由Xanthomonas oryzae pv.Oryzae(Xoo)引起的白葉枯病是水稻生產(chǎn)中普遍發(fā)生、危害嚴(yán)重的一種細(xì)菌病害。本研究采用我國(guó)和菲律賓的4個(gè)Xoo代表菌株,人工接種評(píng)價(jià)了來(lái)源于32個(gè)國(guó)家和中國(guó)25個(gè)省份的701份基因組重測(cè)序水稻種質(zhì)資源的白葉枯病抗性,結(jié)合調(diào)查病斑長(zhǎng)度的表型數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)材料的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行水稻白葉枯病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-Wide Associated Study,GWAS),此外,通過(guò)構(gòu)建遺傳分離群體,初步驗(yàn)證了一些抗病相關(guān)位點(diǎn)。主要研究結(jié)果如下:1.抗病材料的篩選:分別采用Xoo代表菌株Zhe173(C3)、GD1358(C5)、PXO61(P1)和PXO339(P9a)對(duì)701份水稻種質(zhì)資源進(jìn)行人工接種,發(fā)現(xiàn)有29份水稻種質(zhì)資源對(duì)4個(gè)Xoo菌株具有較高抗性水平,篩選到對(duì)廣東強(qiáng)毒力菌株C5表現(xiàn)抗性的品種小紅谷和豪格勞。2.將白葉枯病斑長(zhǎng)度的表型數(shù)據(jù)與水稻種質(zhì)資源的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,檢測(cè)到包含219個(gè)基因座的5432個(gè)顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。其中,已精細(xì)定位的4個(gè)抗性基因(Xa32,Xa35,Xa36和Xa40)和一個(gè)已克隆Xa4...

【文章頁(yè)數(shù)】：73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 水稻抗白葉枯病基因研究進(jìn)展
        1.1.1 水稻白葉枯病概述
        1.1.2 水稻抗白葉枯病基因的定位
        1.1.3 水稻抗白葉枯病基因的克隆
        1.1.4 水稻與白葉枯病原菌的互作
    1.2 水稻種質(zhì)資源及抗病分子育種
        1.2.1 水稻種質(zhì)資源
        1.2.2 分子標(biāo)記輔助選擇抗病育種
        1.2.3 抗白葉枯病轉(zhuǎn)基因育種
    1.3 水稻白葉枯抗病基因的分子標(biāo)記
        1.3.1 抗病基因分子標(biāo)記定位的方法
    1.4 本研究目的及意義
第二章 水稻抗白葉枯病種質(zhì)資源的篩選
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 供試菌株
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 水稻種質(zhì)資源病斑比例相關(guān)性分析
        2.2.2 白葉枯病抗性鑒定結(jié)果
        2.2.3 具有小種專(zhuān)化抗性和廣譜抗性的水稻品種
        2.2.4 不同地區(qū)水稻品種白葉枯病發(fā)病率分析
    2.3 小結(jié)與討論
第三章 水稻種質(zhì)資源白葉枯病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 GWAS的技術(shù)路線(xiàn)
        3.1.3 群體結(jié)構(gòu)分析和主成分分析
        3.1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析
        3.1.5 關(guān)聯(lián)候選基因分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 701 份種質(zhì)資源群體分化和主成分分析
        3.2.2 與水稻白葉枯病抗性相關(guān)聯(lián)的SNPs
        3.2.3 水稻白葉枯病抗性顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的分析
        3.2.4 C3和C5菌株抗性相關(guān)基因座的分析
        3.2.5 P1和P9a菌株抗性相關(guān)基因座的分析
        3.2.6 重要SNPs在不同亞群的分布及其等位基因頻率
    3.3 討論
        3.3.1 水稻秈粳亞種間白葉枯病抗性的分化
        3.3.2 抗病育種對(duì)抗性位點(diǎn)的影響
        3.3.3 GWAS顯著關(guān)聯(lián)的區(qū)間
    3.4 結(jié)論
第四章 抗病種質(zhì)資源的遺傳分析與初步定位
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 F2分離群體對(duì)P9a菌株的抗性反應(yīng)及遺傳分析
        4.2.2 分子標(biāo)記定位
        4.2.3 P9a菌株顯著抗性位點(diǎn)
    4.3 小結(jié)
第五章 基于GWAS的水稻抗白葉枯病相關(guān)聯(lián)的CAPS標(biāo)記開(kāi)發(fā)
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 抗C5菌及IV菌相關(guān)SNP位點(diǎn)特異性酶切位點(diǎn)分析
        5.2.2 抗C5菌及IV菌相關(guān)SNP位點(diǎn)的酶切反應(yīng)與電泳
        5.2.3 酶切產(chǎn)物的測(cè)序驗(yàn)證與CAPS標(biāo)記建立
    5.3 討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)歷



本文編號(hào)：3805350