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陸地棉栽培品種與野生種系尖斑棉雜交群體產量及纖維品質QTL定位

發(fā)布時間:2020-07-29 16:42
【摘要】:棉花是世界上首要的纖維作物,同時也是重要的油料和蛋白質來源。陸地棉作為被廣泛栽培的棉種之一,雖然具有良好的適應性和豐產性,但纖維品質較海島棉差,且種內遺傳多樣性低。而且現(xiàn)代紡織業(yè)對棉花纖維品質的要求越來越高,因此要求廣大育種學家培育出優(yōu)質高產品種。由于棉花產量、纖維品質等性狀為數(shù)量性狀,故傳統(tǒng)育種方法培育棉花新品種進展緩慢。陸地棉野生種系具有較好的抗病蟲、耐鹽堿、抗旱等優(yōu)點,同時具有結鈴數(shù)多、彩色纖維等特性。因此鑒定陸地棉野生種系的產量、纖維品質性狀QTL有利等位基因,對豐富陸地棉種質資源和分子標記輔助選擇具有重要意義。本研究利用陸地棉優(yōu)質品系金農07與陸地棉野生種系尖斑棉TX-230雜交,建立(金農07×TX-230)F_2群體,構建(金農07×TX-230)F_2群體SSR標記遺傳連鎖圖譜,定位棉花產量、纖維品質性狀QTL,為陸地棉分子標記輔助選擇奠定基礎。研究結果如下:1.親本間SSR引物多態(tài)性利用14864對引物對親本間的多態(tài)性進行篩選,最終得到747對多態(tài)性引物,多態(tài)性比例為5.03%。以747對多態(tài)性引物檢測F_2群體的標記基因型,共獲得755個位點,8對引物出現(xiàn)雙位點。2.遺傳圖譜對755個位點進行遺傳連鎖分析,構建的遺傳連鎖圖譜包含41個連鎖群,總重組長度為3428cM,標記間平均距離為4.54cM,覆蓋四倍體棉花基因組的76.9%。其中A亞組有287個標記位點,覆蓋長度為1622.5cM,標記間平均距離為5.65cM;D亞組有465個標記位點,覆蓋重組長度為1805.5cM,標記間平均距離為3.88cM。A亞組有80個偏分離標記,偏分離標記比例為27.9%;D亞組有123個偏分離標記,偏分離標記比例為26.5%。3.產量和纖維品質性狀QTL共定位到118個產量和纖維品質性狀QTL,其中41個為產量性狀QTL,77個為纖維品質性狀QTL。有12個QTL在兩個環(huán)境中檢測到,2個QTL在3個環(huán)境中均能檢測到。3個環(huán)境中均能檢測到的QTL分別是位于11染色體的qFM11.1和21染色體的qLP21.1。這些在2個或3個環(huán)境檢測到的穩(wěn)定QTL,可進行下一步精細定位和圖位克隆研究。
【學位授予單位】:西南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S562
【圖文】:

作圖親本,多態(tài)性,引物


子指 SI -0.261* 0.123纖維長度 FL 0.087 0.199 0.139整齊度 FU 0.292** 0.197 0.123 0.482**比強度 FS -0.005 0.087 0.073 0.638** 0.358**馬克隆值 FM 0.215* 0.128 0.181 -0.022 0.173 -0.064伸長率 FE 0.003 0.199 0.133 0.734** 0.385** 0.646** 0.239*:*. **分別表示達 0.05 和 0.01 概率水準顯著ote:*. ** denote significance at 0.05. 0.01 levels respectively4.2 遺傳圖譜構建4.2.1 親本間引物多態(tài)性篩選本研究利用 14864 對 SSR 引物在親本金農 07 和尖斑棉 TX-230 間的多態(tài)性共獲得 747 對有效多態(tài)性引物,多態(tài)性比例為 5.03%,圖 4-9 為部分 SSR 引物在親本間多態(tài)性的篩選。不同的 SSR 引物間的差異性很大,其中多態(tài)性最好的引物是 BNL 引物,多態(tài)性比例為 9.26%,其次是 NAU 引物,多態(tài)性比例 9.02%。多態(tài)性最差的引物是 NBRI,多態(tài)性比例僅為 2.33%(表 4-1)。

群體,標記基因,引物,單株


COT 42 1 2.38%DOW 95 6 6.32%DPL 864 58 6.71%Gh 698 41 5.87%HAU 312 26 8.33%JESPR 313 11 3.51%NAU 792 72 9.08%NBRI 2232 52 2.33%SHIN 288 9 3.13%SWU 5094 334 6.56%其他 4 4 100%總數(shù) 14864 747 5.03%4.2.2 群體標記基因型檢測利用 747 對 SSR 引物檢測(金農 07 TX-230)F2群體 184 個單株的標記基因型(圖 4-10),共得到 763 個位點,其中 8 個標記位點未被定位到染色體上;8 對引物檢測到了到了雙位點,占多態(tài)性引物的 1.07%。

纖維品質,群體遺傳,產量,重度


圖 4-11 群體遺傳圖譜和產量及纖維品質 QTLFig. 4-11 Genetic maps and QTL for yield and fiber quality.注:*,**,***分別表示輕度偏分離標記(P㩳0.05),中度偏分離標記(P㩳0.01),重度偏分離標記(P㩳0.001)。Note: *,**,*** indicate distortion locus with P㩳0.05, P㩳0.01 and P㩳0.001, respectively4.3 產量和纖維品質性狀相關 QTL采用多區(qū)間作圖法對群體產量和纖維品質相關 QTL 進行分析,共檢測到 118個 QTL。其中 41 個產量相關 QTL,包含 15 個衣分 QTL、14 個鈴重 QTL 和 12 個子指 QTL;76 個纖維品質相關 QTL,包含 13 個纖維長度 QTL、18 個纖維整齊度QTL、17 個纖維比強度 QTL、15 個馬克隆值 QTL、14 個纖維伸長率 QTL。LOD值范圍為 2.00-6.96,解釋表型變異 9.6%-29.4%。其中 2 個 QTL 在 3 個環(huán)境中均能檢測到,12 個 QTL 在兩個環(huán)境中檢測到。4.3.1 產量性狀 QTL衣分在 3 個環(huán)境下共檢測到 15 個 QTL,分別位于 12 條染色體上(表 4-10)。15 個 QTL 的加性效應值從-2.36 至 1.31,解釋表型變異范圍為 9.7%-29.4%,LOD

【參考文獻】

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10 李駿智;利用陸海雜種BC_1群體構建棉花遺傳連鎖圖譜及產量和纖維品質性狀相關QTL的初步定位[D];湖南農業(yè)大學;2009年



本文編號:2774229

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