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利用EST-SSR分子標記構建小麥遺傳圖譜

發(fā)布時間:2020-07-05 02:32
【摘要】:遺傳圖譜在作物的遺傳改良、加快育種進程和功能基因定位與克隆的研究中起著十分重要的作用。隨著現(xiàn)代分子生物學的不斷發(fā)展,越來越多的分子標記被開發(fā),分子標記輔助選擇育種技術給育種帶來了新的方法和途徑。本研究以川麥42與川農(nóng)16雜交后自交獲得的重組自交系群體和Syn-SAU-1與三雌蕊突變體(TP)雜交后的F_2群體為材料,采用EST-SSR分子標記技術,整合前人的分子標記,構建了兩張小麥的遺傳圖譜,具體結(jié)果如下:1.利用585對EST-SSR引物對川麥42和川農(nóng)16及其雜交后的重組自交系群體進行PCR擴增,其中有555對引物有擴增產(chǎn)物,有效率為94.87%;其中69對引物在兩個親本中表現(xiàn)出多態(tài)性,多態(tài)率為11.79%。2.通過Joinmap4.0作圖,獲得川麥42×川農(nóng)16重組自交系群體的遺傳圖譜,該圖譜共包含14個連鎖群,由168個標記組成,包括73個FSRAP標記,75個SSR標記,20個EST-SSR標記,覆蓋基因組長度1680.2cM,標記間平均距離10cM。EST-SSR標記共20個,在1B染色體上分布最多,有4個;1A,4A上各2個,3A、5A、6A、7A、2B、3B、4B、5B、3D、6D、7D上各一個。3.利用230對SSR引物對三雌蕊突變體(TP)和Syn-SAU-1及其雜交后的F_2群體進行了PCR擴增,共檢測出710個等位變異位點,每對引物平均擴增出3個變異位點,具有多態(tài)性的差異位點在D組(74.0%)分布最高,B組其次(60.5%),A組最低(59.7%)。4.利用317對EST-SSR引物對三雌蕊突變體(TP)和Syn-SAU-1及其雜交后的F_2群體進行PCR擴增,其中60對引物表現(xiàn)多態(tài)性,占所用EST-SSR引物的18.92%。利用上述SSR標記和EST-SSR標記,以TP×Syn-SAU-1的F_2群體為作圖群體構建了小麥的遺傳圖譜,該框架圖譜包含5個連鎖群,由26個標記組成,包括9個SSR標記,17個EST-SSR標記,覆蓋基因組長度1023.7cM,標記間平均距離39.37cM。
【學位授予單位】:西華師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S512.1
【圖文】:

數(shù)目,小麥,情況,作物


圖 1 小麥近年來 EST 數(shù)目情況Fig.1 EST number of Triticum aestivum in recent years表 1 NCBI 已登陸的不同谷類作物的 EST 數(shù)目Tab.1 The number of ESTs for different cereal crops that NCBI has lande物名稱ame of theopESTs 數(shù)目number ofESTs作物名稱Name of thecropESTs 數(shù)目number ofESTs作物名稱Name of thecropESTs 數(shù)number ESTs麥iticumstivum1400744 大麥Hordeumvulgare828843 燕麥Avena sativa25370米a mays2019896 高粱Sorghumvulgare209853 黑麥Secale cereale15902稻ryza sativa1255251 粟Setaria italica66052 蕎麥Fagopyrumesculentum173

基元,類型,引物,親本


圖 3-1 不同重復基元類型在 EST-SSR 中分布Fig.3-1 Nucleiotied repeat motifs in the SSR site麥 42、川農(nóng) 16 遺傳差異分析 引物有效性分析用兩個親本川麥 42、川農(nóng) 16 對合成的 585 對 EST-SSR 引物進行篩選驗55 對在兩個親本中均能獲得條帶清晰、大小在 100-300bp 的擴增產(chǎn)物,標記,有效性為 94.87%;其余 30 對為無效引物,其中 22 對引物沒有擴comp09、comp37、comp49、comp55、comp70、comp73、comp74、comp03、comp116、comp119、comp121、comp170、comp220、comp221、comp263、comp512、comp536、comp537、comp538、comp556),2 對引物的分子量過大(com66、comp114),6 對引物的擴增產(chǎn)物分子量太。╟om124、comp237、comp238、comp239、comp246)。 引物多態(tài)性分析成的 585 對引物中共有 516 對引物的擴增產(chǎn)物條帶相同,占 88.21%,其物在兩個親本中表現(xiàn)出多態(tài)性,將這 69 對引物在 20 個子代樣本中進一

【參考文獻】

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本文編號:2741953

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