小麥株高相關(guān)基因TaDwarf11的克隆與功能分析
發(fā)布時間:2020-12-25 00:42
我國是世界上小麥生產(chǎn)與消費大國,小麥生產(chǎn)在國家糧食安全方面占據(jù)著舉足輕重的地位。在當(dāng)今環(huán)境下,提高小麥產(chǎn)量是保障我國糧食安全的一個重要途徑。小麥株高是影響小麥產(chǎn)量的一個重要因素,株高相關(guān)基因的發(fā)掘與研究,對小麥育種有著重要的意義。本研究以中國春為材料,使用同源克隆方法,依據(jù)水稻P450蛋白家族基因Dwarf11序列,在小麥中克隆得到了TaDwarf11基因,并對其進行了時空表達、標(biāo)記開發(fā)、基因定位及功能分析等研究得到了以下重要結(jié)論:1.依據(jù)基因數(shù)據(jù)庫比對得到序列設(shè)計引物,在小麥中國春的gDNA與cDNA中進行了PCR片段擴增與測序驗證,得到了完整的TaDwarf11序列,其cDNA全長為1428bp,gDNA全長為3607bp,含有9個長度分別為215bp、325bp、154bp、235bp、89bp、75bp、107bp、125bp和102bp的外顯子,以及8個長度分別為365bp、241bp、157bp、91bp、281bp、189bp、470bp和386bp的內(nèi)含子。所編碼的蛋白質(zhì)含有475個氨基酸,存在一個P450結(jié)構(gòu)域。2.該基因在小麥根、莖、葉、幼穗中均有表達,但相對表達量...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TaDwarf11基因結(jié)構(gòu)
圖 2-2 TaDwarf11 蛋白序列與 Dwarf11 蛋白序列比對Fig. 2-2 Protein sequence alignment of TaDwarf11 and Dwarf11Dwarf11149TaDwarf11150EEEERRLLFFQQCCSSYYPPRRPPIIHHGGIILLGGKKSSSSMMLLVVVVLLGGEEDDHHKKRRLLRRNNLLAALLAALLVVTTSSTTKKLLKKPPSSYYDwarf11199TaDwarf11194LLGGDDIIEEKRIIAALLHHIIVVGGSSWWHHGGKKSGK.D.K.G.M.V.NGVSIIATFFCCEEEEAARRKKFFAAFFSSVVIIVVKKQQVVLLGGLLSSDwarf11249TaDwarf11244PPEEEEPPVVTTAAMMIILLEEDDFFLLATFFMMKKGGLLIISSFFPPLLYRIIPPGGTTPPYYAAKKAAVVQQAARRAERRIISSSSTTVVKKGGIIIIDwarf11299TaDwarf11294EEEERRRRNKAAGDSCSCNKKRGDDDFFLLDNVVLLLLSSSTNDEELLSSDDEEEEKKVVSSFFVVLLDDSSLLLLGGGGYYEETTTTSSLLLMIISSMMDwarf11349TaDwarf11344VVVVYYFFLLGGQQSS
圖 2-4 P450 蛋白系統(tǒng)發(fā)育分析Fig. 2-4 Phylogenetic analysis of P450 proteinsDwarf11 基因 SNP 位點的發(fā)現(xiàn)國春、天麥 989 等不同小麥品種中擴增 TaDwarf11 序列后,通過比顯子 138bp 處存在 T-C 堿基差異(圖 2-5)。通過在多個小麥品種中現(xiàn)該 SNP 位點的存在具有普遍性。中 國 春50天 麥 98950AATTGGGGTTGGGGGGGGGGTTGGGGGGCCGGAATTCCTTTTGGTTGGCCTTGGGGCCTTGGCCTTCCCCGGGGCCGGAATTCCCCTTGGCCTTCCGGCC中 國 春100天 麥 989100CCTTTTGGCCTTCCCCTTGGAACCTTCCTTGGGGTTGGCCTTGGAAGGCCCCAACCTTTTCCCCTTGGCCCCTTTTTTGGCCTTCCCCTTCCAAAACCCC中 國 春150天 麥 989150CCCCAAAAGGGGCCTTCCCCGGAAGGGGGGGGCCAAGGCCTTTTTTGGGGAATTGGGGCCCCCCCCTTTTGGTTCTGGGGCCGGAAGGAACCCCCCTTCC中 國 春200天 麥 989200AAGGGGTTTTCCCCTTCCAACCCCCCCCTTCCAACCGGCCCCTTCCCCAAAACCAACCGGCCTTGGGGGGTTA
本文編號:2936615
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TaDwarf11基因結(jié)構(gòu)
圖 2-2 TaDwarf11 蛋白序列與 Dwarf11 蛋白序列比對Fig. 2-2 Protein sequence alignment of TaDwarf11 and Dwarf11Dwarf11149TaDwarf11150EEEERRLLFFQQCCSSYYPPRRPPIIHHGGIILLGGKKSSSSMMLLVVVVLLGGEEDDHHKKRRLLRRNNLLAALLAALLVVTTSSTTKKLLKKPPSSYYDwarf11199TaDwarf11194LLGGDDIIEEKRIIAALLHHIIVVGGSSWWHHGGKKSGK.D.K.G.M.V.NGVSIIATFFCCEEEEAARRKKFFAAFFSSVVIIVVKKQQVVLLGGLLSSDwarf11249TaDwarf11244PPEEEEPPVVTTAAMMIILLEEDDFFLLATFFMMKKGGLLIISSFFPPLLYRIIPPGGTTPPYYAAKKAAVVQQAARRAERRIISSSSTTVVKKGGIIIIDwarf11299TaDwarf11294EEEERRRRNKAAGDSCSCNKKRGDDDFFLLDNVVLLLLSSSTNDEELLSSDDEEEEKKVVSSFFVVLLDDSSLLLLGGGGYYEETTTTSSLLLMIISSMMDwarf11349TaDwarf11344VVVVYYFFLLGGQQSS
圖 2-4 P450 蛋白系統(tǒng)發(fā)育分析Fig. 2-4 Phylogenetic analysis of P450 proteinsDwarf11 基因 SNP 位點的發(fā)現(xiàn)國春、天麥 989 等不同小麥品種中擴增 TaDwarf11 序列后,通過比顯子 138bp 處存在 T-C 堿基差異(圖 2-5)。通過在多個小麥品種中現(xiàn)該 SNP 位點的存在具有普遍性。中 國 春50天 麥 98950AATTGGGGTTGGGGGGGGGGTTGGGGGGCCGGAATTCCTTTTGGTTGGCCTTGGGGCCTTGGCCTTCCCCGGGGCCGGAATTCCCCTTGGCCTTCCGGCC中 國 春100天 麥 989100CCTTTTGGCCTTCCCCTTGGAACCTTCCTTGGGGTTGGCCTTGGAAGGCCCCAACCTTTTCCCCTTGGCCCCTTTTTTGGCCTTCCCCTTCCAAAACCCC中 國 春150天 麥 989150CCCCAAAAGGGGCCTTCCCCGGAAGGGGGGGGCCAAGGCCTTTTTTGGGGAATTGGGGCCCCCCCCTTTTGGTTCTGGGGCCGGAAGGAACCCCCCTTCC中 國 春200天 麥 989200AAGGGGTTTTCCCCTTCCAACCCCCCCCTTCCAACCGGCCCCTTCCCCAAAACCAACCGGCCTTGGGGGGTTA
本文編號:2936615
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