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希金斯炭疽菌效應(yīng)分子的預(yù)測與篩選以及ChEP011的功能分析

發(fā)布時間:2024-03-19 01:59
  希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsianum)是一種重要的植物病原真菌,可為害多種十字花科植物,比如蘿卜屬(Raphanus)和蕓薹屬(Brassica)中的多種蔬菜作物,引起嚴(yán)重的炭疽病。華南地區(qū)高溫高濕的氣候條件非常有利于十字花科蔬菜如菜心炭疽病的發(fā)生,病害嚴(yán)重時產(chǎn)量損失可達30%40%。迄今為止,從細胞水平和分子水平上研究希金斯炭疽菌致病機理的報道甚少。本研究通過對希金斯炭疽菌候選效應(yīng)分子的預(yù)測、篩選和功能分析,旨在更好地了解效應(yīng)分子在該病菌致病過程中的作用,為病原菌與寄主植物互作分子機制的研究提供重要依據(jù),F(xiàn)將研究結(jié)果報道如下。根據(jù)最近公布的希金斯炭疽菌全基因組序列,利用生物信息學(xué)技術(shù)對其候選效應(yīng)分子進行了預(yù)測。通過SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor和TargetP等生物信息學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫預(yù)測獲得候選的希金斯炭疽菌外泌蛋白,然后根據(jù)蛋白中半胱氨酸的含量和序列大小進行進一步的篩選,最后通過非冗余蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫和blastp服務(wù)器作進一步分析,篩選獲得無同源性或同源性較低的蛋白序列,從而得到13...

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1希金斯炭疽菌的主要地域分布

圖1.1希金斯炭疽菌的主要地域分布

1圖1.1希金斯炭疽菌的主要地域分布注:主要分布于中國、美國、印度、日本以及東南亞等國家和地區(qū)


圖1.2菜心炭疽病及其病原菌希金斯炭疽菌(Colletotrichumhigginsianum)

圖1.2菜心炭疽病及其病原菌希金斯炭疽菌(Colletotrichumhigginsianum)

洋梨形;分生孢子圓筒形,大小為13~18×3.0~5.5mm,內(nèi)有1~2個油球(圖1.2)(侯明生,1998;李懷芳等,2001)。圖1.2菜心炭疽病及其病原菌希金斯炭疽菌(Colletotrichumhigginsianum)(引自何銀銀,2014)注:(a)癥狀....


圖1.3希金斯炭疽菌的致病過程模式圖(引自O(shè)’Conneletal.,2012)

圖1.3希金斯炭疽菌的致病過程模式圖(引自O(shè)’Conneletal.,2012)

3圖1.3希金斯炭疽菌的致病過程模式圖(引自O(shè)’Conneletal.,2012)注:A:附著胞(appressorium);C:分生孢子(conidium);Co:分生孢子梗(conidiophore);PH:初生菌絲(primaryhyphae);SH:次生....


圖1.4植物與病原菌互作的Z字模型(引自Jonesetal.,2006)

圖1.4植物與病原菌互作的Z字模型(引自Jonesetal.,2006)

圖1.4植物與病原菌互作的Z字模型(引自Jonesetal.,2006):PAMPs:病原相關(guān)分子模式(pathogen-associatedmolecularpatterns);PTI:病原相關(guān)分式觸發(fā)的免疫(PAMP-triggeredimmunity)....



本文編號:3932150

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