【目的】草地貪夜蛾Spodoptera frugiperda是一種新近入侵我國(guó)的重要害蟲。本研究旨在對(duì)草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲兩個(gè)不同發(fā)育階段的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較分析。【方法】利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和數(shù)據(jù)組裝,并對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行功能注釋和比較分析。【結(jié)果】經(jīng)de novo組裝共獲得209 002條轉(zhuǎn)錄本,平均長(zhǎng)度為687.55 bp,N50為982 bp。共有46 198條(57.43%) unigene在至少一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得功能注釋,其中1 713條(2.13%) unigene在所有數(shù)據(jù)庫(kù)中均能獲得注釋。在GO數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得205 269條unigene的注釋,主要包括68個(gè)功能分類;在KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中共有3 408條unigene得到注釋,涉及277個(gè)代謝通路。共鑒定到424個(gè)嗅覺(jué)相關(guān)的基因,并且在雄性成蟲和5齡幼蟲之間的表達(dá)存在差異。通過(guò)比較轉(zhuǎn)錄組分析,在雄性成蟲中鑒定到9 162個(gè)上調(diào)和6 399個(gè)下調(diào)差異表達(dá)基因(DEGs);功能富集分析發(fā)現(xiàn)在上調(diào)DEGs中涉及信息素以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的代謝通路顯著富集,而下調(diào)DEGs中涉及解毒相關(guān)的通路顯著...

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【部分圖文】：

圖1草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene序列長(zhǎng)度分布

草地貪夜蛾轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝后的unigene序列與CDD,KOG,COG,NR,NT,PFAM,Swiss-Prot和TrEMBL等多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),共有46198條(57.43%)unigene在至少1個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得功能注釋,1713條(2.13%)unigene在....

圖2草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene在NR數(shù)據(jù)庫(kù)的同源物種分布

根據(jù)GO數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果,共有205269條草地貪夜蛾unigene被劃分為68個(gè)功能分類(圖4),生物學(xué)過(guò)程注釋到的unigene最多,共有91666個(gè),占44.66%,其中注釋較多的功能分別為細(xì)胞過(guò)程(14535個(gè),7.08%)、代謝過(guò)程(11439個(gè),5.57%)....

圖3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的KOG功能分類

表3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組中與解毒相關(guān)基因的統(tǒng)計(jì)Table3Statisticsofunigenesassociatedwithdetoxificationinthetranscriptomesofmaleadultandthe5th....

圖4草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的GO功能分類

圖3草地貪夜蛾雄性成蟲和5齡幼蟲轉(zhuǎn)錄組unigene的KOG功能分類根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)注釋結(jié)果,主要分為5大類功能,包括代謝(1815個(gè),29.25%)、有機(jī)系統(tǒng)(1496個(gè),24.11%)、遺傳信息處理(1118個(gè),18.01%)、細(xì)胞過(guò)程(917個(gè),14.78....

本文編號(hào)：3900975