桃小食心蟲(chóng)Carposina sasakii(Matsumura)又名桃蛀果蛾,屬鱗翅目Lepidoptera蛀果蛾科Carposinidae,是我國(guó)果樹(shù)生產(chǎn)中為害最嚴(yán)重的蛀果類害蟲(chóng)之一。迄今,有關(guān)桃小食心蟲(chóng)是否存在寄主相關(guān)性遺傳分化尚有待證實(shí),且該害蟲(chóng)在我國(guó)不同地理種群間的遺傳結(jié)構(gòu)尚不清楚。為此,本研究利用開(kāi)發(fā)獲得的微衛(wèi)星分子標(biāo)記和已經(jīng)報(bào)道的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基I(COXI)基因兩種分子標(biāo)記探究了桃小食心蟲(chóng)在我國(guó)主要發(fā)生區(qū)的寄主相關(guān)性種群和地理種群的遺傳結(jié)構(gòu),并分析了影響遺傳結(jié)構(gòu)的因素。主要研究結(jié)果如下:(1)桃小食心蟲(chóng)微衛(wèi)星標(biāo)記開(kāi)發(fā)利用Illumina Miseq高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)桃小食心蟲(chóng)進(jìn)行基因組測(cè)序,獲得4.70 GB原始測(cè)序數(shù)據(jù),組裝得到479 Mb基因組隨機(jī)序列。基于桃小食心蟲(chóng)基因組隨機(jī)序列搜索得到95,153個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),其中重復(fù)單元為2堿基的數(shù)量最多(57.34%)。挑選了64個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行初步擴(kuò)增效果和多態(tài)性分析,有35個(gè)位點(diǎn)表現(xiàn)較好。利用來(lái)自北京和湖北的2個(gè)桃小食心蟲(chóng)種群(63個(gè)個(gè)體)對(duì)35個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)進(jìn)行遺傳多樣性檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)微衛(wèi)星位點(diǎn)等位基因數(shù)量范圍為2～9個(gè),平均...

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
1 前言
    1.1 桃小食心蟲(chóng)的分布與危害
    1.2 寄主植物對(duì)桃小食心蟲(chóng)生物學(xué)的影響
        1.2.1 寄主植物對(duì)桃小食心蟲(chóng)生長(zhǎng)發(fā)育、存活和繁殖的影響
        1.2.2 寄主植物對(duì)桃小食心蟲(chóng)滯育、發(fā)生世代的影響
        1.2.3 寄主植物對(duì)桃小食心蟲(chóng)出土、交配、產(chǎn)卵習(xí)性的影響
    1.3 植食性昆蟲(chóng)種群遺傳分化的影響因素
        1.3.1 寄主植物對(duì)植食性昆蟲(chóng)遺傳分化的影響
        1.3.2 地理隔離對(duì)植食性昆蟲(chóng)遺傳分化的影響
        1.3.3 歷史事件對(duì)植食性昆蟲(chóng)遺傳分化的影響
    1.4 桃小食心蟲(chóng)種群遺傳結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展
        1.4.1 寄主相關(guān)性種群遺傳分化研究概況
        1.4.2 地理種群遺傳結(jié)構(gòu)研究概況
    1.5 昆蟲(chóng)群體遺傳結(jié)構(gòu)研究的分子標(biāo)記技術(shù)
        1.5.1 RFLP
        1.5.2 RAPD
        1.5.3 AFLP
        1.5.4 mtDNA
        1.5.5 SSR
        1.5.6 SNP
    1.6 本研究的目的及意義
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)儀器與試劑
        2.1.1 試驗(yàn)儀器
        2.1.2 試驗(yàn)試劑和試劑盒
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 樣本的采集與鑒定
        2.2.2 DNA提取與保存
        2.2.3 基因組隨機(jī)序列的測(cè)定
        2.2.4 微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì)
        2.2.5 引物篩選及多態(tài)性檢驗(yàn)
        2.2.6 微衛(wèi)星分型和線粒體序列測(cè)序
        2.2.7 PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)
    2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
        2.3.1 微衛(wèi)星開(kāi)發(fā)的數(shù)據(jù)分析
        2.3.2 種群遺傳結(jié)構(gòu)及其影響因素分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 桃小食心蟲(chóng)微衛(wèi)星標(biāo)記開(kāi)發(fā)
        3.1.1 基因組隨機(jī)序列
        3.1.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)分布
        3.1.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)特征
    3.2 桃小食心蟲(chóng)種群遺傳結(jié)構(gòu)及其影響因素
        3.2.1 種群遺傳多樣性
        3.2.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記分辨率和無(wú)效等位基因?qū)z傳差異分析的影響..
        3.2.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)
        3.2.4 遺傳分化與環(huán)境因子和地理距離間的相關(guān)性
        3.2.5 單倍型網(wǎng)狀圖與分化時(shí)間
        3.2.6 擴(kuò)散路徑
4 結(jié)論與討論
    4.1 結(jié)論
    4.2 討論
        4.2.1 桃小食心蟲(chóng)的種群遺傳分化
        4.2.2 歷史事件對(duì)桃小食心蟲(chóng)種群分化的影響
        4.2.3 地理隔離與環(huán)境因子對(duì)桃小食心蟲(chóng)種群分化的影響
參考文獻(xiàn)
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
個(gè)人簡(jiǎn)介
致謝



本文編號(hào)：4044248