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哈茨木霉Th-33 GαⅢ基因thga3的功能研究

發(fā)布時間:2024-05-13 22:37
  研究生防菌木霉菌(Trichoderma)的信號傳遞和調控機制,對探索木霉菌生防機制、提高生防效果有重要的意義。G蛋白是一種GTP結合蛋白,介導的細胞跨膜信號傳遞系統(tǒng)在調控真菌的生長、產孢、代謝、致病性等過程中發(fā)揮了重要的作用。典型的絲狀真菌G蛋白由α、β和γ3個亞基組成,其中Gα亞基包括GαⅠ、GαⅡ、GαⅢ三個類群。一般認為,GαⅢ亞基的功能主要表現(xiàn)為影響細胞壁結構相關酶的活性、細胞壁結構、菌株致病力等,并可能負調控真菌的產孢。本研究采用基因敲除、回復突變技術,結合轉錄組測序和分析,研究了哈茨木霉GαⅢ亞基的功能。從哈茨木霉Th-33全基因組序列獲得GαⅢ亞基基因thga3序列信息,在基因組中的序列編號為Tha08474,通過PCR擴增獲得thga3基因片段并進行生物信息學分析,完整thga3基因的開放閱讀框為1068bp,共編碼355個氨基酸,GenBank登錄號為KY937956。與綠木霉(T.virens XP013955540.1)GαⅢ亞基的相似性為99%,與深綠木霉(T.atroviride XP0139...

【文章頁數(shù)】:103 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1G蛋白信號途徑的基本組成部分Fig.1ThebasiccomponentsoftheGproteinsignalingsystem

圖1.1G蛋白信號途徑的基本組成部分Fig.1ThebasiccomponentsoftheGproteinsignalingsystem

游效應因子(Effector)、以及G蛋白信號調控蛋白(RgulatorsofGproteinsignaling,RGS)(Laal.,2006;劉增亮等,2014)如圖1.1(李利等,2013)。G蛋白信號調控蛋白是一種GTPase激白(GTPas....


圖1.2G蛋白循環(huán)Fig.1.2TheGproteincycle

圖1.2G蛋白循環(huán)Fig.1.2TheGproteincycle

cAMP-PKA途徑影響致病因子黑色素和多糖莢膜的產生以及交配virens)作用于酸苷類,對細胞和亞細胞的移動有重要的作用,對產孢的影響未知KH.atroviridis)負調控產孢,影響抗菌肽的形成KT.reesei)參與了細胞壁降解酶的產生,參與重寄生過程,調控細....


圖2.1thga3基因的全長DNA以及cDNA的擴增M:250bpDNALadderMarker,1、Th-33基因組DNA,2、Th-33cDNA

圖2.1thga3基因的全長DNA以及cDNA的擴增M:250bpDNALadderMarker,1、Th-33基因組DNA,2、Th-33cDNA

第二息學分析,以及NCBI在線工具,ORFfinle分析編碼蛋白質的疏水性;利用signal4.1分析翻譯后信號肽;用MEGA6.0構建系統(tǒng)進化樹?寺為引物,以Th-33基因組DN野生菌哈茨木霉Th-33總RNAPCR擴增,目的片段大小為1....


圖2.3thga3基因編碼氨基酸序列的疏水性預測

圖2.3thga3基因編碼氨基酸序列的疏水性預測

NAMAN軟件以及NCBI在線工具,ORFfinder分析thga3的開放閱讀長度為1068bp的完整的開放閱讀框。將thga3基因的DNA序列與軟件中進行序列比對,結果顯示thga3基因序列中共有6個外顯子,5長度為1068bp,6個外....



本文編號:3972814

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