小綠葉蟬族分子系統(tǒng)發(fā)育研究(半翅目:葉蟬科:小葉蟬亞科)
發(fā)布時間:2024-03-28 01:32
小綠葉蟬族Empoascini隸屬半翅目Hemiptera、葉蟬科Cicadellidae,是小葉蟬亞科Typhlocybinae中的第二大類群,全世界已知85屬1100余種,在世界各大動物地理區(qū)均有分布,我國目前已知38屬200余種,是該族昆蟲多樣性最為豐富的國家。該族昆蟲是一類重要的刺吸性害蟲,有些種類還是重要的植物病毒傳播媒介,給農(nóng)林作物常造成嚴(yán)重的經(jīng)濟損失。該族自建立以來,分類研究發(fā)展迅速,但有關(guān)小綠葉蟬族昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育至今很少有人涉足;此外,該族的一些屬級單元地位存疑,屬間特征間斷不明,亟需借助包括分子手段在內(nèi)的其它方法進行深入探討。因此,本文選取小綠葉蟬族21屬64個代表種,對其基因片段16S rDNA,COI,ND1,18S rDNA,28S rDNA,H3進行了序列測定,對所得序列進行了堿基組成、遺傳距離、同質(zhì)性、堿基替代飽和度等分析;采用最大似然法(ML)和貝葉斯法(BI)分別構(gòu)建了單基因樹和聯(lián)合基因樹。研究結(jié)果如下:1.16S rDNA序列共524bp同源片段,其中保守位點占55%,G+C平均含量為23.2%。COI序列共789bp同源片段,其中保守位點占49%,G...
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 小綠葉蟬族研究概況
1.1.1 國外研究概況
1.1.2 國內(nèi)研究概況
1.2 分子系統(tǒng)發(fā)育研究進展
1.3 昆蟲分子系統(tǒng)發(fā)育研究概況
1.4 本論文研究內(nèi)容及意義
1.4.1 研究內(nèi)容
1.4.2 研究意義
第二章 材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究材料及保存方法
2.2 實驗儀器、設(shè)備和試劑
2.2.1 實驗儀器(見表2-3)
2.2.2 材料和試劑
2.3 研究方法
2.3.1 標(biāo)本鑒定
2.3.2 基因組DNA的提取
2.3.3 目的基因的擴增
2.3.4 擴增產(chǎn)物處理
2.3.5 序列組成分析
2.3.6 系統(tǒng)發(fā)育分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 擴增結(jié)果
3.2 序列組成分析結(jié)果
3.3 堿基替代飽和度檢驗
3.4 堿基的同質(zhì)性檢驗
3.5 系統(tǒng)發(fā)育信號的樹長分布偏斜性檢驗
3.6 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及分析
3.6.1 基于線粒體基因16SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.2 基于線粒體基因COI序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.3 基于細(xì)胞核基因18SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.4 基于細(xì)胞核基因28SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.5 基于組蛋白編碼基因H3序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.6 基于聯(lián)合基因28S rDNA+COI+H3 序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.7 基于聯(lián)合基因18S rDNA+28S rDNA+COI+H3 序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
第四章 結(jié)論與討論
4.1 結(jié)論
4.2 討論
4.2.1 關(guān)于遺傳距離
4.2.2 關(guān)于ML樹和BI樹的選擇
4.2.3 基因選擇對小綠葉蟬族系統(tǒng)發(fā)育分析的影響
4.2.4 小綠葉蟬族系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.2.5 展望
參考文獻
致謝
作者簡介
本文編號:3940801
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 小綠葉蟬族研究概況
1.1.1 國外研究概況
1.1.2 國內(nèi)研究概況
1.2 分子系統(tǒng)發(fā)育研究進展
1.3 昆蟲分子系統(tǒng)發(fā)育研究概況
1.4 本論文研究內(nèi)容及意義
1.4.1 研究內(nèi)容
1.4.2 研究意義
第二章 材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究材料及保存方法
2.2 實驗儀器、設(shè)備和試劑
2.2.1 實驗儀器(見表2-3)
2.2.2 材料和試劑
2.3 研究方法
2.3.1 標(biāo)本鑒定
2.3.2 基因組DNA的提取
2.3.3 目的基因的擴增
2.3.4 擴增產(chǎn)物處理
2.3.5 序列組成分析
2.3.6 系統(tǒng)發(fā)育分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 擴增結(jié)果
3.2 序列組成分析結(jié)果
3.3 堿基替代飽和度檢驗
3.4 堿基的同質(zhì)性檢驗
3.5 系統(tǒng)發(fā)育信號的樹長分布偏斜性檢驗
3.6 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及分析
3.6.1 基于線粒體基因16SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.2 基于線粒體基因COI序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.3 基于細(xì)胞核基因18SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.4 基于細(xì)胞核基因28SrDNA序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.5 基于組蛋白編碼基因H3序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.6 基于聯(lián)合基因28S rDNA+COI+H3 序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
3.6.7 基于聯(lián)合基因18S rDNA+28S rDNA+COI+H3 序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
第四章 結(jié)論與討論
4.1 結(jié)論
4.2 討論
4.2.1 關(guān)于遺傳距離
4.2.2 關(guān)于ML樹和BI樹的選擇
4.2.3 基因選擇對小綠葉蟬族系統(tǒng)發(fā)育分析的影響
4.2.4 小綠葉蟬族系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.2.5 展望
參考文獻
致謝
作者簡介
本文編號:3940801
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