蕓薹根腫菌(Plasmodiophora brassicae Wor.)引起的十字花科植物根腫病在世界范圍內(nèi)發(fā)生和為害。近年來,根腫病已由長江上游擴(kuò)散至長江中下游油菜產(chǎn)區(qū),嚴(yán)重威脅我國油菜產(chǎn)業(yè)的安全,需要研制安全、高效和綠色的防控措施。本文研究了根腫菌寄主(擬南芥)應(yīng)答病原菌侵染早期反應(yīng)機(jī)制,研究了根腫菌、寄主與根部內(nèi)生微生物之間的交互作用。取得階段性研究進(jìn)展如下:采用RNA-Seq技術(shù)研究了擬南芥對根腫菌侵染早期應(yīng)答機(jī)制,建立了擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期(病原菌吸附根毛和侵染階段)的數(shù)字基因表達(dá)譜,分析了在接種24 hpi和48 hpi與接種前相比差異表達(dá)的基因,其中24 hpi時擬南芥有536個基因上調(diào)表達(dá),1367個基因下調(diào)表達(dá);48 hpi時有374個基因上調(diào)表達(dá),985個基因下調(diào)表達(dá)。通過Gene Ontology和Pathway富集分析對差異表達(dá)基因在不同功能模塊和通路中的分布進(jìn)行了分析,并通過MAPMAN將通路變化進(jìn)行了深入展示分析。結(jié)果顯示在根腫菌侵染早期(24 hpi和48 hpi),擬南芥中與類黃酮和木質(zhì)素合成通路顯著的增強(qiáng);芥子油甙、帖類物質(zhì)和原花青素等物質(zhì)代謝產(chǎn)物...

【文章頁數(shù)】：179 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖2.1臺盼藍(lán)染色方法觀察根腫菌侵染擬南芥早期過程

圖2.1臺盼藍(lán)染色方法觀察根腫菌侵染擬南芥早期過程Fig.2.1TheearlyprocessofP.brassicaeinfectingA.thalianabytrypanbluestainingtechnique注：紅色箭頭指示分別為不同階段的....

圖2.2擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期數(shù)字表達(dá)譜測序質(zhì)量評估

圖2.2擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期數(shù)字表達(dá)譜測序質(zhì)量評估.2.2SequencingqualityevaluationofA.thalianaexpressionprofileattheinfectionstagebyP.brassicae

圖2.3擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期數(shù)字表達(dá)譜測序飽和度Fig.2.3SequencingsaturationanalysisofA.thalianaexpressionprofileattheearlyinfectionstagebyP.brassicae

圖2.2擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期數(shù)字表達(dá)譜測序質(zhì)量評估.2.2SequencingqualityevaluationofA.thalianaexpressionprofileattheinfectionstagebyP.brassicae

圖2.4擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期表達(dá)譜中基因覆蓋度Fig.2.4TheresultsofgenecoveragestatisticsofA.thalianaexpressionprofileatthe

根腫菌、寄主及根部內(nèi)生微生物組交互作用研究擬南芥應(yīng)答根腫菌侵染早期數(shù)字表達(dá)譜測序覆蓋度測序結(jié)果比對擬南芥的基因后，將比對的覆蓋度進(jìn)行了統(tǒng)計。結(jié)果如樣品CK、樣品24h和樣品48h中基因的覆蓋度在不同程度上的覆蓋同時所有樣品中一半以上的基因都能夠達(dá)到50％以上的覆蓋....

本文編號：3930209