【目的】近40年來,稻曲病在世界各主要水稻栽培區(qū)均表現(xiàn)出發(fā)生規(guī)模不斷擴(kuò)大、嚴(yán)重程度不斷增加的趨勢,并逐漸發(fā)展成為水稻主要病害之一。前期對低溫誘導(dǎo)初期的稻曲球進(jìn)行切片,發(fā)現(xiàn)稻曲球內(nèi)含有大量隱含菌核。本研究通過轉(zhuǎn)錄組高通量測序鑒定低溫誘導(dǎo)稻曲病菌(Villosiclava virens)菌核形成的潛在調(diào)控基因,闡釋菌核形成的分子機(jī)制,為揭示稻曲病發(fā)生規(guī)律及有效防治打下基礎(chǔ)。【方法】利用高通量測序技術(shù),對低溫誘導(dǎo)處理的稻曲球進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序(對照組:TL911₁、TL911₂、TL911₃;低溫處理組:FH1016₁、FH1016₂、FH1016₃)。以稻曲病菌基因組(UV-8b)作為參考基因組進(jìn)行序列比對,利用FPKM法計算基因表達(dá)量,設(shè)定參數(shù)(|log2 fold change|≥1且q-value≤0.05)篩選差異表達(dá)基因。結(jié)合基因差異表達(dá)分析、基因家族分析和富集分析(Gene Ontology/KEGG Pathway),鑒定稻曲病菌菌核形成關(guān)鍵基因,并...

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 試驗方法
        1.2.1 建庫測序
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
        1.2.3 差異表達(dá)基因的q RT-PCR驗證
2 結(jié)果
    2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
    2.2 GO富集分析
    2.3 KEGG代謝途徑分析
    2.4 差異表達(dá)的基因家族分析
    2.5 與低溫誘導(dǎo)菌核形成相關(guān)的差異表達(dá)基因
        2.5.1 氧化應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)基因分析
        2.5.2 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因分析
        2.5.3 跨膜運輸相關(guān)基因分析
        2.5.4 細(xì)胞形態(tài)相關(guān)基因分析
        2.5.5 生物合成基因相關(guān)分析
        2.5.6 生殖相關(guān)基因分析
    2.6 q RT-PCR驗證基因表達(dá)
3 討論
4 結(jié)論



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