隨著我國(guó)大眾生活水平的逐漸提高,菜用甘薯因其食用、保健價(jià)值受到了追捧,觀賞甘薯以葉色葉型豐富成為了重要的園林綠化植物。然而國(guó)內(nèi)菜用和觀賞用甘薯研究基礎(chǔ)薄弱,種質(zhì)資源數(shù)量及其親緣關(guān)系等基礎(chǔ)信息匱乏。為了發(fā)掘菜用和觀賞甘薯種質(zhì)資源,分析其遺傳多樣性,獲得菜用和觀賞甘薯品質(zhì)特性,本文對(duì)國(guó)家種質(zhì)徐州甘薯試管苗庫(kù)田間圃1100份資源進(jìn)行表型特征評(píng)價(jià),初步篩選菜用和觀賞用甘薯種質(zhì)96份。針對(duì)這些種質(zhì),研究結(jié)果如下:1.基于12個(gè)表型性狀對(duì)田間表現(xiàn)健康的89份菜用和觀賞甘薯資源進(jìn)行主成分和聚類分析。結(jié)果得到了5個(gè)主要成分,累計(jì)方差貢獻(xiàn)率為80.50%。將主成分1與主成分2作圖,得到了3個(gè)類群,并發(fā)現(xiàn)莖端纏繞度越大,莖端茸毛越少的現(xiàn)象。UPGMA法聚類共有8個(gè)類群,但是15份資源通過(guò)聚類沒(méi)有徹底區(qū)分開,說(shuō)明形態(tài)學(xué)標(biāo)記在種質(zhì)鑒定中具有局限性。2.利用SSR分子標(biāo)記對(duì)這96份種質(zhì)進(jìn)行了遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析。30對(duì)SSR引物擴(kuò)增了269條多態(tài)性條帶;將種質(zhì)資源按來(lái)源地歸類,通過(guò)MEGA 6.06軟件分析,不同地區(qū)間平均遺傳距離為0.404;用DPS軟件計(jì)算了96份資源內(nèi)的Nei72遺傳距離為0.15-0... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

菜用和觀賞甘薯資源表型性狀的主成分分析

MEGA6.06 中，使用 MEGA6.06 計(jì)算平均遺傳距離，使用 NJ 聚類法聚類，導(dǎo)出聚類圖，以 nwk格式將聚類圖輸入 Interactive tree of life (ITOL)在線美化工具(Letunic et al.,2016)；將 96 份種質(zhì)資源按地域分組，計(jì)算不同地區(qū)間遺傳距離、遺傳距離矩陣，將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 MEGA6.06 聚類、ITOL美化，輸出結(jié)果。群體結(jié)構(gòu)分析：將 0-1 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成 txt 文件，按要求導(dǎo)入 Structure 運(yùn)算，設(shè)置群體數(shù) K 值范圍為 1-10，每個(gè)參數(shù)運(yùn)行 10 次，每次 burn-in time 設(shè)置為 40000，重復(fù)設(shè)置為 100000 次。運(yùn)行結(jié)束后找到 result 文件夾將其壓縮成 RAR 文件，然后把結(jié)果上傳至 Structure Harvester 在線工具確定的 K 值(Evanno ,2005)。3.3 結(jié)果與分析3.3.1 DNA 質(zhì)量檢測(cè)用改良 CTAB 法所提取的菜用和觀賞甘薯基因組 DNA，在 NanoDrop 上檢測(cè)濃度以及純度。結(jié)果表明，本實(shí)驗(yàn)所提取的菜用和觀賞甘薯基因組 DNA 質(zhì)量好，濃度和純度高。甘薯基因組 DNA的 260/280 OD 值穩(wěn)定在 1.8-2.2 之間，提取 DNA 濃度穩(wěn)定在 300 ng/μL-3000 ng/μL 之間。

圖 3-3 不同菜用和觀賞甘薯來(lái)源地 NJ 法聚類圖Fig.3-3 Different origin of vegetable and ornamental sweetpotato NJ clustering3.3.4 SSR 標(biāo)記聚類分析按照 3.2.5 對(duì)菜用和觀賞甘薯 SSR 數(shù)據(jù)分析，在 Excel 中統(tǒng)計(jì)計(jì)算，獲得兩兩材料間遺傳距離分布在 0.16~0.77 范圍內(nèi)，平均遺傳距離為 0.66。此基于 SSR 菜用和觀賞甘薯組內(nèi)遺傳距離的范圍小于楊新筍(2016)基于 SSR 地方種間遺傳距離范圍 0.088-0.835，大于其所報(bào)道的甘薯育成種的 0.188-0.608 遺傳距離范圍。表明種質(zhì)資源間遺傳距離較大，有較為豐富的遺傳多樣性。本試驗(yàn)種質(zhì)材料間 SSR 的平均遺傳距離均大于楊所報(bào)道的地方種內(nèi) 0.369 與育成種內(nèi) 0.340 的基于 SSR的平均遺傳距離。通過(guò)對(duì)菜用和觀賞甘薯種質(zhì)資源的聚類，在遺傳距離為 0.272 處劃分為 3 個(gè)類群，分別是類群Ⅰ、類群Ⅱ、類群Ⅲ，其中第Ⅲ類群又可以在遺傳距離為 0.267 處劃分成 3 個(gè)亞群，分別是Ⅲa、Ⅲb、Ⅲc，聚類結(jié)果類群劃分如圖 3-4 所示。從聚類圖 3-5 可以更加直觀的了解到各類群中不同來(lái)源地的劃分情況，即類群Ⅰ、類群Ⅱ、類群Ⅲ中各類群組成的菜用和觀賞甘薯種質(zhì)資源來(lái)源地較為豐富，相同來(lái)源地間的種質(zhì)材料并沒(méi)有聚在一起，說(shuō)明了我們?cè)诖筇锲灾忻ずY過(guò)程運(yùn)用的方法科學(xué)有效。通過(guò)表 3-5 可以統(tǒng)計(jì)的到類群Ⅰ中含有來(lái)自 11 個(gè)省的入選品種和 1 個(gè)巴西品種共 22 份種質(zhì)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：2934864