杧果是著名熱帶水果,被稱為“熱帶果王”,近年來隨著杧果種植產(chǎn)業(yè)的持續(xù)擴(kuò)增,使得杧果產(chǎn)區(qū)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)得到快速發(fā)展,同時(shí)杧果病蟲害的種類隨著種植面積的擴(kuò)大也越來越多。近兩年本課題組在廣東、四川等杧果產(chǎn)區(qū)病蟲害普查時(shí)發(fā)現(xiàn)了一種危害逐漸加重的細(xì)菌性病害。杧果的葉片和枝條在染病初期呈現(xiàn)不規(guī)則的黑褐色斑圈,中期病斑向四周蔓延,前期出現(xiàn)的癥狀與細(xì)菌性角斑病相似,但后期染病的葉片和枝條干枯壞死,與細(xì)菌性角斑病后期出現(xiàn)的病害癥狀完全不同,固本課題稱之為杧果細(xì)菌性干枯病。為明確該病原菌的種類,采用稀釋涂布分離法,對具有明顯癥狀的杧果病害樣品進(jìn)行稀釋分離、純化,Koch法則檢測分離物接種杧果枝葉的致病性,并通過觀察分離物的形態(tài)學(xué)特征、生物學(xué)活性測定和分子生物學(xué)分析確定其分類學(xué)地位。經(jīng)全基因組測序技術(shù),預(yù)測病原菌的致病基因、耐藥基因、致病毒力和碳水化合物等相關(guān)基因,以期為明確病原菌對寄主產(chǎn)生的致病機(jī)理和病害防治途徑提供理論依據(jù)。主要研究內(nèi)容如下:1.杧果細(xì)菌性干枯病病原菌分離及鑒定以典型的干枯病病樣為試驗(yàn)材料,采用稀釋涂布法獲得NY01菌株。經(jīng)過刺傷接種將NY01菌株回接到杧果的葉片和枝條上,4天后在杧果的葉片和... 

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 杧果病害的種類
    1.2 植物病原細(xì)菌分類學(xué)研究概況
    1.3 細(xì)菌基因組學(xué)研究進(jìn)展
        1.3.1 第一代測序技術(shù)
        1.3.2 第二代測序技術(shù)
        1.3.3 第三代測序技術(shù)
    1.4 本研究目的與意義
2 材料與方法
    2.1 供試材料
    2.2 供試培養(yǎng)基
    2.3 儀器
    2.4 試劑
    2.5 病原菌的分離
    2.6 病原菌的致病性測定
    2.7 病原菌形態(tài)學(xué)鑒定
    2.8 病原菌分子生物學(xué)鑒定
    2.9 病原菌的生物學(xué)活性測定
        2.9.1 不同碳源對病原菌生長的影響
        2.9.2 不同氮源對病原菌生長的影響
        2.9.3 不同pH對病原菌生長的影響
        2.9.4 不同溫度對病原菌生長的影響
        2.9.5 不同鹽度對病原菌生長的影響
        2.9.6 病原菌的葡萄糖氧化發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
        2.9.7 病原菌的糖、醇類發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
    2.10 NY01 菌株的全基因組測序與分析
        2.10.1 菌株培養(yǎng)收集
        2.10.2 DNA質(zhì)量檢測、文庫構(gòu)建和全基因組PacBio RS II測序
        2.10.3 測序數(shù)據(jù)過濾統(tǒng)計(jì)
        2.10.4 基因組組裝和預(yù)測
        2.10.5 公共數(shù)據(jù)庫注釋
        2.10.6 專有數(shù)據(jù)庫分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 杧果細(xì)菌性干枯病及其病原菌的分離、鑒定
        3.1.1 杧果細(xì)菌性干枯病癥狀
        3.1.2 病原菌分離
        3.1.3 致病性測定
        3.1.4 病原菌形態(tài)學(xué)鑒定
        3.1.5 病原菌分子生物學(xué)鑒定
    3.2 病原菌的生物學(xué)特性測定
        3.2.1 不同碳源對病原菌生長的影響
        3.2.2 不同氮源對病原菌生長的影響
        3.2.3 不同pH對病原菌生長的影響
        3.2.4 不同溫度對病原菌生長的影響
        3.2.5 不同鹽度對病原菌生長的影響
        3.2.6 病原菌的葡萄糖氧化發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
        3.2.7 病原菌的糖、醇類發(fā)酵實(shí)驗(yàn)
    3.3 NY01 菌株的全基因組測序及分析
        3.3.1 DNA質(zhì)量檢測
        3.3.2 數(shù)據(jù)過濾統(tǒng)計(jì)
        3.3.3 基因組組裝和預(yù)測
        3.3.4 公共數(shù)據(jù)庫基因注釋
        3.3.5 專有數(shù)據(jù)庫分析
4 結(jié)論與討論
    4.1 主要研究結(jié)果
    4.2 討論
    4.3 有待進(jìn)一步研究的問題
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
附錄 4
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]DNA的測序技術(shù)及應(yīng)用[J]. 馬云聰.  現(xiàn)代醫(yī)學(xué)與健康研究電子雜志. 2018(09)
[2]全基因組測序在結(jié)核病研究中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳昕昶,張文宏.  中國防癆雜志. 2018 (02)
[3]植物病原細(xì)菌分類最新進(jìn)展[J]. 馮潔.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[4]新疆楊樹葉紋斑病病原菌分離及致病性測定[J]. 張金萍,蔣萍.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(01)
[5]煙草青枯病拮抗菌的篩選及發(fā)酵條件試驗(yàn)[J]. 許大鳳,倪海軍,季學(xué)軍,李田,高正良,王芳,周本國.  煙草科技. 2016(03)
[6]DNA測序技術(shù)方法研究及其進(jìn)展[J]. 謝浩,趙明,胡志迪,王大巾,孟旭莉,丁先鋒.  生命的化學(xué). 2015(06)
[7]植物病原細(xì)菌DNA條形碼檢測技術(shù)[J]. 田茜,張美,胡潔,趙文軍.  植物檢疫. 2014(06)
[8]廣西杧果主要病蟲害及其防治[J]. 梁清志,文定清,劉麗琴.  中國南方果樹. 2014(05)
[9]淺談進(jìn)境原木分類的鑒定方法[J]. 陳瑩,靳帥,李瑞法,范光輝,柳之光.  綠色科技. 2014(07)
[10]芒果采后病害生物防治研究進(jìn)展[J]. 黃建新.  南方農(nóng)業(yè). 2014(03)

博士論文
[1]優(yōu)良植物根際促生菌Bacillus mycoides Gnyt1特性研究及全基因組測序分析[D]. 李建宏.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]枯草芽孢桿菌Na-002納豆激酶基因的克隆、表達(dá)及定點(diǎn)突變研究[D]. 周波.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011

碩士論文
[1]雷州半島桐花樹病害病原菌分離鑒定[D]. 孫興濤.廣東海洋大學(xué) 2017
[2]杧果葉片響應(yīng)細(xì)菌性角斑病菌差異蛋白的篩選[D]. 朱飛冀.海南大學(xué) 2017
[3]一株羊源腸外致病性大腸桿菌的分離鑒定及全基因組測序分析[D]. 閆展燕.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]伯克氏菌屬植物病原菌DNA條形碼檢測技術(shù)研究[D]. 張琦夢.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]姜氏菌屬菌株全基因組測序及比較基因組學(xué)分析[D]. 焦建宇.昆明理工大學(xué) 2016
[6]2株溶血不動(dòng)桿菌全基因組測序及生物信息學(xué)分析[D]. 宋程程.天津大學(xué) 2016
[7]杧果細(xì)菌性角斑病菌致病因子研究[D]. 張大智.海南大學(xué) 2015
[8]芒果畸形病病原鑒定及致病機(jī)理初步研究[D]. 楊順錦.海南大學(xué) 2010
[9]一株中度嗜鹽菌的分離、鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 王柏玲.東北師范大學(xué) 2009



本文編號：3693988