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鏈格孢菌比較基因組及bZIP轉(zhuǎn)錄因子功能研究

發(fā)布時間:2024-04-01 21:28
  柑橘褐斑病是柑橘上的重要病害,可引起大量落葉、落果、枯梢等嚴重問題。柑橘褐斑病菌可分泌一種寄主;远舅(Host Selective Toxins,HSTs)-ACT毒素,只;詾楹μ囟ɑ蛐偷拈、葡萄柚、雜交橘橙或橘柚。病菌分生孢子在萌發(fā)時即可產(chǎn)生ACT毒素,這些毒素進入細胞后破壞其質(zhì)膜系統(tǒng),引起電解質(zhì)滲漏和細胞死亡,然后從死亡的寄主細胞獲取營養(yǎng)而生長。目前對柑橘褐斑病的病原種類尚有爭議,為了解決這個問題,本研究對來自我國不同地區(qū)、不同柑橘品種上分離的78個鏈格孢菌株進行了全基因組測序和比較分析。轉(zhuǎn)錄因子又稱為反式作用元件,其DNA結(jié)合域能與特定的靶基因上游啟動子區(qū)域的順式作用元件產(chǎn)生特異性結(jié)合,從而調(diào)控靶基因時空表達,調(diào)控生命活動。堿性亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物特有的DNA結(jié)合域氨基端富含堿性氨基酸,羧基端含有亮氨酸拉鏈的轉(zhuǎn)錄因子家族。雖然bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族基因在一些真菌有所報道,但在鏈格孢屬真菌尚無系統(tǒng)研究。本研究首先通過生物信息學分析方法鑒定了柑橘褐斑病菌Z7菌株中的所有bZIP轉(zhuǎn)錄因子,利用同源重組技術(shù)敲除其中13個bZI...

【文章頁數(shù)】:184 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1?2016年世界主要柑橘類水果生產(chǎn)國家的產(chǎn)量統(tǒng)計表(計量單位:噸)??Fig.?1.1?Production?statistic?of?the?world's?major?citrus?fruit?producer?in?2016?(tons)??Data?source:?Economic?and?Social?Depar?

圖1.1?2016年世界主要柑橘類水果生產(chǎn)國家的產(chǎn)量統(tǒng)計表(計量單位:噸)??Fig.?1.1?Production?statistic?of?the?world's?major?citrus?fruit?producer?in?2016?(tons)??Data?source:?Economic?and?Social?Depar?

?第一章緒論??萬畝,總產(chǎn)量為3792萬噸,占世界柑橘產(chǎn)量的26%?(見圖1.1)。在中國,柑橘種植面積已??經(jīng)超過蘋果,產(chǎn)量略低于蘋果,是全國第二大水果。栽培柑橘的省、直轄市、自治區(qū)共有??22個,主要集中在廣西、湖南、廣東、湖北、四川、福建、江西、重慶、浙江、和云南1〇??個....


圖1.2鏈格孢褐斑病、粗檸檬葉斑病和墨西哥萊蒙葉斑病的分布??Fig.?1.2?Distribution?of?Altemaria?citrus?disease?in?the?world??

圖1.2鏈格孢褐斑病、粗檸檬葉斑病和墨西哥萊蒙葉斑病的分布??Fig.?1.2?Distribution?of?Altemaria?citrus?disease?in?the?world??

產(chǎn)生黑腐病癥狀。因此,柑橘黑腐病病原菌可能包括來自不同遺傳譜系的鏈格孢(4??。在四種鏈格孢引起的柑橘病害中,以相■橘褐斑病在全世界分布最廣,對世界??柑橘產(chǎn)業(yè)的破壞最為嚴重(見圖1.2)。??-50?W??*"■?.?■>?<??,-?,?S*k??-100?0?100?260....


圖1.6粗糙脈孢菌CYS3的DNA保守結(jié)合位點??-

圖1.6粗糙脈孢菌CYS3的DNA保守結(jié)合位點??-

Aspartate??甲確氰酸合成B途輕??圖1.5真菌甲硫氨酸的生物合成機制??Fig.?1.5?Sulfate?assimilation?and?methionine?biosynthesis?pathways?in?fungi??1.3.2真菌甲硫氨酸合成途徑的關(guān)鍵基因??....


圖2.2?利用Mauve對SPAdes和ALLPATHS-LG拼接Z7基因組與A?altNL03003參??考基因組的比較(第一排為ALLPATHS-LG拼接的基因組,第二排為SPAdes拼接的基因組,??第三排為A?so/<7?z_?altNL03003的參考基因組)??

圖2.2?利用Mauve對SPAdes和ALLPATHS-LG拼接Z7基因組與A?altNL03003參??考基因組的比較(第一排為ALLPATHS-LG拼接的基因組,第二排為SPAdes拼接的基因組,??第三排為A?so/<7?z_?altNL03003的參考基因組)??

???I?I?IP?I?J?^?IP?s?l?iw?m??圖2.1利用MUMMER對SPAdes和ALLPATHS-LG拼接Z7基因組的比較(橫坐標為??SPAdes拼接結(jié)果,以SP開頭代表不同Scaffolds,縱坐標為ALLPATHS-LG,以SA開頭)??Fig.2.1?C....



本文編號:3945336

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