肝臟質(zhì)量指數(shù)和骨骼肌DNA拷貝數(shù)對鑒別野生和飼養(yǎng)王錦蛇的有效性評價
發(fā)布時間:2023-02-14 14:22
野外非法捕捉的蛇類經(jīng);烊肴斯わ曫B(yǎng)個體中,在合法市場上洗白、出售,不僅干擾合法產(chǎn)業(yè)的正常秩序,而且還嚴重破壞野外資源。因此,繼續(xù)建立有效鑒別野生和人工飼養(yǎng)蛇類的方法。本研究以養(yǎng)殖量和盜捕量較大的王錦蛇(Elaphe cariata)為例,建立了肝-頭指數(shù)(Ilh)和肝-體指數(shù)(Ilb)兩個肝臟指數(shù)來鑒別野生和人工飼養(yǎng)蛇類。利用這兩個指標,采用Fisher’s判別將已知來源的個體進行來源回判時,兩個指標的正確判別率在野生組均為96.9%,飼養(yǎng)組均為74.1%,整體正確率為86.4%。但是兩指標在野生組和飼養(yǎng)組都有顯著的性別差異,而且飼養(yǎng)組的雄性與野生組的雌性數(shù)值比較接近,當這兩組同時進行判別時,Ilh和Ilb對飼養(yǎng)組雄性的錯判風險均高達36.4%。但在性別明確時,4對野生和飼養(yǎng)的雄性判別正確率在野生組為100%,飼養(yǎng)組為90.4%,整體達到94.1%;對于兩組雌性判別正確率野生組依然達到100%,飼養(yǎng)組為81.3%,整體92.9%。如的情形與4一致,同一性別的整體正確判別率高達90.5%(雌性)和94.1%(雄性)。這兩個指標測量方便,適用死體或者不完整的死體鑒別,也可能適用于其他蛇類。...
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 蛇類資源的利用價值及消費需求
1.2 過度的開發(fā)利用蛇類資源造成的影響
1.3 蛇類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展以及存在的問題
1.4 目前鑒別蛇類來源方法以及局限性
1.4.1 野蛇對飼養(yǎng)條件適應(yīng)性差引起的綜合癥狀
1.4.2 人工飼養(yǎng)蛇類體表的理化標記或印記
1.4.3 微芯片標記(PIT)
1.4.4 人工選育產(chǎn)生的特殊斑紋
1.4.5 胃腸道寄生蟲的差異
1.4.6 DNA遺傳標記法
1.4.7 穩(wěn)定同位素
1.5 新方法的研究思路
1.5.1 基于野生和人工飼養(yǎng)條件下肝脂肪含量差異的鑒別思路
1.5.2 基于骨骼肌拷貝數(shù)差異鑒別思路
2 基于肝臟質(zhì)量指數(shù)鑒別人工飼養(yǎng)和野生王錦蛇的研究
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗材料與測量
2.2.2 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 各項量度的描述性統(tǒng)計
2.3.2 各項量度間的關(guān)系
2.3.3 Ilh和Ilb的組間差異和性別差異
2.3.4 Ilh和Ilb對來源的判別力
2.4 討論
2.4.1 野生組和人工飼養(yǎng)組肝臟質(zhì)量的差異
2.4.2 Ilh和Ilb在野生組和飼養(yǎng)組鑒別力分析及應(yīng)用
3 基于骨骼肌基因組拷貝數(shù)的差異鑒別王錦蛇來源的研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 實驗材料的采集
3.2.2 實驗儀器設(shè)備與試劑
3.2.3 總基因組DNA提取
3.2.4 引物設(shè)計及合成
3.2.5 實時熒光定量PCR標準品的制備
3.2.6 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 DNA提取結(jié)果
3.3.2 ND2和c-mos標準品擴增片段鑒定
3.3.3 重組標準品質(zhì)粒的鑒定
3.3.4 ND2基因和c-mos基因qPCR引物擴增結(jié)果
3.3.5 熒光定量PCR數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
3.3.6 nuDNA和mtDNA拷貝數(shù)在野生和人工飼養(yǎng)組的差異分析
3.4 討論
3.4.1 實時熒光定量PCR絕對定量方法可靠性
3.4.2 腐敗度的影響
3.4.3 Pmt、RLD指標對人工飼養(yǎng)王錦蛇的鑒別力分析
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學位期間發(fā)表的學術(shù)論文
致謝
本文編號:3742533
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
1.1 蛇類資源的利用價值及消費需求
1.2 過度的開發(fā)利用蛇類資源造成的影響
1.3 蛇類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展以及存在的問題
1.4 目前鑒別蛇類來源方法以及局限性
1.4.1 野蛇對飼養(yǎng)條件適應(yīng)性差引起的綜合癥狀
1.4.2 人工飼養(yǎng)蛇類體表的理化標記或印記
1.4.3 微芯片標記(PIT)
1.4.4 人工選育產(chǎn)生的特殊斑紋
1.4.5 胃腸道寄生蟲的差異
1.4.6 DNA遺傳標記法
1.4.7 穩(wěn)定同位素
1.5 新方法的研究思路
1.5.1 基于野生和人工飼養(yǎng)條件下肝脂肪含量差異的鑒別思路
1.5.2 基于骨骼肌拷貝數(shù)差異鑒別思路
2 基于肝臟質(zhì)量指數(shù)鑒別人工飼養(yǎng)和野生王錦蛇的研究
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗材料與測量
2.2.2 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 各項量度的描述性統(tǒng)計
2.3.2 各項量度間的關(guān)系
2.3.3 Ilh和Ilb的組間差異和性別差異
2.3.4 Ilh和Ilb對來源的判別力
2.4 討論
2.4.1 野生組和人工飼養(yǎng)組肝臟質(zhì)量的差異
2.4.2 Ilh和Ilb在野生組和飼養(yǎng)組鑒別力分析及應(yīng)用
3 基于骨骼肌基因組拷貝數(shù)的差異鑒別王錦蛇來源的研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 實驗材料的采集
3.2.2 實驗儀器設(shè)備與試劑
3.2.3 總基因組DNA提取
3.2.4 引物設(shè)計及合成
3.2.5 實時熒光定量PCR標準品的制備
3.2.6 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 DNA提取結(jié)果
3.3.2 ND2和c-mos標準品擴增片段鑒定
3.3.3 重組標準品質(zhì)粒的鑒定
3.3.4 ND2基因和c-mos基因qPCR引物擴增結(jié)果
3.3.5 熒光定量PCR數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
3.3.6 nuDNA和mtDNA拷貝數(shù)在野生和人工飼養(yǎng)組的差異分析
3.4 討論
3.4.1 實時熒光定量PCR絕對定量方法可靠性
3.4.2 腐敗度的影響
3.4.3 Pmt、RLD指標對人工飼養(yǎng)王錦蛇的鑒別力分析
結(jié)論
參考文獻
附錄
攻讀學位期間發(fā)表的學術(shù)論文
致謝
本文編號:3742533
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