NBS-LRR類基因家族是植物抗病R基因（Resistance gene）數(shù)量最多的一類,具有NBS （Nucleotide-binding site）和LRR （Leucine-leucine-repeat）結(jié)構(gòu)域。甘薯（Ipomoea batatas）栽培種基因組已完成測序,但尚未注釋,本研究對甘薯基因組序列進行外顯子預測,得到甘薯染色體組全基因組蛋白序列,在此基礎(chǔ)上進一步對NBS-LRR家族基因鑒定和分析表明,甘薯基因組中含有379個NBS-LRR家族基因,占全基因組基因總數(shù)的0.212%,其中N型亞家族120個,NL型103個, CNL型133個, TNL型22個, PN型1個。所有染色體上均有NBS-LRR家族基因分布,但數(shù)量明顯不同,其中有60.9%的NBS-LRR基因序列呈簇狀分布。NBS-LRR基因序列有15個保守結(jié)構(gòu)域,在N端較為保守。研究結(jié)果為甘薯進一步開展NBS-LRR家族基因的功能研究和抗性育種提供了參考。 

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 甘薯全基因組序列
    1.2 snap基因注釋
    1.3 含NB-ARC結(jié)構(gòu)域基因預測
    1.4 NBS關(guān)聯(lián)的保守結(jié)構(gòu)域分析分類
    1.5 甘薯NBS-LRR基因染色體定位
    1.6 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族motif分析
    1.7 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族進化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 甘薯基因組中含有NB-ARC結(jié)構(gòu)域的基因鑒別及其分類
    2.2 甘薯NBS-LRR家族基因在染色體上的分布
    2.3 甘薯NBS-LRR家族基因CNL、TNL亞家族motif分析
    2.4 CNL、TNL亞家族NB-ARC結(jié)構(gòu)域保守性分析
    2.5 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族系統(tǒng)進化樹分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3662485