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馬鈴薯A病毒在云南省的發(fā)生及其P3蛋白序列分析

發(fā)布時間:2022-04-23 07:46
  【目的】了解馬鈴薯A病毒在云南省的發(fā)生分布情況,明確云南省分離物變異情況!痉椒ā坑肈AS-ELSIA的方法,檢測云南省19個種植馬鈴薯縣(市)的389個樣品;對5個地區(qū)的陽性樣品用RT-PCR擴(kuò)增馬鈴薯A病毒P3蛋白基因,克隆測序,使用DNAMAN及DNAStar等軟件分析序列,采用MEGA 6.0鄰接法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹!窘Y(jié)果】DAS-ELISA檢測389個樣品,PVA的檢出率為20.82%。用P3蛋白基因特異性引物從云南5個不同地區(qū)的PVA陽性樣品中擴(kuò)增得到1041bp的目的片段;比較分析了云南省5個地區(qū)馬鈴薯A病毒分離物之間,及與國內(nèi)外13個分離物的P3蛋白和PIPO蛋白同源性,發(fā)現(xiàn)云南省5個地區(qū)PVA分離物之間P3蛋白和PIPO蛋白氨基酸序列同源性分別為98.8%~99.7%和97.6%~100.0%;與國內(nèi)外13個分離物P3蛋白和PIPO蛋白的氨基酸序列同源性分別為90.8%~99.1%和90.5%~100.0%。系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,云南省5個分離物與湖南省分離物(KF977085)親緣關(guān)系最近;PVA馬鈴薯分離物和新西蘭樹番茄分離物之間... 

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 馬鈴薯病樣
        1.1.2 儀器與試劑
    1.2 方法
        1.2.1 ELISA檢測
        1.2.2 植物總RNA提取
        1.2.3 引物的設(shè)計與合成
        1.2.4 RT-PCR擴(kuò)增、克隆
        1.2.5 序列分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 ELISA檢測結(jié)果
    2.2 PVA P3蛋白基因RT-PCR擴(kuò)增、克隆、測序
    2.3 云南省不同地區(qū)PVA分離物之間P3及PIPO蛋白序列分析
    2.4 云南省和其他已報道的PVA分離物的P3蛋白及PIPO蛋白序列同源性分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于ROI快速檢測與融合特征的馬鈴薯病害識別[J]. 范振軍,李小霞.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(03)
[2]甘肅省馬鈴薯主要病毒病發(fā)生情況調(diào)查[J]. 齊恩芳,劉石,賈小霞,文國宏,呂和平,黃偉,高彥萍.  植物保護(hù). 2018(04)
[3]云南馬鈴薯A病毒分布及其外殼蛋白分子變異分析[J]. 王東,張磊,董家紅,張仲凱.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(02)
[4]馬鈴薯Y病毒屬病毒P3和P3-PiPo蛋白功能研究進(jìn)展[J]. 崔曉艷,陳新,顧和平,張紅梅,陳華濤,袁星星.  微生物學(xué)通報. 2012(01)
[5]馬鈴薯A病毒及其風(fēng)險分析[J]. 張洪峰,陳陽婷,孟興,譚家興,張敏,寧紅.  植物檢疫. 2010(04)

碩士論文
[1]呼和浩特周邊地區(qū)馬鈴薯病毒病的田間調(diào)查及分子鑒定[D]. 秦亞南.內(nèi)蒙古大學(xué) 2018
[2]重慶馬鈴薯病毒病病害調(diào)查及病原鑒定[D]. 吳畏.西南大學(xué) 2015
[3]馬鈴薯病毒快速檢測技術(shù)的建立與應(yīng)用[D]. 時妍.河南工業(yè)大學(xué) 2012
[4]烏魯木齊地區(qū)馬鈴薯病毒和類病毒的分子鑒定及檢測技術(shù)研究[D]. 董代幸.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號:3646867

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