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水稻種質(zhì)資源關(guān)聯(lián)分析定位苗期稻瘟病抗性QTL

發(fā)布時(shí)間:2024-02-20 04:47
  水稻是世界上最重要的糧食作物之一,稻瘟病是水稻三個(gè)病害中最嚴(yán)重的一種病害,培育和推廣抗稻瘟病品種是防治稻瘟病最經(jīng)濟(jì)有效的方法。本研究利用2套來源廣泛的水稻核心種質(zhì)資源分別鑒定了對(duì)5個(gè)和3個(gè)稻瘟病菌株的抗性,篩選抗稻瘟病的種質(zhì)資源,結(jié)合全基因組高密度的基因型解析水稻苗期抗稻瘟病的遺傳基礎(chǔ),定位影響水稻抗稻瘟病的主效QTL和候選基因,挖掘重要主效QTL的有利等位基因,為分子育種改良水稻稻瘟病抗性提供種質(zhì)資源和基因資源。具體結(jié)果如下:(1)利用5個(gè)強(qiáng)致病力的稻瘟病菌株對(duì)一套由447個(gè)品種組成的秈粳核心種質(zhì)資源進(jìn)行抗性鑒定(實(shí)驗(yàn)一),發(fā)現(xiàn)種質(zhì)資源的稻瘟病抗性變異十分豐富,其中秈稻對(duì)HLJ13-856的抗性顯著高于粳稻,而粳稻對(duì)GD00-193的抗性顯著高于秈稻;核心種質(zhì)中篩選到8個(gè)秈稻和12個(gè)粳稻品種對(duì)全部5個(gè)菌株均表現(xiàn)為抗病;對(duì)GD00-193、GD17-CQ16和HB1708 3個(gè)菌株的抗性彼此間都存在顯著的正相關(guān)。(2)實(shí)驗(yàn)一中,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析共定位到68個(gè)影響抗5個(gè)稻瘟病菌株的主效QTL,其中有12個(gè)位點(diǎn)同時(shí)影響2個(gè)或2個(gè)以上菌株的抗性,2個(gè)QTL在兩個(gè)亞種中均定位到;從14個(gè)位...

【文章頁(yè)數(shù)】:103 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1秈粳兩個(gè)亞種的群體結(jié)構(gòu)與LDFig.2-1PopulationstructureandLDofxianandgenggermplasms注:A圖為秈稻的主成分分析圖和群體結(jié)構(gòu)圖;B圖為粳稻的主成分分析圖和群體結(jié)構(gòu)圖;C圖為秈稻(紅的)和粳稻(藍(lán)色)的LD

圖2-1秈粳兩個(gè)亞種的群體結(jié)構(gòu)與LDFig.2-1PopulationstructureandLDofxianandgenggermplasms注:A圖為秈稻的主成分分析圖和群體結(jié)構(gòu)圖;B圖為粳稻的主成分分析圖和群體結(jié)構(gòu)圖;C圖為秈稻(紅的)和粳稻(藍(lán)色)的LD

17秈稻分成了兩個(gè)亞群。為了去除群體結(jié)構(gòu),我們將其中一個(gè)亞群的17個(gè)品種(IRGC號(hào)分別為117280,117684,117826,117880,117881,121063,121089,121145,121156,121632,121639,121689,121722,1217....


圖2-2秈粳核心種質(zhì)對(duì)5個(gè)稻瘟病菌株的抗性的頻率分布

圖2-2秈粳核心種質(zhì)對(duì)5個(gè)稻瘟病菌株的抗性的頻率分布


圖2-4秈粳核心種質(zhì)對(duì)稻瘟病5個(gè)菌株抗性關(guān)聯(lián)分析的曼哈頓圖和QQ圖

圖2-4秈粳核心種質(zhì)對(duì)稻瘟病5個(gè)菌株抗性關(guān)聯(lián)分析的曼哈頓圖和QQ圖

29圖2-4秈粳核心種質(zhì)對(duì)稻瘟病5個(gè)菌株抗性關(guān)聯(lián)分析的曼哈頓圖和QQ圖Fig.2-4ManhattanandQQplotsofSNPsassociatedwithresistancetofiveblaststrainsA:秈稻種質(zhì)資源對(duì)GD00-193的抗性關(guān)聯(lián);B:粳稻種質(zhì)資源....


圖3.2重要QTL候選區(qū)間曼哈頓圖與候選基因的單倍型分析

圖3.2重要QTL候選區(qū)間曼哈頓圖與候選基因的單倍型分析

51圖3.2重要QTL候選區(qū)間曼哈頓圖與候選基因的單倍型分析Fig.3-2ManhattanplotofimportantQTLandhaplotypeanalysisofcandidategenesA:qGD001-4;B:qGD004-1;C:qGD004-4;D:qGD08....



本文編號(hào):3903865

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