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禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-05-13 13:32
  本研究利用生物信息學(xué)方法對(duì)真菌轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫收錄的17條禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子序列進(jìn)行了分析;蛐蛄泻偷鞍桌砘再|(zhì)分析發(fā)現(xiàn),禾谷鐮刀菌17個(gè)MYB轉(zhuǎn)錄因子在核酸長度、蛋白大小、理論等電點(diǎn)、原子總數(shù)以及不穩(wěn)定系數(shù)方面均存在差異;基序分析和蛋白二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),這些轉(zhuǎn)錄因子包含2條特征基序,蛋白空間結(jié)構(gòu)多樣且均包含MYB轉(zhuǎn)錄因子特征結(jié)構(gòu)(螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(HTH));系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,17個(gè)禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子與12個(gè)已報(bào)道的其他物種MYB轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化出兩個(gè)大的分支,其中Fg MYB03、Fg MYB04、Fg MYB05、Fg MYB06、Fg MYB10、Fg MYB12和Fg MYB13與已知功能的動(dòng)物、植物和真菌MYB轉(zhuǎn)錄因子c-MYB、ATMYB2、MoMyb1、FlbD和Pol5等具有較近的親緣關(guān)系,推測(cè)它們具有類似的生物學(xué)功能。本研究結(jié)果為進(jìn)一步研究禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能以及其他真菌MYB轉(zhuǎn)錄因子的家族特征提供了依據(jù)。

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子鑒定和蛋白理化性質(zhì)分析
    1.2 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子基序和蛋白結(jié)構(gòu)分析
    1.3 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)化分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子篩選及序列獲得
    3.2 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子理化性質(zhì)分析
    3.3 禾谷鐮刀菌MYB轉(zhuǎn)錄因子的基序和蛋白結(jié)構(gòu)分析
    3.4 MYB轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化分析
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào):3815917

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