大麥LBD基因家族分析及功能驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2021-01-30 21:39
大麥種植歷史悠久,是世界第四大禾谷類作物,可作為食用、飼用、啤用和保健食品的原材料。長江流域是我國大麥的主產(chǎn)地之一,該地區(qū)降雨量多,嚴(yán)重影響大麥產(chǎn)量與品質(zhì)。耐濕大麥品種受到濕害脅迫,產(chǎn)生大量不定根來應(yīng)對(duì)濕害脅迫對(duì)植株生長的影響。已有研究表明,LBD轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控植物側(cè)生器官發(fā)育等方面起重要作用。本文在全基因組水平分析了大麥LBD基因家族成員,通過構(gòu)建植物L(fēng)BD基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹,篩選并克隆到與大麥不定根發(fā)育相關(guān)的LBD基因,利用轉(zhuǎn)基因方法進(jìn)行基因功能驗(yàn)證,以期為大麥耐濕性品種改良及分子設(shè)計(jì)育種奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.在全基因組水平,大麥7條染色體共鑒定出24個(gè)LBD基因。根據(jù)基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)差異,24個(gè)基因分為兩類,其中19個(gè)基因?yàn)镃lass Ⅰ,5個(gè)基因?yàn)镃lass Ⅱ。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,HvLBD19基因與調(diào)控植物不定根發(fā)育的相關(guān)基因OsARL1、ZwRTCL和ZmRTCS具有較高的同源性。RT-PCR分析顯示,濕害脅迫后大麥根節(jié)和不定根中HvLBD19基因表達(dá)量顯著高于對(duì)照;蛩矔r(shí)表達(dá)結(jié)果顯示,HvLBD19蛋白位于細(xì)胞核內(nèi)。2.克隆HvLBD19基因全長編碼區(qū)序...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.2//vZ5D基因的染色體定位??Fig.?2.2.?Distribution?on?chromosomes?of?HvLBD?gene?family??3.2系統(tǒng)進(jìn)化樹和基因結(jié)構(gòu)分析??
在擬南芥中,LBD蛋白N端有一個(gè)保守的LOB結(jié)構(gòu)域,而這個(gè)保守結(jié)構(gòu)域包含C和??GAS?blocks兩個(gè)區(qū)段。在本研究中,序列比對(duì)結(jié)果表明,大麥Z/vZ萬D基因在L0B結(jié)構(gòu)域??也包含C和GAS?block兩個(gè)區(qū)段(圖2.4A)。在大麥打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均檢測到一個(gè)保守的CX2CX6CX3C鋅指結(jié)構(gòu)域,而僅有8個(gè)I類蛋白中發(fā)現(xiàn)??LX6LX3LX6L亮氨酸拉鏈樣結(jié)構(gòu)域(圖2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?。?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?。浚?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::鋱:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識(shí)?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten廣,?t??hvlbdi6?mm-.ijm?■?■??<?^vi??HvLBI^。?VF?ifrfFr?W?K.W-'A?.?Wt.?U?.^1?^?.^V?,?:?<?..?U\-f>.?M:I??HvI.BDl.1?fifeip;||^?,:?VI?if;'ACE?爭雜“說撕>*C
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]淹水脅迫對(duì)黃瓜幼苗生長及不定根解剖結(jié)構(gòu)的影響[J]. 于斌,朱進(jìn),周國林,黎紫儀,彭玉全. 北方園藝. 2018(03)
[2]淹水脅迫對(duì)水稻植株抗氧化酶變化的影響[J]. 黃萬勇,盧成,鄭世宗,溫進(jìn)化. 排灌機(jī)械工程學(xué)報(bào). 2017(11)
[3]淹水對(duì)滴水觀音抗氧化系統(tǒng)和丙二醛的影響[J]. 夏紅霞,朱啟紅. 三峽生態(tài)環(huán)境監(jiān)測. 2016(03)
[4]甘藍(lán)型油菜濕害相關(guān)基因BnLDH-1的克隆和表達(dá)分析[J]. 吳金海,周玉堂,謝伶俐,張學(xué)昆,許本波. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(03)
[5]水澇脅迫下芝麻內(nèi)源激素及表型響應(yīng)[J]. 江詩洋,黎冬華,張艷欣,魏鑫,張秀榮,王林海. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2015(05)
[6]紅豆杉TcLBDs基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 李艷艷,楊艷芳,王俊青,王帥,劉洪偉,邱德有. 林業(yè)科學(xué). 2015(10)
[7]成熟期水鹽脅迫對(duì)番茄產(chǎn)量和貯藏期品質(zhì)的影響[J]. 陸紅飛,郭相平,甄博,王振昌,于曉飛. 灌溉排水學(xué)報(bào). 2015(06)
[8]白茅解剖結(jié)構(gòu)和屏障結(jié)構(gòu)特征研究[J]. 楊朝東,李守峰,鄧仕明,姚蘭,袁龍義,張霞. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2015(03)
[9]苗期濕害脅迫下不同基因型芝麻的反應(yīng)差異研究[J]. 潘華,周紅英,孫建,顏廷獻(xiàn),饒?jiān)铝?顏小文,樂美旺. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]水分脅迫及鉀肥對(duì)櫻桃番茄產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[J]. 李建設(shè),周筠,高艷明. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]基于全基因組的玉米LBD轉(zhuǎn)錄因子家族分析及密碼子使用模式分析[D]. 張?jiān)烂?山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]水稻高親和硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因OsNRT2.3a/b生物學(xué)功能分析[D]. 唐仲.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]大豆耐淹性鑒定及其形態(tài)解剖特征、遺傳與QTL定位[D]. 王芳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜苗期耐濕相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 荊蓉蓉.西南大學(xué) 2017
[2]生長素對(duì)淹水脅迫下鹽地堿蓬不定根產(chǎn)生的影響[D]. 賈玉輝.山東師范大學(xué) 2014
[3]分蘗期淹澇脅迫對(duì)水稻農(nóng)藝和品質(zhì)性狀及生理特性的影響[D]. 趙啟輝.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]水稻生長過程對(duì)澇害的響應(yīng)與恢復(fù)模型研究[D]. 張建華.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[5]甘藍(lán)型油菜耐濕差異性表達(dá)基因的篩選及分析[D]. 譚筱玉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]淹水脅迫下microRNA介導(dǎo)的玉米不定根生長及抗氧化機(jī)制研究[D]. 張丹鳳.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3009631
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.2//vZ5D基因的染色體定位??Fig.?2.2.?Distribution?on?chromosomes?of?HvLBD?gene?family??3.2系統(tǒng)進(jìn)化樹和基因結(jié)構(gòu)分析??
在擬南芥中,LBD蛋白N端有一個(gè)保守的LOB結(jié)構(gòu)域,而這個(gè)保守結(jié)構(gòu)域包含C和??GAS?blocks兩個(gè)區(qū)段。在本研究中,序列比對(duì)結(jié)果表明,大麥Z/vZ萬D基因在L0B結(jié)構(gòu)域??也包含C和GAS?block兩個(gè)區(qū)段(圖2.4A)。在大麥打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均檢測到一個(gè)保守的CX2CX6CX3C鋅指結(jié)構(gòu)域,而僅有8個(gè)I類蛋白中發(fā)現(xiàn)??LX6LX3LX6L亮氨酸拉鏈樣結(jié)構(gòu)域(圖2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?。?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?。浚?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::鋱:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識(shí)?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten廣,?t??hvlbdi6?mm-.ijm?■?■??<?^vi??HvLBI^。?VF?ifrfFr?W?K.W-'A?.?Wt.?U?.^1?^?.^V?,?:?<?..?U\-f>.?M:I??HvI.BDl.1?fifeip;||^?,:?VI?if;'ACE?爭雜“說撕>*C
?_??t??-____?,:丨丨丨?*?m?exon?-—mtrwi??圖2.3?基因的進(jìn)化樹和基因結(jié)構(gòu)分析??Fig.?2.3.?The?phylogenetic?tree?and?gene?structure?analysis?of?the?HvLBD?genes??3.3大麥LBD蛋白的序列比對(duì)和保守結(jié)構(gòu)域分析??在擬南芥中,LBD蛋白N端有一個(gè)保守的LOB結(jié)構(gòu)域,而這個(gè)保守結(jié)構(gòu)域包含C和??GAS?blocks兩個(gè)區(qū)段。在本研究中,序列比對(duì)結(jié)果表明,大麥Z/vZ萬D基因在L0B結(jié)構(gòu)域??也包含C和GAS?block兩個(gè)區(qū)段(圖2.4A)。在大麥打vZ5D基因中,所有的HvLBD蛋白??序列中均檢測到一個(gè)保守的CX2CX6CX3C鋅指結(jié)構(gòu)域,而僅有8個(gè)I類蛋白中發(fā)現(xiàn)??LX6LX3LX6L亮氨酸拉鏈樣結(jié)構(gòu)域(圖2.4B)。??h>-lbdi?fift??:■?r-r?ii?Jir.77.7tb?^?\?!-v?^?.?i^M:m??Hv13D2?V!?Pin....?,V\%?i?Y.?.p:i^.?*^11?。浚?^ifviicvc.?:?lAF^rm??HVL8D3??A.'VT.I?IKmm??HvLBlM?vn??tF?T.^'i!-??HvLHDS?.?;?r?l?.?:■?>,C?v.::鋱:、.:,??i{vLar??v??f??'??^?.?r-f.-?ib??x?.?%■??hvlboio?塌心響丫識(shí)?<^v?.f.wn???^??Hvmmi?r|'v嚳:雜鄕:.....?m:-?ten廣
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]淹水脅迫對(duì)黃瓜幼苗生長及不定根解剖結(jié)構(gòu)的影響[J]. 于斌,朱進(jìn),周國林,黎紫儀,彭玉全. 北方園藝. 2018(03)
[2]淹水脅迫對(duì)水稻植株抗氧化酶變化的影響[J]. 黃萬勇,盧成,鄭世宗,溫進(jìn)化. 排灌機(jī)械工程學(xué)報(bào). 2017(11)
[3]淹水對(duì)滴水觀音抗氧化系統(tǒng)和丙二醛的影響[J]. 夏紅霞,朱啟紅. 三峽生態(tài)環(huán)境監(jiān)測. 2016(03)
[4]甘藍(lán)型油菜濕害相關(guān)基因BnLDH-1的克隆和表達(dá)分析[J]. 吳金海,周玉堂,謝伶俐,張學(xué)昆,許本波. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(03)
[5]水澇脅迫下芝麻內(nèi)源激素及表型響應(yīng)[J]. 江詩洋,黎冬華,張艷欣,魏鑫,張秀榮,王林海. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2015(05)
[6]紅豆杉TcLBDs基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 李艷艷,楊艷芳,王俊青,王帥,劉洪偉,邱德有. 林業(yè)科學(xué). 2015(10)
[7]成熟期水鹽脅迫對(duì)番茄產(chǎn)量和貯藏期品質(zhì)的影響[J]. 陸紅飛,郭相平,甄博,王振昌,于曉飛. 灌溉排水學(xué)報(bào). 2015(06)
[8]白茅解剖結(jié)構(gòu)和屏障結(jié)構(gòu)特征研究[J]. 楊朝東,李守峰,鄧仕明,姚蘭,袁龍義,張霞. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2015(03)
[9]苗期濕害脅迫下不同基因型芝麻的反應(yīng)差異研究[J]. 潘華,周紅英,孫建,顏廷獻(xiàn),饒?jiān)铝?顏小文,樂美旺. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]水分脅迫及鉀肥對(duì)櫻桃番茄產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[J]. 李建設(shè),周筠,高艷明. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]基于全基因組的玉米LBD轉(zhuǎn)錄因子家族分析及密碼子使用模式分析[D]. 張?jiān)烂?山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]水稻高親和硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因OsNRT2.3a/b生物學(xué)功能分析[D]. 唐仲.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]大豆耐淹性鑒定及其形態(tài)解剖特征、遺傳與QTL定位[D]. 王芳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜苗期耐濕相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 荊蓉蓉.西南大學(xué) 2017
[2]生長素對(duì)淹水脅迫下鹽地堿蓬不定根產(chǎn)生的影響[D]. 賈玉輝.山東師范大學(xué) 2014
[3]分蘗期淹澇脅迫對(duì)水稻農(nóng)藝和品質(zhì)性狀及生理特性的影響[D]. 趙啟輝.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]水稻生長過程對(duì)澇害的響應(yīng)與恢復(fù)模型研究[D]. 張建華.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[5]甘藍(lán)型油菜耐濕差異性表達(dá)基因的篩選及分析[D]. 譚筱玉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]淹水脅迫下microRNA介導(dǎo)的玉米不定根生長及抗氧化機(jī)制研究[D]. 張丹鳳.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3009631
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