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基于轉(zhuǎn)錄組水平的橡膠叢枝病發(fā)病機理研究

發(fā)布時間:2022-02-27 22:00
  巴西橡膠樹(Hevea brasiliensis(Willd.Ex A.Juss.)Muell.Arg)生產(chǎn)的天然橡膠是重要的工業(yè)原料和戰(zhàn)略物資。目前我國植膠面積超過1700萬畝,主要分布在云南、海南、廣東三省,年產(chǎn)超80萬噸,種植面積與產(chǎn)膠量均居世界第四位。橡膠樹褐皮病是世界植膠國家普遍發(fā)生的一種重要的割面病害。褐皮病危害引起的干膠損失平均超過10%,造成的經(jīng)濟損失極其巨大。橡膠樹叢枝病是由MLO和RLO混合侵染引起的一種傳染性病害,橡膠樹叢枝病的發(fā)生與橡膠樹褐皮病的發(fā)生有密切關(guān)系,增殖苗圃叢枝病芽條是大田褐皮病的重要初侵染來源之一。本研究以橡膠叢枝病枝條和健康枝條為材料,應用石蠟切片法對病健枝莖和葉片進行光學顯微鏡解剖學觀察對比其結(jié)構(gòu)差異,分析患病組織結(jié)構(gòu)變化與其外部形態(tài)的相關(guān)性;同時基于轉(zhuǎn)錄組測序比較患叢枝病橡膠與健康橡膠的基因差異,分析差異基因的生物學功能,挖掘影響橡膠樹叢枝病癥狀形成的關(guān)鍵調(diào)控基因,旨在以進一步從分子水平探索患病原因。在橡膠叢枝病轉(zhuǎn)錄組分析的基礎上,利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)初步探索橡膠叢枝病及印度紫檀叢枝病之間的相關(guān)性。研究結(jié)果如下:1、采用石蠟切片法進行的光學顯微... 

【文章來源】:海南大學海南省211工程院校

【文章頁數(shù)】:88 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1.前言
    1.1.橡膠產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況
        1.1.1.橡膠在全球的種植概況
        1.1.2.我國天然橡膠發(fā)展歷程
        1.1.3.海南橡膠產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況
    1.2.叢枝病研究概況
        1.2.1.植物感染叢枝病的癥狀表現(xiàn)
        1.2.2.橡膠叢枝病現(xiàn)象概況
        1.2.3.植物感染叢枝病的分子研究
    1.3.植原體研究概況
        1.3.1 植原體致病機理研究概況
        1.3.2.植原體侵染對寄主植物基因差異表達分子檢測技術(shù)的影響
    1.4.激素失調(diào)致病的研究概況
    1.5.石蠟切片在植物病害研究中的應用
    1.6.轉(zhuǎn)錄組應用概況
        1.6.1.轉(zhuǎn)錄組測序在植物脅迫研究中的應用
        1.6.2.轉(zhuǎn)錄組測序在植物抗病中的研究應用
    1.7.研究的目的和轉(zhuǎn)錄組技術(shù)路線
2.叢枝病橡膠和健康橡膠的解剖學觀察
    2.1.材料與方法
        2.1.1.海南橡膠叢枝現(xiàn)狀田間調(diào)研
        2.1.2.樣本采集與處理
        2.1.3.試驗方法
    2.2.結(jié)果與分析
        2.2.1.枝莖的組織結(jié)構(gòu)變化
        2.2.2.葉片的組織結(jié)構(gòu)變化
3.基于轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的橡膠叢枝病研究
    3.1.材料與方法
        3.1.1.樣本采集與處理
        3.1.2.RNA提取及質(zhì)量檢測
    3.2.轉(zhuǎn)錄組測序
        3.2.1.建庫測序
        3.2.2.信息分析流程
        3.2.3.實時熒光定量PCR驗證
    3.3.結(jié)果與分析
        3.3.1.RNA提取和質(zhì)量檢測
        3.3.2.數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果
        3.3.3.差異基因的篩選及分析
        3.3.4.GO功能富集分析
        3.3.5.KEGG通路富集分析
        3.3.6.橡膠叢枝病相關(guān)差異基因的代謝通路分析
        3.3.7.橡膠叢枝病差異顯著性表達基因
        3.3.8.熒光定量PCR驗證
4.基于轉(zhuǎn)錄組的橡膠叢枝病和印度紫檀叢枝病間的初步探索
    4.1.轉(zhuǎn)錄本拼接
    4.2.Unigene功能注釋結(jié)果與分析
        4.2.1.NR注釋
        4.2.2.GO功能注釋
        4.2.3.KOG功能注釋
        4.2.4.KEGG功能注釋
    4.3.代謝通路的表達分析
5.討論
    5.1.罹叢枝病植物與健康植物的外部形態(tài)差異
        5.1.1.患叢枝病橡膠與健康橡膠外部形態(tài)差異
        5.1.2.其它植物患叢枝病與健康外部形態(tài)差異
    5.2.患叢枝病橡膠與健康橡膠的解剖學差異
    5.3.激素信號轉(zhuǎn)導途徑影響橡膠患叢枝病
    5.4.關(guān)鍵基因代謝通路影響橡膠患叢枝病
    5.5.關(guān)鍵基因及表達模式影響橡膠患叢枝病
6.結(jié)論
參考文獻
附錄一 碩士期間發(fā)表的文章
附錄二 碩士期間參與的項目
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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[3]番茄斑萎病毒核衣殼蛋白胞內(nèi)運動和移動蛋白胞間運動機制研究[D]. 馮致科.南京農(nóng)業(yè)大學 2016
[4]類黃酮調(diào)控基因AtMYB12的異源表達及其對植物抗病性的貢獻[D]. 李明.山東農(nóng)業(yè)大學 2012
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碩士論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組測序的小麥抗稈銹病機制初步探究[D]. 廖凱.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]桑樹韌皮部汁液植原體響應基因的研究[D]. 袁傳忠.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]桑樹響應植原體侵染的新miRNAs的生物學功能研究[D]. 李軼群.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[4]枇杷果膠酯酶基因克隆及表達特性分析[D]. 唐佳佳.西南大學 2014
[5]棉花1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸合成酶(GhACS1)基因的克隆及功能分析[D]. 王霞.山東農(nóng)業(yè)大學 2008
[6]果梅完全花與不完全花相關(guān)性狀的差異及其蛋白質(zhì)組學的初步分析[D]. 王珊.南京農(nóng)業(yè)大學 2008



本文編號:3645364

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