寡孢節(jié)叢孢StuA基因突變株的表型及轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2023-04-08 05:19
食線蟲真菌是一類土壤微生物,作為線蟲的天敵,它們對于維持線蟲在土壤.生態(tài)外境中的種群動態(tài)平衡發(fā)揮著十分重要的作用。寡孢節(jié)叢孢(Arthrobotrys oilgospora)是研究捕食線蟲真菌與線蟲相互作用的模式菌株,它能產(chǎn)生三維菌網(wǎng)捕捉線蟲。2011年,本課題組報道了寡孢節(jié)叢孢的基因組序列,為進(jìn)一步研究捕食器官形成的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。本論文以△AAoStA突變株為研究對象,比較了寡孢節(jié)叢孢原始菌株和△AoStuA突變株表型特征的差異。同時,通過轉(zhuǎn)錄組測序比較△AoStuA突變株和原始菌株經(jīng)線蟲提取液誘導(dǎo)不同時間點的基因表達(dá)水平變化,對顯著差異表達(dá)基因進(jìn)行了 GO基因功能富集分析和KEGG pathway分析。主要實驗結(jié)果如下:1、寡孢節(jié)叢孢野生株和AoStuA基因突變株的表型特征比較△AoStuA突變株在PDA等培養(yǎng)基上的生長速率顯著低于原始菌株,產(chǎn)孢率顯著降低,且大部分孢子形態(tài)畸形,呈現(xiàn)不完全發(fā)育,孢子的萌發(fā)率也低于原始菌株,萌發(fā)后的菌絲分化程度明顯弱于原始菌株,并且不能產(chǎn)生三維菌網(wǎng),捕殺線蟲的能力喪失,對NaCl、H202和SDS的抗性減弱,胞外蛋白酶水解活性下降。2、寡孢節(jié)叢...
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 食線蟲真菌的研究進(jìn)展
2 APSES蛋白家族的研究進(jìn)展
3 熒光定量PCR的應(yīng)用
4 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究進(jìn)展
5 本論文的選題依據(jù)及研究意義
第二章 寡孢節(jié)叢孢野生菌株與△AoStuA突變株的表型比較
1 前言
2 實驗材料和儀器
2.1 實驗菌株
2.2 主要培養(yǎng)基
2.3 主要生化試劑
2.4 實驗儀器
3 實驗方法
3.1 生長速率測定和形態(tài)觀察
3.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
3.3 殺線蟲能力比較
3.4 逆境生長情況比較
3.5 胞外蛋白酶實驗
4 實驗結(jié)果
4.1 生長速率測定和形態(tài)觀察
4.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
4.3 殺線蟲能力比較
4.4 逆境生長情況比較
4.5 胞外蛋白酶活性比較
5 討論
5.1 生長速率的比較
5.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
5.3 逆境生長情況比較
5.4 胞外蛋白酶水解活性比較
第三章 寡孢節(jié)叢孢和△AoStuA突變株RT-PCR及轉(zhuǎn)錄組分析
1 前言
2 實驗材料、試劑、儀器
2.1 實驗菌株
2.2 主要培養(yǎng)基
2.3 主要試劑
2.4 主要儀器設(shè)備
3 實驗方法
3.1 誘導(dǎo)實驗和轉(zhuǎn)錄時間點的確定
3.2 高通量測序樣品的制備
3.3 熒光定量RCR
3.4 RNA-Seq
4 實驗結(jié)果
4.1 轉(zhuǎn)錄時間點的確定
4.2 RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
4.3 熒光定量結(jié)果
4.4 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析
4.5 討論
全文小結(jié)及展望
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 熒光定量引物序列
附錄2 RT-PCR結(jié)果
附錄3 部分未經(jīng)注釋基因的RPKM值列表
附錄4 常用的數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)上生物學(xué)資源
附錄5 碩士期間發(fā)表和待發(fā)表的論文
附錄6 碩士期間所獲榮譽
致謝
本文編號:3786087
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 食線蟲真菌的研究進(jìn)展
2 APSES蛋白家族的研究進(jìn)展
3 熒光定量PCR的應(yīng)用
4 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究進(jìn)展
5 本論文的選題依據(jù)及研究意義
第二章 寡孢節(jié)叢孢野生菌株與△AoStuA突變株的表型比較
1 前言
2 實驗材料和儀器
2.1 實驗菌株
2.2 主要培養(yǎng)基
2.3 主要生化試劑
2.4 實驗儀器
3 實驗方法
3.1 生長速率測定和形態(tài)觀察
3.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
3.3 殺線蟲能力比較
3.4 逆境生長情況比較
3.5 胞外蛋白酶實驗
4 實驗結(jié)果
4.1 生長速率測定和形態(tài)觀察
4.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
4.3 殺線蟲能力比較
4.4 逆境生長情況比較
4.5 胞外蛋白酶活性比較
5 討論
5.1 生長速率的比較
5.2 產(chǎn)孢能力及孢子形態(tài)比較
5.3 逆境生長情況比較
5.4 胞外蛋白酶水解活性比較
第三章 寡孢節(jié)叢孢和△AoStuA突變株RT-PCR及轉(zhuǎn)錄組分析
1 前言
2 實驗材料、試劑、儀器
2.1 實驗菌株
2.2 主要培養(yǎng)基
2.3 主要試劑
2.4 主要儀器設(shè)備
3 實驗方法
3.1 誘導(dǎo)實驗和轉(zhuǎn)錄時間點的確定
3.2 高通量測序樣品的制備
3.3 熒光定量RCR
3.4 RNA-Seq
4 實驗結(jié)果
4.1 轉(zhuǎn)錄時間點的確定
4.2 RNA質(zhì)量檢測結(jié)果
4.3 熒光定量結(jié)果
4.4 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析
4.5 討論
全文小結(jié)及展望
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 熒光定量引物序列
附錄2 RT-PCR結(jié)果
附錄3 部分未經(jīng)注釋基因的RPKM值列表
附錄4 常用的數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)上生物學(xué)資源
附錄5 碩士期間發(fā)表和待發(fā)表的論文
附錄6 碩士期間所獲榮譽
致謝
本文編號:3786087
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