NBS-LRR類(lèi)基因家族是植物抗病R基因（Resistance gene）數(shù)量最多的一類(lèi),具有NBS （Nucleotide-binding site）和LRR （Leucine-leucine-repeat）結(jié)構(gòu)域。甘薯（Ipomoea batatas）栽培種基因組已完成測(cè)序,但尚未注釋,本研究對(duì)甘薯基因組序列進(jìn)行外顯子預(yù)測(cè),得到甘薯染色體組全基因組蛋白序列,在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步對(duì)NBS-LRR家族基因鑒定和分析表明,甘薯基因組中含有379個(gè)NBS-LRR家族基因,占全基因組基因總數(shù)的0.212%,其中N型亞家族120個(gè),NL型103個(gè), CNL型133個(gè), TNL型22個(gè), PN型1個(gè)。所有染色體上均有NBS-LRR家族基因分布,但數(shù)量明顯不同,其中有60.9%的NBS-LRR基因序列呈簇狀分布。NBS-LRR基因序列有15個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,在N端較為保守。研究結(jié)果為甘薯進(jìn)一步開(kāi)展NBS-LRR家族基因的功能研究和抗性育種提供了參考。 

【文章頁(yè)數(shù)】：13 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 甘薯全基因組序列
    1.2 snap基因注釋
    1.3 含NB-ARC結(jié)構(gòu)域基因預(yù)測(cè)
    1.4 NBS關(guān)聯(lián)的保守結(jié)構(gòu)域分析分類(lèi)
    1.5 甘薯NBS-LRR基因染色體定位
    1.6 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族motif分析
    1.7 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 甘薯基因組中含有NB-ARC結(jié)構(gòu)域的基因鑒別及其分類(lèi)
    2.2 甘薯NBS-LRR家族基因在染色體上的分布
    2.3 甘薯NBS-LRR家族基因CNL、TNL亞家族motif分析
    2.4 CNL、TNL亞家族NB-ARC結(jié)構(gòu)域保守性分析
    2.5 甘薯CNL、TNL、RPW8亞家族系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]我國(guó)甘薯種植業(yè)發(fā)展?fàn)顩r調(diào)查報(bào)告（2017年）——基于國(guó)家甘薯產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟(jì)固定觀察點(diǎn)數(shù)據(jù)的分析[J]. 陸建珍,汪翔,秦建軍,戴起偉,易中懿.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(23)
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博士論文
[1]棉花抗黃萎病基因篩選及NBS-LRR類(lèi)抗病基因GbaNA1功能研究[D]. 李楠洋.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017



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