由蛋白激酶和蛋白磷酸酶調(diào)控的蛋白質(zhì)可逆磷酸化是一種重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,它在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、基因轉(zhuǎn)錄、代謝調(diào)控等過(guò)程中起到至關(guān)重要的作用。本研究以蕓薹根腫菌e3菌株的基因組為試驗(yàn)數(shù)據(jù)來(lái)源,采用生物信息學(xué)方法對(duì)蕓薹根腫菌全基因組蛋白磷酸酶進(jìn)行了鑒定和表達(dá)分析�；陔[馬爾可夫模型(Hidden markov model,HMM)搜索與SMART分析相結(jié)合,本研究在蕓薹根腫菌基因組中共鑒定出54個(gè)蛋白磷酸酶基因。編碼的54個(gè)蛋白磷酸酶可以進(jìn)一步被分成4類(lèi),包括10個(gè)磷酸化蛋白磷酸酶(PPP),21個(gè)金屬離子依賴(lài)型蛋白磷酸酶(PPM),19個(gè)酪氨酸蛋白磷酸酶(PTP),4個(gè)基于天冬氨酸的蛋白磷酸酶(APP)。這54個(gè)蛋白磷酸酶的相對(duì)分子質(zhì)量為10 780～125 140,等電點(diǎn)為4.43～10.45。通過(guò)信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)在這54個(gè)蛋白磷酸酶中,PBRA₀07461存在信號(hào)肽,PBRA₀03636、PBRA₀04449、PBRA₀04464、PBRA₀05270、PBRA...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 蕓薹根腫菌基因組序列
    1.2 生物信息學(xué)分析
    1.3 表達(dá)量分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 蕓薹根腫菌蛋白磷酸酶的鑒定
    2.2 蕓薹根腫菌蛋白磷酸酶理化特性分析
    2.3 蕓薹根腫菌蛋白磷酸酶信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)分析
    2.4 蕓薹根腫菌蛋白磷酸酶基因在不同階段表達(dá)動(dòng)態(tài)變化
3 討 論



本文編號(hào)：3853631