江華苦茶親緣關(guān)系與遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-09 13:16
江華苦茶是湖南省1987年認(rèn)定的優(yōu)良地方群體品種。主要分布在湖南省南部江華地區(qū)的南嶺山脈,是寶貴的茶樹資源。本研究在對(duì)江華苦茶進(jìn)行資源深入調(diào)查的基礎(chǔ)上,采用熒光SSR分子標(biāo)記技術(shù)與cpDNA序列分析技術(shù)相結(jié)合的方法,對(duì)江華苦茶4個(gè)自然居群的32份資源進(jìn)行了親緣關(guān)系、遺傳多樣性和遺傳分化的研究。研究結(jié)果如下:1.在江華縣不同地域收集樣品,先后獲得27個(gè)代表性較高的樣品,結(jié)合湖南省茶葉研究所茶園的江華苦茶五個(gè)樣品,總共32個(gè)樣品,用于本次實(shí)驗(yàn)。2、提取樣品的DNA后進(jìn)行了適用引物的篩選,最后選定四對(duì)引物進(jìn)行cpDNA測(cè)序研究,測(cè)序結(jié)果表明變異率約為0.78%,采用MP法進(jìn)行構(gòu)建分子系統(tǒng)樹,將參試的32個(gè)樣品分成4個(gè)大類。而用Dnasp進(jìn)行單倍型分析之后,被分為五個(gè)單倍型,構(gòu)筑這五個(gè)單倍型的網(wǎng)狀進(jìn)化圖,可以發(fā)現(xiàn)江華苦茶32個(gè)資源樣品之間的cpDNA演化關(guān)系。進(jìn)行中性檢測(cè)和失配分析之后,認(rèn)為江華苦茶沒有發(fā)生擴(kuò)張事件。在進(jìn)行綜合計(jì)算之后發(fā)現(xiàn)江華苦茶的cpDNA變異主要出現(xiàn)在地域內(nèi),居群內(nèi),比率為89.29%。3、采用熒光SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)提取獲得的江華苦茶DNA進(jìn)行研究,獲得數(shù)據(jù)采用popge...
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 綜述
1 江華苦茶研究進(jìn)展
1.1 江華苦茶的形態(tài)學(xué)特征
1.2 江華苦茶生化成分研究
1.3 江華苦茶的進(jìn)化地位研究
2 SSR分子標(biāo)記研究
2.1 SSR分子標(biāo)記的原理
2.2 SSR標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
2.3 SSR標(biāo)記在茶樹上的研究進(jìn)展
3 葉綠體基因組學(xué)研究
3.1 葉綠體基因組編碼的基因
3.2 葉綠體基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
3.3 葉綠體基因組的應(yīng)用
4 本研究的目的意義與主要研究內(nèi)容
4.1 本研究的目的意義
4.2 主要研究內(nèi)容
第二章 江華苦茶種質(zhì)資源調(diào)查與收集
1 材料與方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第三章 江華苦茶的cpDNA序列分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 引物篩選結(jié)果
2.2 不同序列的特征與差異
2.3 MP法分子系統(tǒng)樹分析
2.4 單倍型分析
2.5 多樣性和中性檢測(cè)分析
2.6 居群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3 討論
第四章 江華苦茶種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 遺傳多樣性分析
2.2 居群遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.3 資源聚類分析
3 討論
3.1 江華苦茶基于nSSR表現(xiàn)的遺傳多樣性
3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 資源親緣關(guān)系
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶組植物種間關(guān)系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析[J]. 劉振,趙洋,楊培迪,成楊,劉本英,李游勇,楊陽. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(01)
[2]基于SSR標(biāo)記的黔南茶樹種質(zhì)資源DNA指紋圖譜構(gòu)建[J]. 陳世軍,張明澤,姚玉仙,謝維斌. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
[3]茶樹良種場不同品種的SSR鑒定研究[J]. 姜燕華,張成才,成浩. 茶葉學(xué)報(bào). 2016(03)
[4]黔南60份茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析[J]. 張明澤,姚玉仙,陳世軍. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(06)
[5]基于熒光標(biāo)記SSR的CID法快速鑒定福建茶樹品種[J]. 王讓劍,楊軍,孔祥瑞,高香鳳. 茶葉科學(xué). 2016(02)
[6]茶樹PVP申請(qǐng)品種的SSR分子標(biāo)記鑒定和系譜關(guān)系分析[J]. 黃丹娟,馬建強(qiáng),陳亮. 茶葉科學(xué). 2016(01)
[7]利用SSR標(biāo)記分析福建省選育福云半同胞系茶樹品種遺傳多樣性[J]. 陳志輝,單睿陽,林鄭和,游小妹,鐘秋生,陳常頌. 茶葉學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]福建15個(gè)茶樹品種SSR遺傳差異分析與指紋圖譜建立[J]. 王讓劍,楊軍,孔祥瑞,郭吉春. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(10)
[9]SSR分子標(biāo)記及其在植物遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 李珊珊,孫春玉,蔣世翠,王康宇,王義,張美萍. 吉林蔬菜. 2014(05)
[10]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋果與中國蘋果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文. 園藝學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]孑遺植物珙桐的群體遺傳學(xué)和譜系地理學(xué)研究[D]. 杜玉娟.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于cpDNA序列的茶樹及其近緣植物的親緣關(guān)系研究[D]. 陳春梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]香蕉種質(zhì)資源種間線粒體DNA位點(diǎn)變異的遺傳分類[D]. 鄧長娟.海南大學(xué) 2011
本文編號(hào):2966722
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 綜述
1 江華苦茶研究進(jìn)展
1.1 江華苦茶的形態(tài)學(xué)特征
1.2 江華苦茶生化成分研究
1.3 江華苦茶的進(jìn)化地位研究
2 SSR分子標(biāo)記研究
2.1 SSR分子標(biāo)記的原理
2.2 SSR標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
2.3 SSR標(biāo)記在茶樹上的研究進(jìn)展
3 葉綠體基因組學(xué)研究
3.1 葉綠體基因組編碼的基因
3.2 葉綠體基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
3.3 葉綠體基因組的應(yīng)用
4 本研究的目的意義與主要研究內(nèi)容
4.1 本研究的目的意義
4.2 主要研究內(nèi)容
第二章 江華苦茶種質(zhì)資源調(diào)查與收集
1 材料與方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第三章 江華苦茶的cpDNA序列分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 引物篩選結(jié)果
2.2 不同序列的特征與差異
2.3 MP法分子系統(tǒng)樹分析
2.4 單倍型分析
2.5 多樣性和中性檢測(cè)分析
2.6 居群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3 討論
第四章 江華苦茶種質(zhì)資源親緣關(guān)系的SSR分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 遺傳多樣性分析
2.2 居群遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.3 資源聚類分析
3 討論
3.1 江華苦茶基于nSSR表現(xiàn)的遺傳多樣性
3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 資源親緣關(guān)系
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶組植物種間關(guān)系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析[J]. 劉振,趙洋,楊培迪,成楊,劉本英,李游勇,楊陽. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(01)
[2]基于SSR標(biāo)記的黔南茶樹種質(zhì)資源DNA指紋圖譜構(gòu)建[J]. 陳世軍,張明澤,姚玉仙,謝維斌. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
[3]茶樹良種場不同品種的SSR鑒定研究[J]. 姜燕華,張成才,成浩. 茶葉學(xué)報(bào). 2016(03)
[4]黔南60份茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析[J]. 張明澤,姚玉仙,陳世軍. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(06)
[5]基于熒光標(biāo)記SSR的CID法快速鑒定福建茶樹品種[J]. 王讓劍,楊軍,孔祥瑞,高香鳳. 茶葉科學(xué). 2016(02)
[6]茶樹PVP申請(qǐng)品種的SSR分子標(biāo)記鑒定和系譜關(guān)系分析[J]. 黃丹娟,馬建強(qiáng),陳亮. 茶葉科學(xué). 2016(01)
[7]利用SSR標(biāo)記分析福建省選育福云半同胞系茶樹品種遺傳多樣性[J]. 陳志輝,單睿陽,林鄭和,游小妹,鐘秋生,陳常頌. 茶葉學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]福建15個(gè)茶樹品種SSR遺傳差異分析與指紋圖譜建立[J]. 王讓劍,楊軍,孔祥瑞,郭吉春. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(10)
[9]SSR分子標(biāo)記及其在植物遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 李珊珊,孫春玉,蔣世翠,王康宇,王義,張美萍. 吉林蔬菜. 2014(05)
[10]基于ITS和matK序列探討新疆野蘋果與中國蘋果的系統(tǒng)演化關(guān)系[J]. 朱元娣,曹敏格,許正,王昆,張文. 園藝學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]孑遺植物珙桐的群體遺傳學(xué)和譜系地理學(xué)研究[D]. 杜玉娟.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于cpDNA序列的茶樹及其近緣植物的親緣關(guān)系研究[D]. 陳春梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]香蕉種質(zhì)資源種間線粒體DNA位點(diǎn)變異的遺傳分類[D]. 鄧長娟.海南大學(xué) 2011
本文編號(hào):2966722
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