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水稻鹽脅迫下組蛋白乙;揎椞卣骷癏ATs相關(guān)基因的功能研究

發(fā)布時間:2020-12-16 08:32
  組蛋白修飾是表觀遺傳調(diào)控的重要方式之一,包括組蛋白乙酰化、甲基化、磷酸化等多種組蛋白共價修飾,對于動植物和人類的生長發(fā)育至關(guān)重要。組蛋白乙酰化修飾是由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HATs)和去乙;福℉DACs)共同調(diào)控的一種動態(tài)可逆的修飾過程,能夠參與生物體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控和重塑染色質(zhì)結(jié)構(gòu)狀態(tài)等重要過程,進(jìn)而影響到動植物的生長發(fā)育。水稻作為單子葉植物的模式生物,一直是科學(xué)家重要的研究材料。然而在水稻發(fā)育過程中的組蛋白乙;揎椪{(diào)控基因表達(dá)和響應(yīng)逆境脅迫的機(jī)制研究還有待進(jìn)一步完善。因此,本研究主要以組蛋白乙酰化修飾作為研究對象,全面定性分析水稻葉片全蛋白的乙;揎椞卣鳌⒔Y(jié)合鹽脅迫處理重點(diǎn)解析組蛋白H4K5ac和H4K8ac修飾在全基因組的分布變化特征以及組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶基因GCN5和p300的功能分析。本研究的主要工作包括:1水稻全蛋白組賴氨酸乙;揎椀亩ㄐ苑治鲭S著蛋白組學(xué)分析技術(shù)的發(fā)展,對于蛋白功能的確定,翻譯后修飾的鑒定以及蛋白結(jié)構(gòu)的分析研究也越來越深入。本研究利用LC-MS/MS技術(shù)在水稻葉片中定性出1353個賴氨酸乙酰化修飾位點(diǎn),涉及866個蛋白,包括了多個新的組蛋白乙;揎... 

【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】:129 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

水稻鹽脅迫下組蛋白乙;揎椞卣骷癏ATs相關(guān)基因的功能研究


圖1.3p300/CBP蛋白的結(jié)構(gòu)域組成[65]??Figure?1.3?Domain?structure?

分布情況,乙酰化,抗體,賴氨酸


長三周的幼苗葉片全蛋白組的乙;揎椷M(jìn)行定性分析。通過利用泛賴氨酸乙酰化抗體??(anti-pan-Kac)對水稻根尖細(xì)胞的蛋白免疫熒光試驗,結(jié)果顯示賴氨酸乙;贵w在細(xì)胞??核里廣泛分布(圖2.1a)。在利用抗體獲得富集多肽后,我們對所有鑒定的多肽質(zhì)量進(jìn)行誤??差分析,發(fā)現(xiàn)整體誤差分布位于0值附近,并且大多數(shù)的峰值小于0.02Da?(圖2.1b),說??明質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量的準(zhǔn)確度可信。此外,大多數(shù)肽段的長度集年在8-20個氨基酸之間(圖??2.1c),與預(yù)測的胰蛋白酶酶切后片段長度范圍一致,說明多肽樣本制備的質(zhì)量高。定性分??析總計鑒定到866個蛋白被乙酰化,包括1353個賴氨酸乙;揎椢稽c(diǎn),其中多達(dá)54.3%??的多肽是被乙;摹榱朔治鲆阴;揎椢稽c(diǎn)在所有鑒定蛋白上的分布情況,我們統(tǒng)計??了每個蛋白上的修飾位點(diǎn)數(shù)目,其中69%的蛋白(594個)只包含了?1個乙酰化修飾位點(diǎn),??剩余31%的蛋白包含了?2個或以上的修飾位點(diǎn)(圖2.1d)。我們選擇部分蛋白(H3、H4和??Q0DWZ7)多肽生成質(zhì)譜圖進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與最終鑒定得到肽段間的修飾位點(diǎn)是匹配的(圖??2.2)。??

多肽,乙酰化,非組蛋白,賴氨酸


飾抗體的特異性結(jié)合。我們檢測了挑選的4組多肽經(jīng)過酶聯(lián)免疫后的450nm處的吸光度??〇D45Q值,與陰性對照的吸光值相比,不同多肽濃度反應(yīng)結(jié)果顯示試驗組/對照組的值均大??于2.1,認(rèn)為試驗結(jié)果為陽性(圖2.3b)。結(jié)果表明使用的賴氨酸乙;揎椀姆嚎贵w能夠??特異結(jié)合多肽上的乙酰基團(tuán),同時也驗證通過質(zhì)譜定性鑒定出的乙;亩我彩强尚诺摹??(a)?Protein?Peptide?Sequence???Q6H6C7?CPTM-161?GVTP-(acetyl)K-YSLK???CCTM-161?GVTPKYSLK???Q9LGH8?CPTM-163?IYIF-(acetyl)K-VLK???CCTM-163?IYIFKVLK???Q9LGH8?CPTM-164?LVLPGELA-(acetyl

【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]擬南芥組蛋白去乙;富蚣易宸治黾癆tSRT2在鹽脅迫下調(diào)控種子萌發(fā)的分子機(jī)制[D]. 鐘理.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]組蛋白乙;瘜λ净ㄆ凇⒒虮磉_(dá)以及雜種優(yōu)勢的表觀調(diào)控機(jī)制[D]. 李晨.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]水稻組蛋白去乙;富虻姆蛛x和功能鑒定[D]. 黃利民.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008



本文編號:2919862

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