湖北省煙草赤星病病原學(xué)及遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-02-18 18:01
煙草是湖北省重要的經(jīng)濟(jì)作物,種植煙草是煙農(nóng)脫貧致富的重要途徑之一。近幾年來,湖北省煙區(qū)煙草赤星病發(fā)生嚴(yán)重,降低了煙草品質(zhì)和產(chǎn)量,影響了煙草種植業(yè)的發(fā)展。本研究通過形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)方法對(duì)湖北省煙草赤星病的病原進(jìn)行鑒定,在此基礎(chǔ)上研究病原菌的生物學(xué)特性和遺傳多樣性,主要研究結(jié)果如下:從湖北省恩施、十堰、襄陽和宜昌4個(gè)產(chǎn)煙區(qū)煙草赤星病樣本上分離獲得72株鏈格孢菌,在致病性測(cè)定基礎(chǔ)上通過形態(tài)學(xué)和基于rDNA-ITS、Calmodulin和Plasma membraneATPase基因序列的分子輔助鑒定,證實(shí)引起湖北省煙草赤星病的病原菌為長柄鏈格孢(Alternaria longipes)、細(xì)極鏈格孢(Alternaria tenuissima)、鏈格孢(Alternaria alternata)和鴨梨鏈格孢(Alternaria yaliinficiens)。長柄鏈格孢和細(xì)極鏈格孢產(chǎn)孢鏈均為直鏈,少有分支,但長柄鏈格孢大部分孢子頂端常延伸成4070μm長的假喙,而細(xì)極鏈格孢成熟分生孢子孢身中部有顏色加深的橫隔膜,且隘縮更明顯;鏈格孢和鴨梨鏈格孢產(chǎn)孢鏈都有大量分支;但鏈格...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 煙草赤星病
1.1 煙草赤星病發(fā)生與危害
1.2 煙草赤星病流行因素
2 煙草赤星病病原的分類鑒定
2.1 煙草赤星病病原種類
2.2 鏈格孢菌的鑒定
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定
2.2.2 分子鑒定
3 煙草赤星病的生物學(xué)特性研究
3.1 煙草赤星病致病機(jī)理
3.1.1 致病相關(guān)毒素
3.1.2 致病相關(guān)酶類
3.2 煙草赤星病病原菌的致病力分化
3.3 不同溫濕度、pH對(duì)煙草赤星病菌生長的影響
3.4 不同氮源、碳源對(duì)煙草赤星病菌生長的影響
4 煙草赤星病菌的遺傳多樣性的分子標(biāo)記
4.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
4.2 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)
4.3 限制性擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)
4.4 簡單重復(fù)序列(SSR)
4.5 簡單重復(fù)序列區(qū)間(ISSR)
5 研究的目的和意義
第二章 湖北省烤煙煙草赤星病病原鑒定
1 材料和方法
1.1 病害樣來源
1.2 培養(yǎng)基及所用試劑
1.3 病原菌的單孢分離與保存
1.4 病原菌的致病性測(cè)定
1.5 病原菌的形態(tài)學(xué)鑒定
1.6 病原菌的分子鑒定
1.6.1 供試菌株
1.6.2 基因組DNA提取
1.6.3 PCR反應(yīng)體系
1.6.4 PCR引物序列以及反應(yīng)程序
1.6.5 PCR反應(yīng)檢測(cè)
1.6.6 PCR產(chǎn)物序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 湖北省煙草赤星病病原菌分離
2.2 致病性測(cè)定
2.3 病原菌的形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果
2.4 病原菌的分子鑒定
2.4.1 基于rDNA-ITS序列鑒定結(jié)果
2.4.2 基于Calmodulin序列鑒定結(jié)果
2.4.3 基于Plasma membrane ATPase序列鑒定結(jié)果
2.4.4 基于三個(gè)基因序列綜合鑒定結(jié)果
2.5 四種鏈格孢致病菌在湖北的地理分布
3 小結(jié)和討論
第三章 湖北省煙草赤星病菌生物學(xué)特性研究
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 供試植物
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 不同溫度條件對(duì)菌絲生長影響
1.2.2 不同pH值對(duì)菌絲生長的影響
1.2.3 不同碳源對(duì)菌絲生長影響
1.2.4 不同氮源對(duì)菌絲生長影響
1.2.5 不同種煙草赤星病病菌的致病力測(cè)定
1.2.6 不同溫度對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
1.2.7 不同保濕時(shí)間對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
1.2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果
2.1 不同溫度對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.2 不同pH值對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.3 不同碳源對(duì)4個(gè)種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.4 不同氮源對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.5 不同鏈格孢菌的致病力比較
2.6 不同溫度對(duì)長柄鏈格孢菌致病力的影響
2.7 不同保濕時(shí)間對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
3 小結(jié)和討論
第四章 湖北省煙草赤星病長柄鏈格孢遺傳多樣性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 試驗(yàn)儀器
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA提取及檢測(cè)
1.2.2 ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立
1.2.2.1 PCR反應(yīng)體系
1.2.2.2 ISSR-PCR擴(kuò)增程序
1.2.2.3 引物的篩選及退火溫度的確定
1.2.3 遺傳多樣性數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果
2.1 ISSR引物的篩選及退火溫度的確定
2.1.1 引物的初次篩選及最佳退火溫度的確定
2.1.2 引物的復(fù)篩
2.1.2.1 基因組DNA濃度及純度檢測(cè)
2.1.2.2 ISSR引物的復(fù)篩
2.2 長柄鏈格孢菌菌株的遺傳多樣性分析
2.2.1 長柄鏈格孢菌菌株的遺傳多態(tài)性
2.2.2 長柄鏈格孢不同地理來源菌株的遺傳多樣性
2.2.3 長柄鏈格孢不同地理種群的遺傳距離分析
2.2.4 煙草長柄鏈格孢菌(A.longipes)ISSR聚類分析結(jié)果
3 小結(jié)與討論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙草根黑腐病菌ISSR標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 竇彥霞,徐林,馬冠華,李六英,張世渠. 煙草科技. 2017(11)
[2]重慶巫溪煙區(qū)煙草赤星病病原鑒定[J]. 耿莉娜,帥紅,趙敏,江厚龍,李鈉鉀,夏茜,唐梅,陳益銀. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[3]玉米鏈格孢病菌生物學(xué)特性及防治藥劑離體活性篩選[J]. 王媛媛,劉彬,周園園,朱曉峰,高增貴,陳立杰. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[4]橡膠鏈格孢葉斑病病原菌生物學(xué)特性研究[J]. 劉一賢,石兆武,余守寬,王勇方,蔡志英,蔣桂芝,周明. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[5]貴州省煙草赤星病病原菌的鑒定[J]. 唐承成,曾琛,姜于蘭,楊波. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(15)
[6]鏈格孢屬小孢子種ISSR和RAPD-PCR最佳反應(yīng)體系的建立[J]. 劉振亞,熊仁次,朱天生. 北方園藝. 2015(14)
[7]利用ISSR-PCR技術(shù)分析香蕉枯萎病菌的遺傳多樣性[J]. 張賀,張欣,蒲金基,漆艷香,陸英,喻群芳,張輝強(qiáng),謝藝賢. 微生物學(xué)報(bào). 2015(06)
[8]煙草赤星病發(fā)生程度對(duì)煙葉產(chǎn)量及產(chǎn)值損失估測(cè)[J]. 華勁松,王強(qiáng). 技術(shù)與市場. 2014(02)
[9]河南省煙草赤星病病原鑒定[J]. 祖艷青,蔣士君,王海濤,孫淑君,張猛. 中國煙草學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]煙草赤星病菌遺傳多樣性的ISSR和RAPD標(biāo)記比較分析[J]. 胡中會(huì),趙立華,孔寶華,陳海如,范靜華,劉飛,李小鵬,蔡紅,楊根華,秦西云,方敦煌. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]鏈格孢屬真菌現(xiàn)代分類方法研究[D]. 孫霞.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]柑橘中5種鏈格孢霉毒素檢測(cè)技術(shù)及產(chǎn)生分布規(guī)律初探[D]. 蔣黎艷.西南大學(xué) 2016
[2]玉米絲黑穗病菌SSR分子標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用研究[D]. 王士臻.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]大櫻桃黑斑果腐病病原學(xué)及防治基礎(chǔ)研究[D]. 趙遠(yuǎn)征.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]棗果實(shí)病原真菌的鑒定及鏈格孢屬病原真菌多樣性研究[D]. 王葉.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]煙草赤星病對(duì)煙葉化學(xué)成分的影響及綜合防治試驗(yàn)研究[D]. 王建文.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]黑龍江省鏈格孢屬病原菌遺傳多樣性及殺菌劑抗藥性分析[D]. 姚亮亮.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]入侵植物紫莖澤蘭葉鏈格孢菌生物學(xué)多樣性研究[D]. 周振歆.云南大學(xué) 2010
[8]煙草赤星病菌角質(zhì)酶的純化、性質(zhì)及在致病中的作用研究[D]. 劉輝.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[9]重慶煙草赤星病菌的致病力分化及遺傳差異性研究[D]. 張世才.西南大學(xué) 2009
[10]大豆疫霉分子檢測(cè)及SSR標(biāo)記的開發(fā)[D]. 徐靜靜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
本文編號(hào):3631295
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 煙草赤星病
1.1 煙草赤星病發(fā)生與危害
1.2 煙草赤星病流行因素
2 煙草赤星病病原的分類鑒定
2.1 煙草赤星病病原種類
2.2 鏈格孢菌的鑒定
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定
2.2.2 分子鑒定
3 煙草赤星病的生物學(xué)特性研究
3.1 煙草赤星病致病機(jī)理
3.1.1 致病相關(guān)毒素
3.1.2 致病相關(guān)酶類
3.2 煙草赤星病病原菌的致病力分化
3.3 不同溫濕度、pH對(duì)煙草赤星病菌生長的影響
3.4 不同氮源、碳源對(duì)煙草赤星病菌生長的影響
4 煙草赤星病菌的遺傳多樣性的分子標(biāo)記
4.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
4.2 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)
4.3 限制性擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)
4.4 簡單重復(fù)序列(SSR)
4.5 簡單重復(fù)序列區(qū)間(ISSR)
5 研究的目的和意義
第二章 湖北省烤煙煙草赤星病病原鑒定
1 材料和方法
1.1 病害樣來源
1.2 培養(yǎng)基及所用試劑
1.3 病原菌的單孢分離與保存
1.4 病原菌的致病性測(cè)定
1.5 病原菌的形態(tài)學(xué)鑒定
1.6 病原菌的分子鑒定
1.6.1 供試菌株
1.6.2 基因組DNA提取
1.6.3 PCR反應(yīng)體系
1.6.4 PCR引物序列以及反應(yīng)程序
1.6.5 PCR反應(yīng)檢測(cè)
1.6.6 PCR產(chǎn)物序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 湖北省煙草赤星病病原菌分離
2.2 致病性測(cè)定
2.3 病原菌的形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果
2.4 病原菌的分子鑒定
2.4.1 基于rDNA-ITS序列鑒定結(jié)果
2.4.2 基于Calmodulin序列鑒定結(jié)果
2.4.3 基于Plasma membrane ATPase序列鑒定結(jié)果
2.4.4 基于三個(gè)基因序列綜合鑒定結(jié)果
2.5 四種鏈格孢致病菌在湖北的地理分布
3 小結(jié)和討論
第三章 湖北省煙草赤星病菌生物學(xué)特性研究
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 供試植物
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 不同溫度條件對(duì)菌絲生長影響
1.2.2 不同pH值對(duì)菌絲生長的影響
1.2.3 不同碳源對(duì)菌絲生長影響
1.2.4 不同氮源對(duì)菌絲生長影響
1.2.5 不同種煙草赤星病病菌的致病力測(cè)定
1.2.6 不同溫度對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
1.2.7 不同保濕時(shí)間對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
1.2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果
2.1 不同溫度對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.2 不同pH值對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.3 不同碳源對(duì)4個(gè)種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.4 不同氮源對(duì)4種鏈格孢菌菌絲生長的影響
2.5 不同鏈格孢菌的致病力比較
2.6 不同溫度對(duì)長柄鏈格孢菌致病力的影響
2.7 不同保濕時(shí)間對(duì)長柄鏈格孢致病力的影響
3 小結(jié)和討論
第四章 湖北省煙草赤星病長柄鏈格孢遺傳多樣性分析
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株
1.1.2 試驗(yàn)儀器
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA提取及檢測(cè)
1.2.2 ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立
1.2.2.1 PCR反應(yīng)體系
1.2.2.2 ISSR-PCR擴(kuò)增程序
1.2.2.3 引物的篩選及退火溫度的確定
1.2.3 遺傳多樣性數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果
2.1 ISSR引物的篩選及退火溫度的確定
2.1.1 引物的初次篩選及最佳退火溫度的確定
2.1.2 引物的復(fù)篩
2.1.2.1 基因組DNA濃度及純度檢測(cè)
2.1.2.2 ISSR引物的復(fù)篩
2.2 長柄鏈格孢菌菌株的遺傳多樣性分析
2.2.1 長柄鏈格孢菌菌株的遺傳多態(tài)性
2.2.2 長柄鏈格孢不同地理來源菌株的遺傳多樣性
2.2.3 長柄鏈格孢不同地理種群的遺傳距離分析
2.2.4 煙草長柄鏈格孢菌(A.longipes)ISSR聚類分析結(jié)果
3 小結(jié)與討論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙草根黑腐病菌ISSR標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 竇彥霞,徐林,馬冠華,李六英,張世渠. 煙草科技. 2017(11)
[2]重慶巫溪煙區(qū)煙草赤星病病原鑒定[J]. 耿莉娜,帥紅,趙敏,江厚龍,李鈉鉀,夏茜,唐梅,陳益銀. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(08)
[3]玉米鏈格孢病菌生物學(xué)特性及防治藥劑離體活性篩選[J]. 王媛媛,劉彬,周園園,朱曉峰,高增貴,陳立杰. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[4]橡膠鏈格孢葉斑病病原菌生物學(xué)特性研究[J]. 劉一賢,石兆武,余守寬,王勇方,蔡志英,蔣桂芝,周明. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[5]貴州省煙草赤星病病原菌的鑒定[J]. 唐承成,曾琛,姜于蘭,楊波. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(15)
[6]鏈格孢屬小孢子種ISSR和RAPD-PCR最佳反應(yīng)體系的建立[J]. 劉振亞,熊仁次,朱天生. 北方園藝. 2015(14)
[7]利用ISSR-PCR技術(shù)分析香蕉枯萎病菌的遺傳多樣性[J]. 張賀,張欣,蒲金基,漆艷香,陸英,喻群芳,張輝強(qiáng),謝藝賢. 微生物學(xué)報(bào). 2015(06)
[8]煙草赤星病發(fā)生程度對(duì)煙葉產(chǎn)量及產(chǎn)值損失估測(cè)[J]. 華勁松,王強(qiáng). 技術(shù)與市場. 2014(02)
[9]河南省煙草赤星病病原鑒定[J]. 祖艷青,蔣士君,王海濤,孫淑君,張猛. 中國煙草學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]煙草赤星病菌遺傳多樣性的ISSR和RAPD標(biāo)記比較分析[J]. 胡中會(huì),趙立華,孔寶華,陳海如,范靜華,劉飛,李小鵬,蔡紅,楊根華,秦西云,方敦煌. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]鏈格孢屬真菌現(xiàn)代分類方法研究[D]. 孫霞.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]柑橘中5種鏈格孢霉毒素檢測(cè)技術(shù)及產(chǎn)生分布規(guī)律初探[D]. 蔣黎艷.西南大學(xué) 2016
[2]玉米絲黑穗病菌SSR分子標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用研究[D]. 王士臻.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]大櫻桃黑斑果腐病病原學(xué)及防治基礎(chǔ)研究[D]. 趙遠(yuǎn)征.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]棗果實(shí)病原真菌的鑒定及鏈格孢屬病原真菌多樣性研究[D]. 王葉.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]煙草赤星病對(duì)煙葉化學(xué)成分的影響及綜合防治試驗(yàn)研究[D]. 王建文.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]黑龍江省鏈格孢屬病原菌遺傳多樣性及殺菌劑抗藥性分析[D]. 姚亮亮.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]入侵植物紫莖澤蘭葉鏈格孢菌生物學(xué)多樣性研究[D]. 周振歆.云南大學(xué) 2010
[8]煙草赤星病菌角質(zhì)酶的純化、性質(zhì)及在致病中的作用研究[D]. 劉輝.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[9]重慶煙草赤星病菌的致病力分化及遺傳差異性研究[D]. 張世才.西南大學(xué) 2009
[10]大豆疫霉分子檢測(cè)及SSR標(biāo)記的開發(fā)[D]. 徐靜靜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
本文編號(hào):3631295
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