抗大豆孢囊線蟲4號生理小種的PI437654突變體的篩選與全基因組測序
發(fā)布時間:2023-04-17 04:25
大豆孢囊線蟲(Heterodera glycines Ichinohe)是一種嚴(yán)重危害大豆生產(chǎn)的植物病原線蟲,在全世界范圍內(nèi)每年給大豆生產(chǎn)造成重大損失。在我國發(fā)生與危害大豆的大豆孢囊線蟲生理小種主要是1、3及4號生理小種,其中1號和3號生理小種主要分布、發(fā)生在東北大豆產(chǎn)區(qū),而4號生理小種主要在黃淮海大豆產(chǎn)區(qū)發(fā)生與危害大豆。目前,以大豆孢囊線蟲3號生理小種侵染大豆鑒定了2個主要的大豆抗孢囊線蟲基因rhg1和Rhg4,但大豆抗大豆孢囊線蟲4號生理小種基因的研究還未有任何進(jìn)展。本研究主要以對大豆孢囊線蟲表現(xiàn)廣譜抗性的PI437654為材料,通過EMS(Ethylmethane Sulfonate,甲基磺酸乙酯)化學(xué)誘變開發(fā)PI437654大豆突變?nèi)后w,通過表型鑒定在PI437654突變?nèi)后w中獲得對大豆孢囊線蟲4號生理小種侵染表型發(fā)生變化的突變體,然后對突變體進(jìn)行已知抗性基因序列分析,最后,對突變體進(jìn)行全基因組重測序和序列初步分析以期后續(xù)研究最終鑒定出大豆抗大豆孢囊線蟲4號生理小種基因。不同EMS處理濃度表明,PI437654的最佳EMS處理濃度為0.75%。與野生型相比,突變體后代表現(xiàn)出很多...
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 大豆孢囊線蟲
1.1.1 大豆孢囊線蟲的分類學(xué)地位
1.1.2 大豆孢囊線蟲的發(fā)生及分布
1.1.3 大豆孢囊線蟲生活史
1.1.4 大豆孢囊線蟲的傳播和危害
1.2 大豆抗大豆孢囊線蟲基因研究進(jìn)展
1.2.1 已鑒定的大豆抗孢囊線蟲基因
1.2.2 大豆抗孢囊線蟲基因作用的分子機(jī)制
1.2.3 其它大豆抗大豆孢囊線蟲QTL
1.3 EMS誘變與測序技術(shù)在作物研究中的應(yīng)用
1.3.1 EMS誘變突變?nèi)后w在作物育種及性狀基因鑒定中的應(yīng)用
1.3.2 下一代測序技術(shù)在作物育種及性狀基因鑒定中的應(yīng)用
1.4 本研究的目的和意義
第二章 化學(xué)誘變大豆突變?nèi)后w的開發(fā)與田間表型觀察
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 EMS處理大豆種子方法
2.1.4 突變體種植及突變?nèi)后w的開發(fā)
2.1.5 突變體形態(tài)表型調(diào)查
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 EMS處理大豆的最佳濃度
2.2.2 PI437654突變?nèi)后w的開發(fā)
2.2.3 主要突變體形態(tài)表型
2.3 小結(jié)與討論
第三章 大豆孢囊線蟲4號生理小種對PI437654突變體侵染表型的鑒定
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 大豆溫室種植
3.1.3 大豆孢囊線蟲卵的收集與接種
3.1.4 大豆根組織內(nèi)線蟲染色觀察
3.1.5 大豆孢囊線蟲侵染表型調(diào)查
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 大豆孢囊線蟲4號生理小種對大豆根的侵染
3.2.2 大豆孢囊線蟲4號生理小種侵染表型變化的PI437654突變體初步篩選
3.2.3 PI437654突變體的表型驗(yàn)證
3.2.4 PI437654突變體對大豆孢囊線蟲3號生理小種的抗性
3.3 小結(jié)與討論
第四章 PI437654突變體中已知大豆孢囊線蟲抗性基因序列分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 突變體基因組DNA的提取
4.1.4 突變體的已知大豆孢囊線蟲抗性基因分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 突變體已知抗性基因的酶切分析
4.2.2 突變體的已知抗性基因序列分析
4.3 小結(jié)與討論
第五章 突變體全基因組重測序及數(shù)據(jù)初步分析
5.1 材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.2 實(shí)驗(yàn)流程
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 SNPs初步分析
5.2.2 InDels初步分析
5.3 小結(jié)與討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 1
致謝
作者簡歷
本文編號:3792564
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 大豆孢囊線蟲
1.1.1 大豆孢囊線蟲的分類學(xué)地位
1.1.2 大豆孢囊線蟲的發(fā)生及分布
1.1.3 大豆孢囊線蟲生活史
1.1.4 大豆孢囊線蟲的傳播和危害
1.2 大豆抗大豆孢囊線蟲基因研究進(jìn)展
1.2.1 已鑒定的大豆抗孢囊線蟲基因
1.2.2 大豆抗孢囊線蟲基因作用的分子機(jī)制
1.2.3 其它大豆抗大豆孢囊線蟲QTL
1.3 EMS誘變與測序技術(shù)在作物研究中的應(yīng)用
1.3.1 EMS誘變突變?nèi)后w在作物育種及性狀基因鑒定中的應(yīng)用
1.3.2 下一代測序技術(shù)在作物育種及性狀基因鑒定中的應(yīng)用
1.4 本研究的目的和意義
第二章 化學(xué)誘變大豆突變?nèi)后w的開發(fā)與田間表型觀察
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 EMS處理大豆種子方法
2.1.4 突變體種植及突變?nèi)后w的開發(fā)
2.1.5 突變體形態(tài)表型調(diào)查
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 EMS處理大豆的最佳濃度
2.2.2 PI437654突變?nèi)后w的開發(fā)
2.2.3 主要突變體形態(tài)表型
2.3 小結(jié)與討論
第三章 大豆孢囊線蟲4號生理小種對PI437654突變體侵染表型的鑒定
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.2 大豆溫室種植
3.1.3 大豆孢囊線蟲卵的收集與接種
3.1.4 大豆根組織內(nèi)線蟲染色觀察
3.1.5 大豆孢囊線蟲侵染表型調(diào)查
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 大豆孢囊線蟲4號生理小種對大豆根的侵染
3.2.2 大豆孢囊線蟲4號生理小種侵染表型變化的PI437654突變體初步篩選
3.2.3 PI437654突變體的表型驗(yàn)證
3.2.4 PI437654突變體對大豆孢囊線蟲3號生理小種的抗性
3.3 小結(jié)與討論
第四章 PI437654突變體中已知大豆孢囊線蟲抗性基因序列分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 突變體基因組DNA的提取
4.1.4 突變體的已知大豆孢囊線蟲抗性基因分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 突變體已知抗性基因的酶切分析
4.2.2 突變體的已知抗性基因序列分析
4.3 小結(jié)與討論
第五章 突變體全基因組重測序及數(shù)據(jù)初步分析
5.1 材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.1.2 實(shí)驗(yàn)流程
5.2 結(jié)果與分析
5.2.1 SNPs初步分析
5.2.2 InDels初步分析
5.3 小結(jié)與討論
第六章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 1
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本文編號:3792564
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