月季HSF轉(zhuǎn)錄因子的功能驗證
【學(xué)位單位】:中南林業(yè)科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S685.12
【部分圖文】:
圖2.5月季的HR-A/B區(qū)氨基酸序?
因的氨基酸序列與擬南芥中的21個Jri*/氨基酸序列做系統(tǒng)進化分析,并構(gòu)建系逡逑統(tǒng)進化樹。根據(jù)已知的擬南芥家族成員的生物學(xué)功能對月季進行分類逡逑及初步的功能預(yù)測。系統(tǒng)進化樹(圖2.6)表明,18個月季蛋白和21個擬逡逑南芥方蛋白清楚的分成了邋A、B和C三類,功能相似的蛋白親緣關(guān)系較近,逡逑聚集在同一亞類。其中11個月季基因?qū)儆冢令,分別為及逡逑RcHsf6、RcHsf8、RcHsf9、RcHsfl邋0、RcHsfl邋2、RcHsfl邋3、RcHsfl邋4、RcHsfl邋6、RcHsflS,逡逑分別細致的被劃分到A1-A9這9個亞類,A1亞類有A2亞類逡逑的有及A3亞類的有處份/5,邋A4亞類的有及c/fc/5、A5亞類的逡逑有及c歷/9,邋A6亞類的有;?c份月、A8亞類的有也份//(?,A9亞類的有逡逑RcHsfi。B邋季邋B邋類邋RcHsf邋成黽有邋6邋個,分鎖是邋RcHsfl、RcHsf4、RcHsf7、RcHsfl邋1、逡逑RcHsfl5、RcHsfl7
邐月季HSF轉(zhuǎn)錄因子的功能驗證逡逑顯示(圖2.8):月季表達譜中有11個Unigene基因在高溫脅迫中表現(xiàn)出顯著表逡逑達差異。根據(jù)圖2.7中系統(tǒng)進化樹的結(jié)論來看,Unigene與月季全基因組比逡逑對,部分基因能找到同源性,屬于A類//SF的有6個,分別為contig245724、逡逑contigll3972、contig30356、contig328127、contigl0088、contigl0090;屬于邋B邋類逡逑HSF邋的有邋3邋個,分別為邋contig243625、contigl2075、contigl邋05424。其中,contigl邋0088、逡逑contigl0090邋與邐同源,contigl2075邋與邐同源,contig85416,邋contigl05424逡逑與邐同源,contig30356、contig328127邋與邐同源,contigll3972邋與逡逑及ci*/M邋同源,contig245724邋與邐(5邋同源,contig243625邋與及c開y//邋同源,逡逑contig60744與同源
【參考文獻】
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本文編號:2815888
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