牡丹(Paeonia suffruticosa),為多年生落葉灌木,隸屬芍藥科(Paeoniaeeae)芍藥屬(Paeonia)植物,是我國獨有的珍貴種質(zhì)資源。隨著近些年來的研究發(fā)現(xiàn)牡丹還是一類營養(yǎng)與保健價值較高的油料作物,是迄今為止發(fā)現(xiàn)較為合適人體營養(yǎng)的油脂,所以目前油用牡丹的發(fā)展日益壯大。目前對于油用牡丹的栽培育種方面研究報道較少,關(guān)于油用牡丹產(chǎn)量性狀分子標記輔助育種的研究還未見報道。本研究選取產(chǎn)油量較好、觀賞性較佳的36份牡丹品種,基于SSR分子標記的方法,對其進行遺傳多樣性分析,通過對該群體遺傳結(jié)構(gòu)分析確定其Q值,通過TASSEL軟件中的GLM分析,將牡丹的表型性狀與分子標記進行了關(guān)聯(lián)分析,從而實現(xiàn)部分產(chǎn)量相關(guān)性狀的定位,找到與油用牡丹產(chǎn)量性狀緊密連鎖的分子標記,為油用牡丹相關(guān)性狀的基因定位、遺傳改良和分子標記輔助育種等研究提供理論依據(jù)。1.該研究用16對SSR引物對36份牡丹種植資源進行PCR擴增,共檢測出65條條帶,每對引物所擴增出的條帶變幅為2到8不等,平均每一個標記條帶數(shù)為4.06;多態(tài)性信息含量(PIC)范圍為0.19-0.73,平均值為0.50;Shannon's信息指數(shù)變幅為0.42-1.59,平均為1.01;觀測純合度(Ho)變化范圍0.03-0.83,平均為0.37,期望雜合度(He)范圍為0.21-0.78,平均為0.56,各位點的期望雜合度值He(0.56)高于觀測雜合度Ho(0.37);平均雜合度(Ave Het)范圍0.20-0.77,平均為0.55;遺傳距離(Nei,)范圍為0.20-0.78,平均為0.56。通過各項指標證明了SSR標記表現(xiàn)出了更高的多態(tài)性,該群體具有較高的遺傳多樣性。2.基于UPGMA分析對所選的36個品種進行聚類,在相近系數(shù)為0.64的地方將供試品種分為兩個類群。第一類群包括35份種質(zhì)資源,墨池金輝(MCJH)單獨聚為一組,說明墨池金輝(MCJH)與其他品種之間有較遠的親緣關(guān)系。在相近系數(shù)0.67的地方,35個品種又分為兩個亞群,聚類結(jié)果與基本的分類學(xué)基本一致。通過聚類分析還發(fā)現(xiàn)聚類結(jié)果與油用牡丹的產(chǎn)量性狀和花色也存在著一定的關(guān)系。3.本研究利用之前得到的SSR位點,對36份所選試材的25個性狀,其中包括9個產(chǎn)量性狀、4個果實性狀和13個表型性狀進行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果共找到11個SSR位點與16個性狀相關(guān)聯(lián),其中在生長性狀指標中,有9個位點與9個性狀顯著相關(guān);在產(chǎn)量性狀指標中,有6個位點與6個性狀顯著相關(guān);在果實性狀中,僅蓇葖果長1個性狀與1個位點相關(guān)聯(lián)。其中與產(chǎn)量性狀相關(guān)聯(lián)分析中形成了6個極顯著(P0.01)的關(guān)聯(lián)事件,SSR12位點對聚合蓇葖果數(shù)表型變異解釋率達到了66.15%。本研究中,產(chǎn)量性狀與SSR分子標記的關(guān)聯(lián)分析是初次應(yīng)用于油用牡丹中,研究得出的相關(guān)聯(lián)SSR位點為油用牡丹相關(guān)性狀的基因定位、基因克隆和分子標記輔助育種等研究的開展奠定基礎(chǔ),并為高效發(fā)掘油用牡丹其他優(yōu)異基因資源及種質(zhì)創(chuàng)新提供科學(xué)依據(jù)。
【學(xué)位單位】：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：S565.9
【部分圖文】：

圖 1 牡丹 DNA 提取效果圖Figure.1 DNA of the Peony3.2.2 SSR 引物的篩選在 36 份牡丹樣品中隨機抽取 8 份材料對 38 對SSR引物進行初步的篩選，采用優(yōu)化后的PCR反應(yīng)體系進行擴增。結(jié)果表明 38 對SSR引物可以全部擴增出條帶，但是其中 11 對引物雖然有擴增條

R：CCATGATAAAAACACCCAAAG3.2.3 不同 SSR 位點牡丹群體的遺傳多樣性本研究共使用了16對SSR引物對36個牡丹品種進行了多樣性檢測（圖2）。通過運用 POPGENEVERSION 1.31 軟件分析，計算各標記的等位位點差異及遺傳多樣性參數(shù)見表 3，結(jié)果共檢測到65 條條帶，每對引物所擴增出的條帶變幅為 2 到 8 不等，平均每一個標記條帶數(shù)為 4.06。其中SSR12的標記位點最高，達到了 8。有效等位基因數(shù)（Ne）的變化范圍從 1.26（SSR3）到 4.34（SSR14），平均為 2.46。Shannon's 信息指數(shù)從 0.42（SSR3）到 1.59（SSR14），平均為 1.01。觀測純合度（Ho）從 0.03（SSR7）到 0.83（SSR3）

圖 3 36 份材料的聚類分析Figure3. Cluster analysis of 36 individuals.聚類結(jié)果表明，在相近系數(shù)為 0.64 的地方將供試品種分為兩個類群。墨池金輝（MCJH）單獨一組，其他 35 個品種聚為一組，說明墨池金輝（MCJH）與其他品種之間有較遠的親緣關(guān)系。近系數(shù) 0.67 的地方，35 個品種又分為兩個亞群，①亞群中包括 19 個品種，基本涵蓋了所有
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本文編號：2836933