香蕉(Musa spp.)是一種重要的水果和糧食作物。目前全球香蕉產(chǎn)業(yè)正面臨著由古巴尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc)引起的枯萎病的嚴重威脅。研究香蕉的抗病機理可為香蕉枯萎病的防治及抗病育種提供理論依據(jù)。數(shù)字基因表達譜(Digital gene expression,DGE)分析技術(shù)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于包括香蕉在內(nèi)的植物抗病機理的研究。然而,與香蕉枯萎病抗性相關(guān)的基因本體論數(shù)據(jù)庫(Gene ontology,GO)條目和東京基因與基因組百科全書(Kyto encyclopedia of genes and geneomes,KEGG)途徑的信息非常有限。本研究采用DGE分析了高抗香蕉枯萎病4號生理小種(Foc 4)的‘粵優(yōu)抗1號’(Musa spp.AAA)和高感的‘巴西蕉’(Musa spp.AAA)的組培苗在接種病原菌前、后基因的差異表達,并采用維恩圖篩選出與抗/感病性密切相關(guān)的基因、GO和KEGG條目。隨著育種業(yè)的快速發(fā)展,植物新品種保護變得日益重要。而植物特異性、一致性、穩(wěn)定性(Distinctness,Uniformity,Sta...

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
1 前言
    1.1 香蕉枯萎病
    1.2 香蕉抗枯萎病研究機理的進展
    1.3 香蕉枯萎病的防治
    1.4 數(shù)字基因表達譜技術(shù)在植物抗病機理研究中的應(yīng)用
    1.5 植物DUS測試
    1.6 本研究的研究目的與意義
2 材料與方法
    2.1 供試材料
    2.2 實驗方法
        2.2.1 病原菌培養(yǎng)
        2.2.2 DGE測序
            2.2.2.1 植物材料培養(yǎng)及樣品處理
            2.2.2.2 DGE測序方法
            2.2.2.3 差異表達基因的GO和KEGG富集分析
        2.2.3 熒光定量PCR
            2.2.3.1 總RNA提取及c DNA合成
            2.2.3.2 引物設(shè)計
            2.2.3.3 PCR擴增反應(yīng)
        2.2.4 植物學(xué)性狀指標的調(diào)查方法
        2.2.5 香蕉對枯萎病抗性的苗期鑒定
    2.3 主要試劑
    2.4 主要設(shè)備及實驗用品
3 結(jié)果與分析
    3.1 DGE測序
        3.1.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
        3.1.2 Reads在參考基因組不同區(qū)域的分布情況
        3.1.3 差異表達基因分析
            3.1.3.1 不同表達水平區(qū)間的基因數(shù)量統(tǒng)計
            3.1.3.2 各比較組差異表達基因統(tǒng)計
            3.1.3.3 GO富集分析
            3.1.3.4 KEGG富集分析
            3.1.3.5 qRT-PCR驗證
    3.2 香蕉新品系DUS測試結(jié)果
        3.2.1 植株、葉片、苞片
        3.2.2 果指性狀
        3.2.3 果穗性狀
    3.3 部分新品系的苗期抗病性鑒定
4 討論與結(jié)論
    4.1 討論
        4.1.1 DGE分析
            4.1.1.1 差異表達基因
            4.1.1.2 GO分析
            4.1.1.3 KEGG分析
        4.1.2 DUS測試
        4.1.3 香蕉苗期抗病性鑒定
    4.2 結(jié)論
致謝
參考文獻



本文編號：3839817