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高脲酶活性褐土的宏基因組測(cè)序與微生物來(lái)源脲酶基因的篩選

發(fā)布時(shí)間:2024-06-29 20:00
  為明確褐土中產(chǎn)脲酶微生物的來(lái)源,采集河南省鄭州、洛陽(yáng)、許昌、平頂山和安陽(yáng)5個(gè)產(chǎn)區(qū)的土樣并檢測(cè)其脲酶活性,將脲酶活性最高的土樣進(jìn)行富集培養(yǎng),提取土壤DNA構(gòu)建宏基因組文庫(kù),采用宏基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)褐土中的產(chǎn)脲酶微生物進(jìn)行分析。結(jié)果表明:褐土脲酶活性在8.34~67.18μg·d-1·g-1之間。各取樣點(diǎn)脲酶活性最高值分別為46.98、67.18、57.68、45.97和64.15μg·d-1·g-1。利用宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝,篩選到406個(gè)脲酶結(jié)構(gòu)蛋白和437個(gè)脲酶輔助蛋白;物種注釋表明,褐土中產(chǎn)脲酶微生物以細(xì)菌為主,以及少部分真菌和古細(xì)菌。產(chǎn)脲酶細(xì)菌與鏈霉菌屬(Streptomyces)、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)和不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)等親緣關(guān)系最近,與產(chǎn)脲酶真菌親緣關(guān)系較近的有足馬杜拉分枝菌(Madurella mycetomatis)、藍(lán)莓枝枯病菌(Neofusicoccum parvum)和嗜熱毛殼菌(Chaetomium thermophilum)等;產(chǎn)脲酶古細(xì)菌與亞硝化球菌屬(Nitrososphaera)和氨氧化古菌屬(Nitrosopu...

【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 土壤樣品的采集
    1.2 土壤脲酶活性的測(cè)定
    1.3 產(chǎn)脲酶菌的富集培養(yǎng)
    1.4 宏基因組測(cè)序
    1.5 基因預(yù)測(cè)與生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 褐土脲酶酶活性的檢測(cè)
    2.2 褐土中產(chǎn)脲酶微生物的富集培養(yǎng)與宏基因組測(cè)序
    2.3 基因預(yù)測(cè)與脲酶蛋白篩選
    2.4 脲酶和脲酶輔助蛋白的來(lái)源
    2.5 富集培養(yǎng)后褐土中產(chǎn)脲酶微生物的豐度
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào):3997870

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