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小麥抗倒伏相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-25 22:56
【摘要】:倒伏是制約小麥高產(chǎn)的重要因素之一,鑒定抗倒伏相關(guān)位點(diǎn),挖掘相關(guān)分子標(biāo)記,可以為分子標(biāo)記輔助育種提供理論依據(jù)。本研究以黃淮麥區(qū)含120份小麥品種的自然群體為供試材料,在小麥乳熟期對(duì)其基部莖稈相關(guān)性狀、株高、節(jié)間長、穗鮮重、千粒重、小麥苗期根系總長進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:1、對(duì)120份小麥品種組成的自然群體進(jìn)行19個(gè)形態(tài)學(xué)性狀的調(diào)查統(tǒng)計(jì)。相關(guān)性分析表明:部分性狀呈極顯著相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)最大的為基部第三節(jié)間莖稈粗度與基部第二節(jié)間莖稈粗度,相關(guān)系數(shù)為0.964,說明性狀間相互聯(lián)系,共同影響小麥的抗倒伏能力。2、利用小麥90K基因芯片對(duì)自然群體進(jìn)行基因分型,剔除缺失率較高及顯著偏離的標(biāo)記,共檢測到覆蓋小麥全基因組的27912個(gè)多態(tài)性標(biāo)記,對(duì)19個(gè)形態(tài)學(xué)性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明:在顯著水平-lg(p)≥4下,一般線性模型檢測到366個(gè)顯著關(guān)聯(lián)的SNP標(biāo)記,混合線性模型檢測到35個(gè)顯著關(guān)聯(lián)的SNP標(biāo)記,這些顯著SNP所能解釋的表型變異在10.72%~24.93%范圍內(nèi)。兩種模型檢測一致的SNP標(biāo)記數(shù)為26個(gè),與9個(gè)形態(tài)學(xué)性狀相關(guān),這些顯著關(guān)聯(lián)的SNP標(biāo)記分布在1B、2B、2D、3A、3B、3D、5B、6A、7A、7D染色體上。3、一般線性模型和混合線型模型共同檢測到的與莖桿相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有9個(gè),其中與基部第三節(jié)莖稈粗度關(guān)聯(lián)的位于2D染色體上的Kukri_c40621_513對(duì)表型的貢獻(xiàn)率最大,為24.04%;與株高及節(jié)間長顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有13個(gè),其中與基部第一節(jié)間長關(guān)聯(lián)的位于1B染色體上的Excalibur_c60931_1260對(duì)表型的貢獻(xiàn)率最大,為21.06%;與穗鮮重顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有3個(gè),都位于6A染色體上,具體標(biāo)記為wsnp_Ex_rep_c66433_64661643、Kukri_c22149_276、Tdurum_contig83190_441,對(duì)表型的貢獻(xiàn)率均為16.87%;與去離子水培養(yǎng)苗期根系總長顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有1個(gè),為5B染色體上的IAAV5315,對(duì)表型的貢獻(xiàn)率為21.46%。
【學(xué)位授予單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S512.1
【圖文】:

示意圖,小麥莖稈,折斷力,植物科學(xué)


圖 1 小麥莖稈折斷力測定Figure 1 Determination of wheat stem breaking forc 2 小麥莖稈強(qiáng)度測定示意圖(引自韓新峰,2014diagram of wheat stem stalk strength determination(ci尼亞大學(xué) Davis 分校植物科學(xué)系生物斯州立大學(xué)共同開發(fā)的小麥 90K 基

示意圖,小麥莖稈,強(qiáng)度測定,示意圖


15圖 2 小麥莖稈強(qiáng)度測定示意圖(引自韓新峰,2014)Figure 2 Schematic diagram of wheat stem stalk strength determination(cited from Zhang, 2014)NP 基因型判定用由美國加利弗尼亞大學(xué) Davis 分校植物科學(xué)系生物技術(shù)檢測中心利na 公司和美國堪薩斯州立大學(xué)共同開發(fā)的小麥 90K 基因芯片對(duì)本研究所進(jìn)行基因分型。

表型頻率,莖稈,分布直方圖,基部


圖 3 莖稈各表型頻率分布直方圖Figure 3 Stem phenotype frequency distribution histogram注:a. 基部第二節(jié)莖稈粗度;b. 基部第三節(jié)莖稈粗度;c. 基部第二節(jié)莖稈壁厚;d. 基部第三節(jié)莖稈壁厚;e. 基二節(jié)莖稈折斷力;f. 基部第三節(jié)莖稈折斷力Note: a. The second basal stem diameter; b. The third basal stem diameter; c. The second basal stem wall thickness; third basal stem wall thickness; e. The second basal stem breaking force; f. The third basal stem breaking force3.1.2 株高及節(jié)間長的表型分析小麥的株高、節(jié)間長也是影響小麥倒伏的重要因素,株高過高小麥易倒伏,又會(huì)影響產(chǎn)量,所以對(duì)株高最適范圍的研究尤為重要。從表 3 可以看出,株高的值為 131.41cm,最小值為 66.30cm,極差達(dá) 65.11cm,平均值為 88.99cm;基部第間長最大值為 9.23cm,最小值為 0.00cm,極差達(dá) 9.23cm,平均值為 1.62cm;基二節(jié)間長最大值為 16.43cm,最小值為 3.03cm,極差達(dá) 10.37cm,平均值為 7.58c基部第三節(jié)間長最大值為 19.39cm,最小值 5.48cm,極差達(dá) 13.91cm,平均值10.52cm;基部第四節(jié)間長最大值為 27.05cm,最小值為 8.26cm,極差達(dá) 18.79cm

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號(hào):2804313

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