下不同耐鹽棉花miRNA差異表達(dá)研究[D]. 李春賀.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3010164
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:118 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1植物miRNA的合成途徑(Bartel.?2004)??Fig.?1-1?Pathways?for?the?synthesis?of?plant?miRNAs?(Bartel,?2004)??’’?-
表3-3大麥中小RNA分類注釋??Table?3-3?Small?RNA?annotation?of?barley??基因型?Genotype?XZ16?XZ61?Dayton??處理?Treatment?CK1?CK2?A1?CK1?CK2?A1?CK1?CK2Count-all?26096398?25116072?24601476?22824903?23864178?24219243?23952385?25661182?23miRNA?1957527?1605804?531793?950164?1303758?674157?1476267?1417397?6siRNA?82975?89991?90426?69049?66782?76796?78923?81622?9snoRNA?14467?9937?19738?15485?12008?26743?8028?14029?1tRNA?2174?1249?1352.5?1908.5?1701?8329?1062.5?1802?snRNA?14165?12953?31291.5?16838?11060.5?22365?15293.5?15259.5?15rRNA?528637?459999?437948.5?488317?515519?640355?315631.5?412053.5?4sRNA?23505?21114?9614?17343?16543?19670?12158?22656?1unmapped?6886457?6085868.5?6406820.5?5619575?5507063.5?6038121.5?6696652?7656264?591re
圖3-4大麥根中保守miRNA和novel?miRNA的長(zhǎng)度分布??Fig.3-4?Length?based?distribution?of?consened?and?novel?miRNAs?in?barley?roots??30??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NO對(duì)酸鋁脅迫下香樟根系形態(tài)及葉綠素?zé)晒馓匦匝芯縖J]. 李茹,韋潔,李桃禎,胡厚臻,陳鑫,王藝錦,王凌暉,滕維超. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]低pH和鋁脅迫對(duì)胡椒根細(xì)胞存活和有機(jī)酸分泌的影響[J]. 祖超,楊建峰,李志剛,王燦,魚(yú)歡,鄔華松. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]酸鋁脅迫對(duì)芒萁生長(zhǎng)、光合特性和葉綠素?zé)晒鈪?shù)的影響[J]. 劉強(qiáng),龍婉婉,柳正葳,吉康寧. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(11)
[4]菊芋對(duì)酸鋁復(fù)合脅迫的生理響應(yīng)[J]. 曹林,馬麗,吳玉環(huán),李學(xué)良,郭怡,章藝,酈楓,徐根娣,劉鵬. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]植物miRNA的研究方法概述[J]. 易小婭,楊瑞瑞,曾幼玲. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]植物miR168的研究進(jìn)展[J]. 韓璐,欒雨時(shí). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(02)
[7]利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定棉纖維發(fā)育相關(guān)miRNAs及其靶基因[J]. 南文智,吳嫚,于霽雯,范術(shù)麗,黃雙領(lǐng),李興麗,張紅衛(wèi),張金發(fā),喻樹(shù)迅. 棉花學(xué)報(bào). 2013(04)
[8]第三代測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 張得芳,馬秋月,尹佟明,夏濤. 中國(guó)生物工程雜志. 2013(05)
[9]植物microRNAs在植物發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)中的作用[J]. 魯曉燕,岳英,樊新民,馬兵鋼,趙寶龍,張虎平. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(04)
[10]鋁脅迫對(duì)蓼科植物生長(zhǎng)和光合、蒸騰特性的影響[J]. 劉強(qiáng),尹麗,龍婉婉,肖宜安. 廣西植物. 2011(02)
博士論文
[1]茶樹(shù)耐鋁的基因型差異及機(jī)理研究[D]. 于翠平.浙江大學(xué) 2014
[2]蘿卜鉛(Pb)脅迫響應(yīng)的分子機(jī)制研究[D]. 王燕.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]青藏高原一年生野生大麥耐鋁毒機(jī)制的研究[D]. 戴華鑫.浙江大學(xué) 2013
[4]水稻鎘脅迫應(yīng)答相關(guān)microRNA的分離與功能研究[D]. 丁艷菲.浙江大學(xué) 2012
[5]鋁脅迫下蓼屬植物和飯豆根系有機(jī)酸分泌特性研究[D]. 尤江峰.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]低夜溫及ABA對(duì)番茄葉片中miRNAs及其靶基因表達(dá)的影響[D]. 王孝.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]野生和栽培小豆microRNA全基因組鑒定與比較分析[D]. 馬燕明.北京農(nóng)學(xué)院 2016
[3]馬尾松鋁脅迫生理響應(yīng)機(jī)制[D]. 紀(jì)雨薇.西南大學(xué) 2016
[4]酸、鋁、鈣、磷對(duì)土壤鋁形態(tài)和杉木幼苗生長(zhǎng)及營(yíng)養(yǎng)吸收的影響[D]. 崔朋輝.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[5]miR528在水稻應(yīng)答砷脅迫中的功能研究[D]. 朱樂(lè)毅.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
[6]酸鋁復(fù)合脅迫對(duì)杉木幼苗生理及礦質(zhì)元素吸收的影響[D]. 劉翠.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[7]西藏野生大麥耐旱相關(guān)基因篩選及耐性生理機(jī)理的研究[D]. 單武年.浙江大學(xué) 2013
[8]銀杏和葉籽銀杏microRNA的鑒定與分析[D]. 付茵茵.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[9]鹽脅迫條件下不同耐鹽棉花miRNA差異表達(dá)研究[D]. 李春賀.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3010164
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