微生物多樣性研究對微生物資源的開發(fā)利用與環(huán)境保護(hù)具有重要意義。本研究通過PCR-DGGE（PCR-Denaturing Gradinent Gel Electrophoresis）技術(shù)對內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤細(xì)菌、真菌、放線菌的多樣性與群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。研究結(jié)果顯示,針對內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤沙粒含量高的特點,將物理、化學(xué)與酶法相結(jié)合的DNA提取方法可以獲得高質(zhì)量的土壤總DNA。內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤微生物資源非常豐富,優(yōu)勢菌菌種種類相對較多,其中細(xì)菌的豐富度是最高的,細(xì)菌優(yōu)勢菌群主要包括Proteobacteria（變形菌門）、Bacteroidetes（擬桿菌門）、Firmicutes（厚壁菌門）、Actinobacteria（放線菌門）、Acidobacteria（酸桿菌門）、Gemmatimonadetes（芽單胞菌門）、Nitrospira（硝化螺旋菌門）。放線菌優(yōu)勢菌群包括Saccharopolyspora（糖多孢菌屬）Thermomonospora（高溫單孢菌屬）、Streptomyces（鏈霉菌屬）、Iamiaceae（酸微菌屬）、Corynebacterium（棒桿菌屬）、Ti... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 土壤微生物多樣性
    1.2 變性梯度凝膠(DGGE)技術(shù)
        1.2.1 基本原理
        1.2.2 DGGE應(yīng)用
    1.3 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.4 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤概況
    1.5 本課題研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 材料
        2.1.1 土壤樣品
        2.1.2 PCR引物
        2.1.3 主要實驗試劑
        2.1.4 主要儀器與設(shè)備
        2.1.5 圖像處理軟件及序列分析軟件
    2.2 實驗方法
        2.2.1 土壤總DNA提取
        2.2.2 PCR反應(yīng)條件
        2.2.3 DGGE條件
        2.2.4 DGGE方法
        2.2.5 DGGE切膠回收方法（膠回收用了兩種方法）
        2.2.6 序列測定及分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 土壤總DNA提取方法的優(yōu)化
    3.2 DGGE圖譜重復(fù)性檢驗
    3.3 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤細(xì)菌多樣性
        3.3.1 細(xì)菌16S rDNA基因片段的PCR擴(kuò)增
        3.3.2 PCR產(chǎn)物的DGGE分析
        3.3.3 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤細(xì)菌多樣性分析
        3.3.4 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤細(xì)菌16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
    3.4 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤真菌多樣性
        3.4.1 真菌18S rDNA片段的PCR擴(kuò)增
        3.4.2 PCR產(chǎn)物的DGGE分析
        3.4.3 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤真菌多樣性分析
        3.4.4 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤真菌18S rDNA系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
    3.5 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤放線菌多樣性
        3.5.1 放線菌16S rDNA片段的PCR擴(kuò)增
        3.5.2 PCR產(chǎn)物的DGGE分析
        3.5.3 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤放線菌多樣性分析
        3.5.4 內(nèi)蒙古西部地區(qū)土壤放線菌16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
4 討論
    4.1 內(nèi)蒙古西部地區(qū)微生物多樣性
    4.2 不同土壤微生物多樣性分析
    4.3 相同類型土壤微生物多樣性受多種因素影響
    4.4 土壤總DNA的提取
    4.5 DGGE膠回收
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[4]內(nèi)蒙古荒漠草原不同退化階段土壤微生物變化的研究[D]. 吳永勝.內(nèi)蒙古師范大學(xué) 2008
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本文編號：3568930